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基于高通量DNA芯片合成、测序技术的抗体亲和力成熟研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第一章 绪论第12-76页
   ·ErbB家族蛋白成员的生物学功能第12-23页
     ·ErbB2及ErbB家族概述第12-14页
     ·ErbB受体家族二聚化和活化第14-16页
     ·ErbB家族受体介导的信号转导第16-19页
     ·ErbB家族受体循环第19-21页
  参考文献第21-23页
   ·ErbB2过表达导致肿瘤发生的分子学机制第23-32页
     ·ErbB家族蛋白过表达与肿瘤发生第23-25页
     ·ErbB2过表达引起受体异常活化和信号转导第25页
     ·ErbB2过表达影响细胞周期调控第25-26页
     ·ErbB2过表达和细胞凋亡第26页
     ·ErbB2受体胞外区切割及持续活化第26-27页
     ·ErbB2过表达和ErbB家族受体循环特性的改变第27页
     ·ErbB2过表达促进肿瘤的浸润和迁移第27-29页
  参考文献第29-32页
   ·针对ErbB家族的肿瘤治疗和抗ErbB2抗体药物的开发第32-43页
     ·抗ErbB2抗体研究进展及其在肿瘤诊断和治疗中的应用第32-34页
     ·抗ErbB2抗体的作用机理和生物学活性第34-35页
     ·抗ErbB2抗体的肿瘤抑制活性与受体内吞和下调的关系第35-36页
     ·本实验室制备的抑制型抗ErbB2抗体A21第36-38页
  参考文献第38-43页
   ·常见抗体展示系统概要第43-56页
     ·噬菌体展示系统第44-47页
     ·核糖体及mRNA展示系统第47-49页
     ·酵母展示系统第49-50页
     ·哺乳细胞表面展示系统第50-51页
     ·其他展示系统第51-52页
  参考文献第52-56页
   ·抗体库的构建和亲和力成熟策略第56-64页
     ·工程抗体的多种形式第56-57页
     ·抗体库和抗体亲和力成熟第57-58页
     ·抗体亲和力成熟突变策略第58-59页
     ·突变噬菌体抗体库的筛选和洗脱策略第59-61页
  参考文献第61-64页
   ·高通量合成和测序概要第64-76页
     ·合成生物学和新一代合成技术第64-66页
     ·高通量测序技术概要第66-73页
  参考文献第73-76页
第二章 实验材料和方法第76-92页
   ·实验材料,仪器和试剂第76页
   ·实验方法第76-92页
     ·A21突变位点的选择和设计第76-77页
     ·6个CDR区突变序列的高通量合成和PCR扩增第77页
     ·6个CDR区突变抗体库的构建第77-78页
     ·XL10超级感受态的制备和突变库的转化第78页
     ·突变库噬菌体库的制备第78-79页
     ·噬菌体的滴度测定第79-80页
     ·P185真核抗原的制备第80-82页
     ·P185原核抗原的制备第82页
     ·突变噬菌体库的液相筛选第82-83页
     ·突变噬菌体库的固相筛选第83页
     ·筛选到的阳性克隆的检测(screening)第83-85页
     ·HB2151表达可溶性抗体和周质腔抽提第85页
     ·Western-blotting比较表达量和ELISA判定相对亲和力第85-86页
     ·SPR测定各突变体周质腔提取物的相对亲和力第86页
     ·亚克隆突变体,真核表达,测定相对亲和力第86-88页
     ·突变体真核表达产物的纯化和亲和力测定第88页
     ·丙氨酸扫描(alaning scanning)分析抗体上结合表位的重要残基第88-89页
     ·真核细胞表面展示(mammalian cell display)第89-92页
第三章 实验结果第92-126页
   ·前期研究背景及噬菌体系统第92-93页
   ·丙氨酸扫描决定优先突变的抗体关键残基第93-94页
   ·传统法构建突变库的条件优化和载体酶切位点的改造第94-96页
   ·基于生物信息学和高通量技术的新噬菌体库的构建第96-100页
     ·基于信息学的突变库的设计第96-98页
     ·CDRs突变序列的高通量芯片合成第98-99页
     ·芯片合成的CDRs突变序列的扩增和突变库的构建第99-100页
   ·A21CDR区突变单链抗体库的构建和质量控制第100-102页
   ·噬菌体突变库筛选条件的研究第102-104页
     ·固相法筛选第102-103页
     ·液相法筛选第103-104页
   ·6个CDR区突变噬菌体库的筛选结果第104-106页
   ·对筛选到的阳性克隆的相对亲和力测定第106-108页
   ·各CDR区突变库阳性克隆的序列分析第108-110页
   ·五个CDR区组合库的设计和构建第110-112页
   ·组合噬菌体库的多轮筛选和突变体相对亲和力测定第112-116页
   ·SPR测定野生型单链抗体以及突变体C2C10B亲和力第116-117页
   ·含VH CDR3的组合突变库的构建和高通量测序分析第117-119页
   ·哺乳动物细胞表面展示条件的初步摸索第119-121页
   ·筛选和检测用抗原的制备第121-126页
第四章 讨论第126-135页
   ·传统噬菌体展示技术和建库新策略的比较第126-127页
   ·高通量测序和筛选突变序列的分析第127-129页
   ·对组合库的三轮筛选所得结果的分析第129-131页
   ·噬菌体库筛选条件的比较第131-133页
     ·固相筛选和洗脱条件第131-132页
     ·液相筛选和洗脱条件第132-133页
   ·快速比较突变克隆亲和力高低的方法摸索第133-135页
参考文献第135-138页
附录第138-142页
致谢第142-144页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第144页

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