| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 本论文常用英文缩写 | 第9-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-16页 |
| 1 鞭虫虫体形态和生活史 | 第10-11页 |
| 2 流行特点及诊断防治 | 第11-12页 |
| 3 鞭虫分类的相关背景 | 第12页 |
| 4 分子标记技术在遗传变异和分子分类中的应用 | 第12-15页 |
| ·基于PCR的分子标记技术 | 第12-13页 |
| ·其他分子标记技术 | 第13-14页 |
| ·基因座位在遗传变异和分子分类中的意义及应用 | 第14-15页 |
| 5 小结与展望 | 第15-16页 |
| ·小结 | 第15页 |
| ·展望 | 第15-16页 |
| 第二章 鞭虫种间及种内ITS基因多态性的研究 | 第16-63页 |
| 1 材料与方法 | 第16-22页 |
| ·材料 | 第16-18页 |
| ·样品 | 第16页 |
| ·虫体样品材料 | 第16页 |
| ·对照样品材料 | 第16页 |
| ·工程菌 | 第16页 |
| ·载体 | 第16页 |
| ·酶类及试剂 | 第16-17页 |
| ·酶试剂 | 第16页 |
| ·分子生物学试剂盒 | 第16页 |
| ·DNA分子量标准 | 第16页 |
| ·培养基 | 第16-17页 |
| ·缓冲液及其它溶液 | 第17页 |
| ·其它试剂 | 第17页 |
| ·仪器设备 | 第17-18页 |
| ·方法 | 第18-22页 |
| ·虫体材料的处理和DNA提取 | 第18-19页 |
| ·虫体材料的处理 | 第18页 |
| ·虫体材料的裂解 | 第18页 |
| ·虫体基因组DNA的抽提和纯化 | 第18-19页 |
| ·对照样品的处理及DNA抽提 | 第19页 |
| ·常规PCR扩增 | 第19页 |
| ·引物 | 第19页 |
| ·ITS基因PCR扩增 | 第19页 |
| ·琼脂糖电泳分析 | 第19页 |
| ·测序样品的PCR扩增与鉴定 | 第19-20页 |
| ·测序样品PCR扩增产物的回收与纯化 | 第20页 |
| ·PCR纯化产物的连接与转化 | 第20-21页 |
| ·PCR纯化产物与克隆载体的连接 | 第20页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第20-21页 |
| ·重组质粒的转化 | 第21页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第21-22页 |
| ·阳性转化子的菌落PCR鉴定 | 第21页 |
| ·重组质粒的抽提 | 第21-22页 |
| ·重组质粒PCR鉴定 | 第22页 |
| ·重组质粒酶切鉴定 | 第22页 |
| ·基因的序列测定 | 第22页 |
| ·DNA序列分析 | 第22页 |
| 2 结果与分析 | 第22-60页 |
| ·PCR扩增结果 | 第22页 |
| ·ITS基因片段的克隆与鉴定结果 | 第22-23页 |
| ·测序结果及分析 | 第23-58页 |
| ·ITS-1基因片段的测序结果及分析 | 第23-37页 |
| ·5.8S基因片段的测序结果及分析 | 第37-39页 |
| ·ITS-2基因片段的测序结果及分析 | 第39-52页 |
| ·微卫星重复序列及分析 | 第52-58页 |
| ·遗传变异的进化树分析 | 第58-60页 |
| ·5.8S基因片段的测序结果及分析 | 第58-59页 |
| ·ITS-2基因片段的测序结果及分析 | 第59-60页 |
| 3 ITS基因片段的PCR-RFLP鉴定 | 第60-61页 |
| ·MapDraw筛选 | 第60页 |
| ·酶切反应 | 第60-61页 |
| ·ITS基因片段的Pst I酶切鉴定 | 第61页 |
| 4 小结 | 第61-63页 |
| 第三章 鞭虫线粒体lsr RNA和nad4基因的多态性研究 | 第63-75页 |
| 1 材料与方法 | 第63-65页 |
| ·材料 | 第63页 |
| ·样品 | 第63页 |
| ·虫体样品材料 | 第63页 |
| ·对照样品材料 | 第63页 |
| ·主要试剂及溶液 | 第63页 |
| ·主要仪器设备 | 第63页 |
| ·方法 | 第63-65页 |
| ·样品材料的处理和DNA提取 | 第63页 |
| ·常规PCR扩增 | 第63-65页 |
| ·引物 | 第63-64页 |
| ·PCR扩增 | 第64页 |
| ·琼脂糖电泳分析 | 第64-65页 |
| ·测序样品PCR扩增产物的回收与纯化 | 第65页 |
| ·PCR纯化产物的连接与转化 | 第65页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第65页 |
| 2 结果与分析 | 第65-74页 |
| ·PCR扩增结果 | 第65-66页 |
| ·菌液PCR扩增结果与重组质粒酶切结果 | 第66页 |
| ·测序结果 | 第66-73页 |
| ·DNA序列分析结果 | 第73-74页 |
| 3 小结 | 第74-75页 |
| 第四章 总结与创新点 | 第75-77页 |
| 1 总结 | 第75-76页 |
| 2 创新点 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 附录 | 第84-86页 |