摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
第一章 绪论 | 第12-22页 |
1.1 火石花概述 | 第12-13页 |
1.2 火草纺织技艺概述 | 第13-15页 |
1.3 转录组概述 | 第15-17页 |
1.4 纤维发育概述 | 第17-19页 |
1.5 研究内容 | 第19-20页 |
1.5.1 主要研究内容 | 第19页 |
1.5.2 拟解决的问题 | 第19页 |
1.5.3 技术路线图 | 第19-20页 |
1.6 研究意义 | 第20-22页 |
第二章 火石花叶片转录组学分析 | 第22-42页 |
2.1 材料与方法 | 第22-26页 |
2.1.1 材料 | 第22-23页 |
2.1.2 总RNA的提取及RNA浓度、完整性检测 | 第23-24页 |
2.1.3 cDNA文库构建及测序 | 第24页 |
2.1.4 数据的组装与文库的质量评估 | 第24-25页 |
2.1.5 功能注释 | 第25-26页 |
2.1.6 SSR分析 | 第26页 |
2.2 结果与分析 | 第26-38页 |
2.2.1 RNA浓度和完整性检测 | 第26-27页 |
2.2.2 测序结果和从头组装 | 第27-28页 |
2.2.3 文库质量评估 | 第28-30页 |
2.2.4 功能注释 | 第30-33页 |
2.2.5 功能分类 | 第33-36页 |
2.2.6 代谢通路分析 | 第36-37页 |
2.2.7 SSR分析 | 第37-38页 |
2.3 讨论 | 第38-42页 |
第三章 火石花差异表达基因分析 | 第42-64页 |
3.1 实验方法 | 第42-44页 |
3.1.1 基因表达量的估计 | 第42页 |
3.1.2 差异表达基因的筛选 | 第42页 |
3.1.3 差异表达基因的功能注释 | 第42页 |
3.1.4 关键差异表达基因分析 | 第42页 |
3.1.5 关键差异表达基因的Q-PCR验证 | 第42-44页 |
3.2 结果与分析 | 第44-60页 |
3.2.1 基因表达量总体分布 | 第44-46页 |
3.2.2 差异表达基因的筛选 | 第46页 |
3.2.3 差异表达基因的功能注释 | 第46-51页 |
3.2.4 淀粉和蔗糖代谢途径中关键差异表达基因分析 | 第51-53页 |
3.2.5 苯丙烷类生物合成途径中关键差异表达基因分析 | 第53-55页 |
3.2.6 植物激素信号转导途径中关键差异表达基因分析 | 第55-57页 |
3.2.7 关键差异表达基因的Q-PCR验证 | 第57-60页 |
3.3 讨论 | 第60-64页 |
3.3.1 淀粉和蔗糖代谢途径及苯丙烷类合成途径中的关键基因 | 第60页 |
3.3.2 植物激素信号转导途径中的关键基因 | 第60-61页 |
3.3.3 关键差异表达基因的Q-PCR验证 | 第61-64页 |
第四章 结论与展望 | 第64-68页 |
4.1 结论 | 第64-65页 |
4.1.1 火石花叶片转录组学分析 | 第64页 |
4.1.2 火石花差异表达基因分析 | 第64-65页 |
4.1.3 关键差异表达基因的Q-PCR验证 | 第65页 |
4.2 存在的不足 | 第65页 |
4.3 展望 | 第65-68页 |
致谢 | 第68-70页 |
参考文献 | 第70-78页 |
附录A 攻读硕士学位期间科研情况 | 第78-80页 |
附录B 附表 | 第80-82页 |
附录C 试验附图 | 第82页 |