| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-29页 |
| ·罗氏沼虾概况 | 第11页 |
| ·已发现的感染罗氏沼虾的病毒 | 第11-13页 |
| ·对虾白斑综合症病毒(WSSV) | 第11-12页 |
| ·类细小病毒(Parvo-like virus) | 第12页 |
| ·罗氏沼虾野田村病毒(Macrobrachium rosenbergii Nodavirus，MrNV) | 第12-13页 |
| ·极小病毒(extra small virus，XSV) | 第13页 |
| ·对虾病毒种类与性质 | 第13-15页 |
| ·线头病毒科(Nimaviridae) | 第13-14页 |
| ·杆状病毒科(baculoviridae) | 第14页 |
| ·细小病毒科(Parvoviridae) | 第14页 |
| ·呼肠孤病毒科(Reoviridae) | 第14页 |
| ·双顺反子病毒科(Dicistroviridae) | 第14-15页 |
| ·杆套病毒科(Roniviridae) | 第15页 |
| ·整体病毒科(Totiviridae) | 第15页 |
| ·野田村病毒科(Nodaviridae) | 第15页 |
| ·弹状病毒科(Rhabdoviridae) | 第15页 |
| ·披盖病毒科(Togaviridae) | 第15页 |
| ·几种常见的对虾病毒及特征 | 第15-18页 |
| ·对虾白斑综合征病毒(white spot syndrome virus, WSSV) | 第15-16页 |
| ·斑节对虾杆状病毒(Penaeus monodon Baculovirus, MBV) | 第16页 |
| ·肝胰腺细小病毒(Hepatopancreatic Parvovirus, HPV) | 第16-17页 |
| ·涛拉综合症病毒 (Taura Syndrome Virus, TSV) | 第17页 |
| ·黄头病病毒(Yellow Head Virus, YHV) | 第17页 |
| ·传染性皮下及造血组织坏死病毒（infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus, IHHNV） | 第17-18页 |
| ·发病对虾样品的采集和保存 | 第18-19页 |
| ·用于组织切片的样品保存 | 第18页 |
| ·用于 DNA 提取的样品保存 | 第18-19页 |
| ·用于 RNA 提取的样品保存 | 第19页 |
| ·用于电镜观察的样品保存 | 第19页 |
| ·对虾病毒的几种检测鉴定方法 | 第19-23页 |
| ·现场快速诊断方法 | 第19-20页 |
| ·实验室病理诊断方法 | 第20-21页 |
| ·核酸技术检测方法 | 第21-23页 |
| ·未知病毒鉴定方法 | 第23-27页 |
| ·变性寡核苷酸引物 PCR (Degenerate oligonucleotide primed PCR, DOP-PCR) 和引物延伸预扩增(Primer extension preamplification, PEP) PCR | 第23页 |
| ·多重置换扩增(Multiple displacement amplification, MDA) | 第23-24页 |
| ·序列非依赖的单引物扩增(SISPA, Sequence independent single primer amplification) | 第24-25页 |
| ·多重随机 PCR (Multi random PCR) | 第25-26页 |
| ·高通量测序（High-throughput sequencing） | 第26-27页 |
| ·研究展望 | 第27页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第27-29页 |
| 第二章 罗氏沼虾样本的采集和病理观察 | 第29-38页 |
| ·材料和方法 | 第29-30页 |
| ·实验试剂、材料和仪器 | 第29页 |
| ·罗氏沼虾样品采集 | 第29页 |
| ·病理学观察 | 第29-30页 |
| ·实验结果 | 第30-36页 |
| ·症状观察 | 第30-31页 |
| ·电镜观察 | 第31-32页 |
| ·组织切片观察 | 第32-36页 |
| ·讨论 | 第36-38页 |
| 第三章 罗氏沼虾可疑病毒 DNA 的随机克隆和测序 | 第38-47页 |
| ·材料与方法 | 第38-41页 |
| ·实验对象 | 第38页 |
| ·实验仪器 | 第38页 |
| ·可疑 DNA 病毒粒子的富集 | 第38-39页 |
| ·DNase I 使用量对宿主核酸 DNA 的去除效果 | 第39页 |
| ·宿主 DNA 酶切效果的检验 | 第39页 |
| ·DNase I 消化可疑病毒外部的核酸 | 第39-40页 |
| ·可疑病毒的 DNA 提取 | 第40页 |
| ·可疑病毒 DNA 的随机克隆 | 第40页 |
| ·产物凝胶纯化 | 第40页 |
| ·凝胶回收产物连接 T 载体 | 第40页 |
| ·重组载体的转化和培养 | 第40页 |
| ·蓝白斑筛选和克隆筛选 | 第40-41页 |
| ·序列测定与分析 | 第41页 |
| ·可疑序列的比对 | 第41页 |
| ·结果 | 第41-45页 |
| ·DNase I 使用量的初步优化 | 第41-43页 |
| ·多重随机 PCR 扩增产物结果 | 第43页 |
| ·可疑的 DNA 提取物来源的克隆的插入片段的测序结果 | 第43-44页 |
| ·可疑序列的 Align 结果 | 第44-45页 |
| ·讨论 | 第45-47页 |
| 第四章 罗氏沼虾可疑病毒 RNA 的随机克隆和测序 | 第47-63页 |
| ·材料与方法 | 第47-50页 |
| ·实验对象 | 第47页 |
| ·实验仪器 | 第47页 |
| ·罗氏沼虾幼体样品处理 | 第47页 |
| ·可疑病毒的 RNA 提取 | 第47页 |
| ·cDNA 第一链合成 | 第47-48页 |
| ·Klenow 反应进行 cDNA 第二链合成 | 第48页 |
| ·双链 cDNA 特异性扩增 | 第48页 |
| ·双链 cDNA 扩增产物凝胶回收 | 第48-49页 |
| ·凝胶回收产物连接 T 载体 | 第49页 |
| ·重组载体的转化和培养 | 第49页 |
| ·蓝白斑筛选和克隆筛选 | 第49页 |
| ·序列测定与分析 | 第49页 |
| ·可疑序列的比对 | 第49页 |
| ·可疑 RNA 病毒来源序列的特异性鉴定 | 第49-50页 |
| ·结果 | 第50页 |
| ·SISPA-PCR 产物结果分析 | 第50页 |
| ·可疑的 RNA 提取物来源的疑似细菌克隆插入片段的测序结果 | 第50-57页 |
| ·可疑的 RNA 提取物来源的疑似病毒克隆插入片段的测序结果 | 第57-60页 |
| ·讨论 | 第60-63页 |
| 参考文献 | 第63-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
