| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-10页 |
| ·系统生物学 | 第8-9页 |
| ·研究目的和意义 | 第9页 |
| ·章节概要 | 第9-10页 |
| 第二章 生化反应随机动力学 | 第10-25页 |
| ·生化反应系统的数学模型 | 第10-12页 |
| ·生化反应系统中随机模拟算法 | 第12-16页 |
| ·精确随机模拟算法 | 第12-14页 |
| ·加速随机模拟算法 | 第14-16页 |
| ·加速RRA的随机模拟算法 | 第16-18页 |
| ·RRA算法 | 第16-17页 |
| ·FAPS RRA算法 | 第17-18页 |
| ·数值模拟 | 第18-25页 |
| 第三章 时滞生化应系统的DRRA算法 | 第25-33页 |
| ·时滞生化反应的随机动力学 | 第25-27页 |
| ·时滞生化反应系统的DSSA算法 | 第27-29页 |
| ·时滞生化反应系统的DRRA算法 | 第29-30页 |
| ·数值模拟 | 第30-33页 |
| 第四章 时滞生化反应系统中的DFAPS-leaping算法 | 第33-43页 |
| ·时滞生化反应系统中的DFAPS算法 | 第33-34页 |
| ·时滞生化反应系统中的D-leaping算法 | 第34-36页 |
| ·时滞生化反应系统中的DFAPS-leaping算法 | 第36-38页 |
| ·数值模拟 | 第38-43页 |
| 第五章 总结 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 附录：攻读学位期间参与的科研项目与公开发表的论文 | 第49页 |