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红鳍笛鲷皮肤转录组分析及体色相关基因克隆、表达与进化研究

中文摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
第一章 前言第11-23页
   ·鱼类体色研究进展第11-18页
     ·鱼类体色形成的基础第11-13页
     ·体色的影响因素第13-15页
     ·鱼类体色基因研究进展第15-18页
   ·转录组学技术在鱼类体色研究中的应用第18-21页
     ·转录组学第18-20页
     ·转录组学在鱼类体色研究中的应用第20-21页
   ·笛鲷属鱼类研究进展第21-22页
   ·本研究的目的和意义第22-23页
第二章 红鳍笛鲷黑色与红色中色素细胞研究第23-35页
   ·材料与方法第23-26页
     ·实验材料第23页
     ·主要试剂及配方第23-24页
     ·主要仪器第24页
     ·实验方法第24-26页
   ·结果与分析第26-32页
     ·红鳍笛鲷不同发育时期色素分布观察第26-27页
     ·红鳍笛鲷皮肤色素细胞形态结构观察第27-30页
     ·红鳍笛鲷黑色皮肤部位色素细胞分布第30-32页
     ·红鳍笛鲷红色皮肤部位色素细胞分布第32页
   ·讨论第32-35页
第三章 基于高通量测序的红鳍笛鲷黑色和红色皮肤组织的转录组分析第35-62页
   ·实验材料与仪器第35-37页
     ·实验材料第35页
     ·主要药品、试剂和酶第35-36页
     ·主要仪器设备第36-37页
   ·实验方法第37-45页
     ·总RNA的提取及检测第37-38页
     ·cDNA文库的构建及转录组测序第38-40页
     ·测序数据的生物信息学分析第40-44页
     ·转录组测序结果的qPCR验证第44-45页
   ·结果与分析第45-56页
     ·测序数据的组装结果第45-47页
     ·组装数据的功能注释结果第47-51页
     ·红鳍笛鲷黑色和红色皮肤转录组中差异表达基因分析第51-55页
     ·实时荧光定量PCR验证第55-56页
   ·讨论第56-62页
     ·红鳍笛鲷皮肤转录组的测定及与其他物种皮肤转录组比较第56-58页
     ·红鳍笛鲷黑色和红色皮肤转录组中差异表达基因分析第58-59页
     ·红鳍笛鲷中体色相关基因的发掘与分析第59-62页
第四章 红鳍笛鲷Mitf基因的克隆、表达与进化分析第62-87页
   ·实验材料第62-66页
     ·动物及菌株第62页
     ·实验试剂第62-63页
     ·溶液、培养基及配制方法第63-64页
     ·实验仪器第64页
     ·实验用引物序列第64-66页
   ·实验方法第66-75页
     ·RNA的提取第66页
     ·PCR扩增目的基因片段第66-67页
     ·PCR 产物切胶回收第67页
     ·感受态细胞的制备第67-68页
     ·目的片段的连接反应第68页
     ·转化第68-69页
     ·菌液PCR鉴定阳性克隆及样品送测第69页
     ·RACE技术获得基因全长第69-72页
     ·基因序列的生物信息学分析第72-75页
   ·结果与分析第75-84页
     ·红鳍笛鲷MITF基因的克隆序列和进化关系分析第75-83页
     ·红鳍笛鲷mitf基因成鱼各组织及胚胎发育不同时期表达分析第83-84页
   ·讨论第84-87页
     ·红鳍笛鲷mitf基因序列分析第84-85页
     ·红鳍笛鲷mitf基因表达分析第85-87页
第五章 红鳍笛鲷酪氨酸酶基因家族基因的克隆、表达与进化分析第87-101页
   ·实验材料第87页
   ·实验方法第87-88页
   ·结果与分析第88-98页
     ·红鳍笛鲷酪氨酸酶基因家族基因的克隆序列和进化关系分析第88-97页
     ·红鳍笛鲷酪氨酸酶基因家族基因在成鱼各组织表达分析第97-98页
   ·讨论第98-101页
     ·红鳍笛鲷酪氨酸酶基因家族基因的克隆和序列特征和进化关系分析第98-99页
     ·红鳍笛鲷酪氨酸酶基因家族在红鳍笛鲷各组织的表达分析第99-101页
第六章 结论与展望第101-103页
附录 1第103-106页
附录 2第106-107页
参考文献第107-123页
博士学习期间撰写、发表的主要论文第123-124页
致谢第124-126页

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