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火石花高通量转录组测序及差异表达基因分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 绪论第12-22页
    1.1 火石花概述第12-13页
    1.2 火草纺织技艺概述第13-15页
    1.3 转录组概述第15-17页
    1.4 纤维发育概述第17-19页
    1.5 研究内容第19-20页
        1.5.1 主要研究内容第19页
        1.5.2 拟解决的问题第19页
        1.5.3 技术路线图第19-20页
    1.6 研究意义第20-22页
第二章 火石花叶片转录组学分析第22-42页
    2.1 材料与方法第22-26页
        2.1.1 材料第22-23页
        2.1.2 总RNA的提取及RNA浓度、完整性检测第23-24页
        2.1.3 cDNA文库构建及测序第24页
        2.1.4 数据的组装与文库的质量评估第24-25页
        2.1.5 功能注释第25-26页
        2.1.6 SSR分析第26页
    2.2 结果与分析第26-38页
        2.2.1 RNA浓度和完整性检测第26-27页
        2.2.2 测序结果和从头组装第27-28页
        2.2.3 文库质量评估第28-30页
        2.2.4 功能注释第30-33页
        2.2.5 功能分类第33-36页
        2.2.6 代谢通路分析第36-37页
        2.2.7 SSR分析第37-38页
    2.3 讨论第38-42页
第三章 火石花差异表达基因分析第42-64页
    3.1 实验方法第42-44页
        3.1.1 基因表达量的估计第42页
        3.1.2 差异表达基因的筛选第42页
        3.1.3 差异表达基因的功能注释第42页
        3.1.4 关键差异表达基因分析第42页
        3.1.5 关键差异表达基因的Q-PCR验证第42-44页
    3.2 结果与分析第44-60页
        3.2.1 基因表达量总体分布第44-46页
        3.2.2 差异表达基因的筛选第46页
        3.2.3 差异表达基因的功能注释第46-51页
        3.2.4 淀粉和蔗糖代谢途径中关键差异表达基因分析第51-53页
        3.2.5 苯丙烷类生物合成途径中关键差异表达基因分析第53-55页
        3.2.6 植物激素信号转导途径中关键差异表达基因分析第55-57页
        3.2.7 关键差异表达基因的Q-PCR验证第57-60页
    3.3 讨论第60-64页
        3.3.1 淀粉和蔗糖代谢途径及苯丙烷类合成途径中的关键基因第60页
        3.3.2 植物激素信号转导途径中的关键基因第60-61页
        3.3.3 关键差异表达基因的Q-PCR验证第61-64页
第四章 结论与展望第64-68页
    4.1 结论第64-65页
        4.1.1 火石花叶片转录组学分析第64页
        4.1.2 火石花差异表达基因分析第64-65页
        4.1.3 关键差异表达基因的Q-PCR验证第65页
    4.2 存在的不足第65页
    4.3 展望第65-68页
致谢第68-70页
参考文献第70-78页
附录A 攻读硕士学位期间科研情况第78-80页
附录B 附表第80-82页
附录C 试验附图第82页

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