| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略语 | 第10-12页 |
| 前言 | 第12-24页 |
| 1. 噬菌体 | 第12-15页 |
| 2. 鼠疫耶尔森氏菌 | 第15-16页 |
| 3. 鼠疫菌噬菌体 | 第16-21页 |
| 4. 鼠疫菌噬菌体受体研究 | 第21-22页 |
| 5. 本研究的目的与主要内容 | 第22-24页 |
| 第一章 鼠疫菌噬菌体 Yep-phi 全基因组测序 | 第24-52页 |
| 1. 前言 | 第24-25页 |
| 2. 材料与方法 | 第25-34页 |
| ·菌株 | 第25页 |
| ·酶和试剂盒 | 第25页 |
| ·噬菌体的铺平板培养 | 第25-26页 |
| ·通过平板裂解和洗脱制备噬菌体原种 | 第26-27页 |
| ·噬菌体大规模培养（高复数感染法） | 第27页 |
| ·噬菌体纯化 | 第27-28页 |
| ·电镜观察噬菌体形态 | 第28页 |
| ·噬菌体 DNA 提取 | 第28-29页 |
| ·噬菌体 DNA 鸟枪法测序 | 第29-30页 |
| ·噬菌体基因组一般特性分析 | 第30页 |
| ·基因预测及功能注释 | 第30页 |
| ·噬菌体 DNA 结构鉴定 | 第30-31页 |
| ·噬菌体 DNA 末端重复序列鉴定 | 第31-32页 |
| ·噬菌体对假结核菌的裂解情况 | 第32-33页 |
| ·蛋白质组学分析 | 第33页 |
| ·比较基因组学分析 | 第33-34页 |
| 3. 结果与讨论 | 第34-51页 |
| ·噬菌斑形态 | 第34页 |
| ·噬菌体形态 | 第34-35页 |
| ·噬菌体 DNA 提取 | 第35页 |
| ·噬菌体基因组特征 | 第35-36页 |
| ·基因预测及功能注释 | 第36-44页 |
| ·基因组结构鉴定 | 第44页 |
| ·末端鉴定 | 第44页 |
| ·对假结核菌的裂解 | 第44-47页 |
| ·蛋白质组学 | 第47-48页 |
| ·比较基因组学分析 | 第48-50页 |
| ·对 Yep-phi 亚群的重组分析 | 第50-51页 |
| 4.小结 | 第51-52页 |
| 第二章 鼠疫菌噬菌体 Yep-phi 受体鉴定 | 第52-94页 |
| 1. 前言 | 第52-54页 |
| 2. 材料与方法 | 第54-72页 |
| ·菌株与质粒 | 第54页 |
| ·主要试剂 | 第54页 |
| ·主要仪器 | 第54页 |
| ·蛋白表达与纯化 | 第54-57页 |
| ·多克隆抗体制备 | 第57-58页 |
| ·尾丝蛋白与噬菌体竞争吸附鼠疫菌实验 | 第58页 |
| ·尾丝蛋白抗体阻断噬菌体吸附实验 | 第58-59页 |
| ·受体性质鉴定 | 第59页 |
| ·蛋白类受体鉴定 | 第59-60页 |
| ·突变株的构建 | 第60-64页 |
| ·回补株的构建 | 第64-66页 |
| ·突变株与回补株的吸附效率评价 | 第66-67页 |
| ·突变株与回补株的裂解效率评价 | 第67页 |
| ·蛋白质相互作用的 Western Blotting 验证 | 第67-68页 |
| ·尾丝蛋白截短体构建、表达与纯化 | 第68-72页 |
| 3. 结果与讨论 | 第72-92页 |
| ·尾丝蛋白氨基酸序列比对 | 第72-74页 |
| ·尾丝蛋白表达与纯化 | 第74-75页 |
| ·尾丝蛋白与噬菌体竞争吸附鼠疫菌 | 第75-76页 |
| ·尾丝蛋白抗体阻断噬菌体 | 第76页 |
| ·噬菌体受体性质 | 第76-77页 |
| ·蛋白类受体鉴定 | 第77-80页 |
| ·外膜蛋白表达与纯化 | 第80页 |
| ·突变株与回补株的构建 | 第80-83页 |
| ·噬菌体吸附效率评价和裂解效率评价 | 第83-85页 |
| ·相互作用验证与关键氨基酸位点鉴定 | 第85-92页 |
| 4. 小结 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-100页 |
| 综述 | 第100-104页 |
| 参考文献 | 第103-104页 |
| 代表性论文 | 第104-110页 |
| 附录 | 第110-115页 |
| 主要仪器 | 第110-112页 |
| 常用试剂 | 第112-115页 |
| 攻读博士学位期间发表的综述和研究论文 | 第115-117页 |
| 个人简历 | 第117-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |