| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-36页 |
| ·前言 | 第9-10页 |
| ·亲和色谱和亲和配基 | 第10-12页 |
| ·亲和配基的筛选技术 | 第12-15页 |
| ·组合化学合成肽库筛选 | 第12-13页 |
| ·噬菌体展示肽库筛选 | 第13-14页 |
| ·核糖体展示肽库筛选 | 第14-15页 |
| ·计算机辅助设计亲和配基 | 第15-29页 |
| ·药效团模型 | 第16-19页 |
| ·分子对接 | 第19-22页 |
| ·分子动力学和自由能计算 | 第22-26页 |
| ·从头设计 | 第26-29页 |
| ·亲和配基的理性设计策略 | 第29-31页 |
| ·亲和色谱法纯化抗体 | 第31-34页 |
| ·抗体的结构，来源和重要意义 | 第31-32页 |
| ·常见的抗体亲和配基 | 第32页 |
| ·新型抗体亲和配基 | 第32-34页 |
| ·本文的研究目的和内容 | 第34-36页 |
| 第二章 亲和肽配基高通量筛选方法的建立和色谱表征 | 第36-51页 |
| ·前言 | 第36-37页 |
| ·实验材料与方法 | 第37-41页 |
| ·分子模拟部分 | 第37-38页 |
| ·实验部分 | 第38-41页 |
| ·结果与讨论 | 第41-50页 |
| ·分子对接初筛多肽 | 第41-42页 |
| ·IgG 亲和介质的合成 | 第42-44页 |
| ·IgG 亲和色谱复筛多肽 | 第44-47页 |
| ·亲和肽配基EFYDD 的亲和色谱表征 | 第47-50页 |
| ·小结 | 第50-51页 |
| 第三章 蛋白A 与免疫球蛋白亲和作用的分子机理解析 | 第51-69页 |
| ·前言 | 第51-52页 |
| ·模型和方法 | 第52-54页 |
| ·模拟体系 | 第52-53页 |
| ·分子动力学模拟 | 第53页 |
| ·结合自由能计算 | 第53-54页 |
| ·自由能分解 | 第54页 |
| ·结果和讨论 | 第54-68页 |
| ·三个SpA-Ig 复合物的结合自由能计算 | 第54-57页 |
| ·SpA-hIgG1 复合物中SpA 的自由能分解 | 第57-59页 |
| ·SpA-hIgG1 复合物中hIgG1 的自由能分解 | 第59-60页 |
| ·SpA-hIgG1 复合物的残基作用对分析 | 第60-62页 |
| ·SpA-hIgG1 复合物的热点残基 | 第62-64页 |
| ·SpA 选择性的分子机理 | 第64-67页 |
| ·SpA 的亲和结合模型 | 第67-68页 |
| ·小结 | 第68-69页 |
| 第四章 盐和pH 对蛋白A 与人免疫球蛋白G1 亲和作用影响：分子动力学模拟 | 第69-85页 |
| ·前言 | 第69页 |
| ·模型和方法 | 第69-71页 |
| ·模拟体系 | 第69-70页 |
| ·分子动力学模拟 | 第70-71页 |
| ·结合自由能计算 | 第71页 |
| ·自由能分解 | 第71页 |
| ·结果和讨论 | 第71-84页 |
| ·盐对SpA-hIgG1 复合物的影响 | 第72-76页 |
| ·0.5 M NaCl 溶液对SpA 热点残基的影响 | 第76-77页 |
| ·1.0 M NaCl 溶液对SpA 的热点残基的影响 | 第77-79页 |
| ·2.0 M NaCl 溶液对SpA 的热点残基的影响 | 第79-80页 |
| ·pH 对SpA-hIgG1 复合物的影响 | 第80-84页 |
| ·SpA 亲和结合模型的改进 | 第84页 |
| ·小结 | 第84-85页 |
| 第五章 粗粒化分子动力学模拟研究蛋白A-免疫球蛋白G 复合物的结合和解离 | 第85-99页 |
| ·前言 | 第85页 |
| ·模型和方法 | 第85-87页 |
| ·模拟体系 | 第85-86页 |
| ·粗粒化分子动力学模拟 | 第86-87页 |
| ·结果和讨论 | 第87-98页 |
| ·CG-MD 研究SpA-hIgG1 复合物的可行性 | 第87-88页 |
| ·SpA-hIgG1 复合物的结合 | 第88-93页 |
| ·SpA-hIgG1 复合物的解离 | 第93-98页 |
| ·小结 | 第98-99页 |
| 第六章 蛋白A 仿生亲和肽配基的理性设计和色谱表征 | 第99-115页 |
| ·前言 | 第99页 |
| ·实验材料与方法 | 第99-102页 |
| ·分子模拟部分 | 第99-100页 |
| ·实验部分 | 第100-102页 |
| ·结果与讨论 | 第102-114页 |
| ·亲和肽配基的理性设计策略 | 第102-103页 |
| ·多肽库的构建 | 第103-104页 |
| ·分子对接初筛多肽 | 第104-105页 |
| ·粗粒化分子动力学复筛多肽 | 第105-107页 |
| ·亲和色谱实验筛选多肽 | 第107-113页 |
| ·亲和肽配基的理性设计方法的评估 | 第113-114页 |
| ·小结 | 第114-115页 |
| 第七章 总结与展望 | 第115-118页 |
| ·本文总结 | 第115-116页 |
| ·创新点 | 第116-117页 |
| ·建议与展望 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-131页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第131-132页 |
| 致谢 | 第132页 |
