| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 文献综述 | 第12-31页 |
| 1.1 小麦抗条锈病基因与分子标记的研究进展 | 第12-17页 |
| 1.1.1 小麦条锈病的危害 | 第12页 |
| 1.1.2 小麦抗条锈病基因的研究现状 | 第12-17页 |
| 1.2 小麦抗病基因的遗传研究方法与分子标记技术 | 第17-22页 |
| 1.2.1 小麦基因染色体定位的方法 | 第17-18页 |
| 1.2.2 分子标记方法介绍 | 第18-21页 |
| 1.2.3 遗传分析群体的构建 | 第21-22页 |
| 1.3 转录组测序技术与BSA-RNA-Seq方法 | 第22-26页 |
| 1.3.1 转录组测序技术 | 第22页 |
| 1.3.2 BSA-RNA-Seq方法 | 第22-23页 |
| 1.3.3 转录组数据的生物信息学分析 | 第23-26页 |
| 1.4 植物防御反应信号通路 | 第26-30页 |
| 1.4.1 植物防御反应信号通路 | 第27-28页 |
| 1.4.2 植物MYB转录因子的研究进展 | 第28-30页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第30-31页 |
| 技术流程 | 第31-32页 |
| 2 利用EST-STS引物对小麦抗条锈病基因Yr41的精细定位 | 第32-45页 |
| 2.1 材料与方法 | 第32-37页 |
| 2.1.1 试验材料与试剂 | 第32-33页 |
| 2.1.2 遗传连锁作图群体的构建与抗性鉴定 | 第33-34页 |
| 2.1.3 基因组总DNA的提取 | 第34页 |
| 2.1.4 基因组DNA的检测与定量 | 第34-35页 |
| 2.1.5 EST-STS分子标记的开发与筛选 | 第35-36页 |
| 2.1.6 利用与Yr41紧密连锁的EST序列开发新分子标记与筛选 | 第36-37页 |
| 2.2 结果与分析 | 第37-43页 |
| 2.2.1 遗传作图群体的构建与抗性遗传分析 | 第37页 |
| 2.2.2 遗传作图群体基因组DNA质量检测 | 第37-38页 |
| 2.2.3 EST-STS分子标记的筛选结果 | 第38-41页 |
| 2.2.4 连锁EST序列的基因注释信息 | 第41-42页 |
| 2.2.5 连锁EST序列比对与分子标记的开发和筛选结果 | 第42-43页 |
| 2.3 讨论 | 第43-45页 |
| 2.3.1 EST-STS分子标记对Yr41的精细定位 | 第43页 |
| 2.3.2 连锁EST-STS分子标记的生物信息学分析 | 第43-44页 |
| 2.3.3 利用比较基因组学的方法开发新的引物用于基因标记 | 第44-45页 |
| 3 BSA-RNA-Seq数据分析和SNP分子标记的开发与利用 | 第45-64页 |
| 3.1 材料与方法 | 第45-48页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第45页 |
| 3.1.2 样品总RNA的提取 | 第45-46页 |
| 3.1.3 转录组测序与数据分析 | 第46-47页 |
| 3.1.4 四引物扩增受阻突变体系引物设计与筛选 | 第47-48页 |
| 3.2 结果与分析 | 第48-62页 |
| 3.2.1 转录组测序数据统计 | 第48页 |
| 3.2.2 与参考基因组比对数据统计 | 第48-49页 |
| 3.2.3 基因结构分析 | 第49-50页 |
| 3.2.4 基因功能注释 | 第50页 |
| 3.2.5 基因差异表达分析 | 第50-58页 |
| 3.2.6 SNP位点关联定位与分子标记筛选 | 第58-62页 |
| 3.3 讨论 | 第62-64页 |
| 3.3.1 转录组数据的生物信息学分析 | 第62页 |
| 3.3.2 SNP分子标记的筛选 | 第62-64页 |
| 4 小麦条锈菌诱导表达基因TaLHY与TaNIT表达和功能分析 | 第64-75页 |
| 4.1 材料与方法 | 第64-68页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第64页 |
| 4.1.2 材料培养及处理 | 第64-65页 |
| 4.1.3 总RNA的提取及cDNA的合成 | 第65页 |
| 4.1.4 TaLHY的系统进化关系分析方法 | 第65页 |
| 4.1.5 Q-RT-PCR分析TaLHY基因的表达水平 | 第65-66页 |
| 4.1.6 构建目的基因的T克隆载体 | 第66页 |
| 4.1.7 病毒诱导基因沉默技术 | 第66-68页 |
| 4.2 结果与分析 | 第68-73页 |
| 4.2.1 TaLHY的系统进化关系分析 | 第68-69页 |
| 4.2.2 TaLHY的表达特性分析 | 第69-72页 |
| 4.2.3 病毒诱导TaLHY和TaNIT基因沉默研究 | 第72-73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-75页 |
| 5 全文总结 | 第75-77页 |
| 5.1 Yr41基因精细定位 | 第75页 |
| 5.2 抗病和感病小麦基因组的差别表达的生物信息学分析 | 第75-76页 |
| 5.3 TaLHY与TaNIT基因表达特性与功能分析 | 第76-77页 |
| 6 结论 | 第77-78页 |
| 附表 | 第78-95页 |
| 参考文献 | 第95-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 攻读博士期间发表论文 | 第106页 |
