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基于RNA-Seq技术对黄果柑平、凸蒂性状形成机理的初步探究

摘要第6-7页
ABSTRACT第7-8页
前言第9-10页
一、文献综述第10-15页
    1.1 ISSR分子标记技术研究进展第10-11页
        1.1.1 ISSR分子标记技术概述第10页
        1.1.2 ISSR在柑橘上的应用研究第10-11页
    1.2 细胞壁代谢相关基因研究进展第11-13页
    1.3 转录组学研究进展第13-14页
        1.3.1 RNA-Seq测序技术概述第13页
        1.3.2 RNA-Seq在柑橘上的研究应用第13-14页
    1.4 研究的目的与意义第14-15页
二、黄果柑ISSR分子标记第15-20页
    2.1 材料与方法第15-17页
        2.1.1 试验材料第15页
        2.1.2 试验方法第15-17页
    2.2 结果与分析第17-19页
        2.2.1 不同果蒂类型黄果柑成熟期果实品质分析第17-18页
        2.2.2 黄果柑总DNA质量检测第18-19页
        2.2.3 不同果蒂类型黄果柑ISSR分析电泳检测第19页
    2.3 讨论第19-20页
三、黄果柑XET基因克隆与生物信息学分析第20-31页
    3.1 材料与方法第20-23页
        3.1.1 试验材料第20-21页
        3.1.2 试验方法第21-23页
    3.2 结果与分析第23-30页
        3.2.1 黄果柑总RNA质量检测第23-24页
        3.2.2 黄果柑XET基因的获得第24-25页
        3.2.3 CitXET基因的序列分析第25页
        3.2.4 CitXET蛋白二级结构的分析第25-28页
        3.2.5 CitXET蛋白结构域及三维结构的分析第28-30页
        3.2.6 CitXET基因的表达量分析第30页
    3.3 讨论第30-31页
四、平、凸蒂型黄果柑RNA-Seq分析第31-44页
    4.1 材料与方法第31-36页
        4.1.1 试验材料第31-32页
        4.1.2 试验方法第32-36页
    4.2 结果与分析第36-43页
        4.2.1 黄果柑总RNA质量检测第36-37页
        4.2.2 转录组数据质量评估及过滤第37-38页
        4.2.3 与参考基因组比对第38页
        4.2.4 基因表达量分析第38-39页
        4.2.5 基因差异表达分析第39-40页
        4.2.6 差异表达基因GO富集分析第40-41页
        4.2.7 差异基因KEGG通路富集分析第41-43页
    4.3 讨论第43-44页
五、小结和展望第44-46页
    5.1 小结第44页
    5.2 创新点第44-45页
    5.3 展望第45-46页
参考文献第46-51页
附录第51-53页
    主要试剂配制第51-53页
硕士期间发表论文第53-54页
致谢第54页

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