| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 1 绪论 | 第10-24页 |
| ·转录组学概述 | 第10页 |
| ·新一代高通量测序技术 | 第10-13页 |
| ·高通量转录组测序 | 第13-16页 |
| ·有参考基因组的植物转录组测序 | 第14-15页 |
| ·无参考基因组的植物转录组测序 | 第15-16页 |
| ·辽宁碱蓬 | 第16-21页 |
| ·辽宁碱蓬的形态特征 | 第16-17页 |
| ·碱蓬的研究价值及发展前景 | 第17-19页 |
| ·碱蓬的耐盐机制研究 | 第19-21页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第21-23页 |
| ·本研究的技术路线 | 第23-24页 |
| 2 辽宁碱蓬转录组测序 | 第24-37页 |
| ·实验材料 | 第24-25页 |
| ·植物材料 | 第24页 |
| ·实验试剂 | 第24页 |
| ·实验仪器 | 第24-25页 |
| ·实验方法 | 第25-30页 |
| ·辽宁碱蓬总 RNA 样品的制备 | 第25-26页 |
| ·测序文库的构建 | 第26-28页 |
| ·上机测序 | 第28页 |
| ·序列组装与功能注释 | 第28-29页 |
| ·用 RPKM 法计算基因表达丰度 | 第29-30页 |
| ·实验结果 | 第30-36页 |
| ·RNA 样品制备的质量检测 | 第30-31页 |
| ·测序文库制备 | 第31页 |
| ·序列组装及功能注释 | 第31-33页 |
| ·转录组中各基因表达丰度(RPKM) | 第33-36页 |
| ·讨论 | 第36页 |
| ·RNA 样品质量 | 第36页 |
| ·测序产量及组装情况 | 第36页 |
| ·unigene 功能注释 | 第36页 |
| ·小结 | 第36-37页 |
| 3 辽宁碱蓬转录组数据分析 | 第37-51页 |
| ·分析方法 | 第37-38页 |
| ·unigene 的 GO 分类 | 第37页 |
| ·unigene 的 KOG 分类 | 第37-38页 |
| ·KEGG 代谢通路分析 | 第38页 |
| ·分析结果 | 第38-49页 |
| ·unigene 的 GO 分类 | 第38页 |
| ·unigene 的 KOG 分类 | 第38-41页 |
| ·KEGG 代谢通路分析 | 第41-47页 |
| ·辽宁碱蓬转录组中的抗盐相关基因 | 第47-49页 |
| ·讨论 | 第49-50页 |
| ·小结 | 第50-51页 |
| 4 辽宁碱蓬 SlActin 基因片段的获得及序列分析 | 第51-61页 |
| ·实验材料 | 第51-52页 |
| ·实验对象 | 第51页 |
| ·实验试剂 | 第51页 |
| ·实验仪器 | 第51-52页 |
| ·实验方法 | 第52-55页 |
| ·RNA 提取及反转录 | 第52-53页 |
| ·引物设计及 PCR 扩增 | 第53-54页 |
| ·目的片段的回收及测序 | 第54-55页 |
| ·序列分析 | 第55页 |
| ·实验结果 | 第55-60页 |
| ·RNA 提取及反转录 | 第55页 |
| ·引物设计及 PCR 扩增 | 第55-56页 |
| ·目的片段的回收及测序 | 第56-57页 |
| ·序列分析 | 第57-60页 |
| ·小结 | 第60-61页 |
| 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-66页 |
| 附录 A 辽宁碱蓬转录组的 unigene KEGG 代谢途径分类 | 第66-74页 |
| 附录 B DL2000 DNA Marker | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75页 |