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酵母线粒体β-酮酰-ACP还原酶的结构生物学研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
第一篇 酿酒酵母线粒体β-酮酰-ACP还原酶(YmtOAR1)结构与功能研究第11-96页
 第1章 绪论(研究背景综述)第11-29页
     ·脂肪酸合成体系概述第11-12页
     ·Ⅰ型脂肪酸合成酶体系:庞大的多酶复合体第12-17页
     ·Ⅱ型脂肪酸合成酶体系:独立分散的单功能酶合成体系第17-19页
     ·线粒体中的脂肪酸合成体系第19-21页
     ·线粒体脂肪酸合成途径与tRNA加工第21-23页
     ·酵母线粒体脂肪酸合成途径的研究进展第23-29页
 第2章 实验材料与结果第29-51页
     ·酵母线粒体β-酮酰-ACP还原酶(YmtOAR1)重组表达及其突变体载体的构建第29-30页
     ·YmtOAR1重组蛋白及其突变体的表达纯化第30-31页
     ·YmtOAR1蛋白结晶及与辅酶NADPH共晶条件的筛选与优化第31-33页
     ·YmtOAR1蛋白晶体和YmtOAR1-NADPH复合物晶体X-射线衍射数据收集第33-36页
     ·晶体衍射数据处理第36-38页
     ·衍射数据的相位确定,结构解析和模型修正第38-41页
     ·晶体结构模型质量验证第41-49页
       ·YmtOAR1蛋白三套结构模型的电子密度云吻合情况第41-42页
       ·YmtOAR1三套结构模型温度因子分布情况第42-45页
       ·YmtOAR1三套结构模型的立体化学参数分析第45-48页
       ·结构模型原子间的范德华接触第48-49页
     ·YmtOARl及其突变体与辅酶NADPH结合实验第49页
     ·YmtOARl及其突变体的酶活测定第49-50页
     ·YmtOARl及其突变体的圆二色光谱测定第50-51页
 第3章 YmtOAR1晶体结构分析与讨论第51-82页
     ·YmtOAR1的拓扑结构第51-52页
     ·YmtOAR1的三级结构和空间构象第52-54页
     ·与同源蛋白的比较第54-57页
     ·YmtOAR1的辅酶结合口袋与活性位点第57-61页
     ·YmtOAR1基于辅酶结合所引起的构象变化第61-63页
     ·保守的催化机制-质子传递链和负氢转移第63-65页
     ·辅酶识别机制-关键性残基的探究第65-67页
     ·YmtOAR1的四级结构:独特的同二聚体第67-74页
       ·溶液中的YmtOAR1:稳定的同二聚体第67-68页
       ·晶体中的YmtOAR1:不同的堆积方式,相同的二聚化界面第68-72页
       ·四级结构比较的差异性第72-74页
       ·二聚体的生物学意义第74页
     ·YmtOAR1与酰基载脂蛋白(ACP)的作用方式第74-81页
       ·酵母线粒体载脂蛋白(ymtACP)的结构模型第75-77页
       ·YmtOAR1和ymtACP潜在的相互作用区域第77-79页
       ·对于体外检测相互作用阴性结果的分析第79-81页
  本章小结第81-82页
 第4章 实验材料、设备及方法补充第82-87页
     ·实验材料与设备第82-84页
     ·实验方法补充第84-87页
 参考文献第87-96页
第二篇 酿酒酵母囊泡转运相关蛋白Mvp1结晶学研究第96-114页
 第1章 绪论(研究背景综述)第96-105页
     ·真核生物细胞膜间的交流-囊泡转运第96-97页
     ·囊泡形成的过程第97-99页
     ·SNARE蛋白家族参与膜融合过程第99-101页
     ·Sorting nexins(分拣蛋白)参与胞内囊泡转运分选途径第101-105页
 第2章 实验方法、结果与讨论第105-109页
     ·酵母囊泡转运蛋白Mvp1的质粒构建、表达与纯化第105-106页
     ·酵母囊泡转运蛋白Mvp1的结晶第106-107页
     ·mvp1蛋白晶体的衍射情况第107-108页
  本章小结第108-109页
 参考文献第109-114页
附录第114-118页
致谢第118-119页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第119页

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