| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-26页 |
| ·代谢工程 | 第10-16页 |
| ·代谢工程简介 | 第10-11页 |
| ·代谢工程定量分析方法 | 第11-13页 |
| ·通量平衡分析方法(FBA)的发展 | 第13-15页 |
| ·通量平衡分析软件的研究进展 | 第15-16页 |
| ·基因组尺度代谢网络 | 第16-21页 |
| ·基因组尺度代谢网络的构建 | 第17-19页 |
| ·基因组尺度代谢网络的应用 | 第19-20页 |
| ·克雷伯氏杆菌基因组尺度代谢网络研究进展 | 第20-21页 |
| ·克雷伯氏杆菌代谢甘油产1,3-丙二醇的研究进展 | 第21-24页 |
| ·发酵过程的研究 | 第22-23页 |
| ·菌种筛选的研究 | 第23页 |
| ·克雷伯氏杆菌产1,3-丙二醇代谢工程的研究进展 | 第23-24页 |
| ·本课题研究的目的、内容与意义 | 第24-26页 |
| ·本课题研究的目的与意义 | 第24-25页 |
| ·本课题研究的内容 | 第25-26页 |
| 2 基因组尺度克雷伯氏杆菌代谢甘油产1,3-丙二醇的路径分析 | 第26-44页 |
| ·引言 | 第26页 |
| ·模型与算法 | 第26-31页 |
| ·基因组尺度克雷伯氏杆菌的代谢网络的介绍 | 第27-30页 |
| ·通量平衡几何分析算法 | 第30-31页 |
| ·结果与讨论 | 第31-42页 |
| ·克雷伯氏杆菌杆菌代谢甘油产1,3-丙二醇的最大理论值 | 第31-34页 |
| ·比生长速率对1,3-丙二醇最大理论值的影响 | 第34-35页 |
| ·比生长速率对1,3-丙二醇最优路径的影响 | 第35-37页 |
| ·比生长速率对克雷伯氏杆菌代谢甘油反应个数的影响 | 第35-36页 |
| ·克雷伯氏杆菌代谢甘油最优路径的具体反应变化 | 第36-37页 |
| ·比生长速率对还原当量的影响 | 第37-41页 |
| ·比生长速率对还原当量NADH的影响 | 第37-39页 |
| ·比生长速率对还原当量NADPH的影响 | 第39-41页 |
| ·比生长速率对甘油和谷氨酸节点处各反应通量值的影响 | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-44页 |
| 3 克雷伯氏杆菌代谢甘油产1,3-丙二醇的路径冗余性分析 | 第44-56页 |
| ·引言 | 第44页 |
| ·算法与反应通量区间类型 | 第44-46页 |
| ·通量可变性分析的具体算法 | 第44-45页 |
| ·反应通量区间的类型 | 第45-46页 |
| ·结果与讨论 | 第46-54页 |
| ·克雷伯氏杆菌代谢甘油产1,3-丙二醇最优路径的冗余性分析 | 第46-47页 |
| ·1,3-丙二醇比生成速率对路径冗余性的影响 | 第47-50页 |
| ·不同1,3-丙二醇比生成速率下的最大产量 | 第50-51页 |
| ·比生长速率对1,3-丙二醇代谢路径冗余性的影响 | 第51-52页 |
| ·反应GLYK和GLYCDx通量值对代谢路径冗余性影响 | 第52-54页 |
| ·本章小结 | 第54-56页 |
| 4 克雷伯氏杆菌的代谢灵活性分析 | 第56-68页 |
| ·引言 | 第56页 |
| ·算法 | 第56-60页 |
| ·菌体代谢灵活性的计算 | 第56-57页 |
| ·有效反应的选择 | 第57-59页 |
| ·参照条件 | 第59-60页 |
| ·结果分析 | 第60-66页 |
| ·通量可变性的组成及计算 | 第60-61页 |
| ·底物吸收速率对通量可变性的影响 | 第61-63页 |
| ·碳氮利用率的调控对通量可变性的影响 | 第63-64页 |
| ·生长速率对通量可变性的影响 | 第64-66页 |
| ·本章小结 | 第66-68页 |
| 结论与展望 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 附录1 | 第76-78页 |
| 附录2 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第82-84页 |
