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天蓝色链霉菌FtsY和Ffh结构和功能的初步研究

摘要第1-3页
Abstract第3-8页
第一章 文献综述第8-34页
   ·细菌蛋白分泌的主要途径第8-12页
     ·Sec途径第8-10页
     ·Tat途径第10-11页
     ·SRP途径第11页
     ·三种主要途径的差别第11-12页
   ·蛋白经SRP途径的靶向转运第12-30页
     ·信号肽第12-13页
     ·SRP途径的分子机制第13-17页
       ·真核生物SRP途径第13-14页
       ·细菌SRP途径第14-15页
       ·SRP的保守性第15-17页
     ·细菌中SRP的结构与功能第17-20页
       ·SRP组分的结构数据第17-18页
       ·SRP的核心是动态的第18页
       ·M结构域结合靶向信号的结构基础第18-19页
       ·细菌SRP对底物的识别第19页
       ·SRP调控翻译作用第19-20页
     ·SRP受体第20-23页
       ·真核细胞SRP受体第20页
       ·原核细胞SRP受体第20-23页
     ·SRP组分RNA第23-24页
     ·SRP与其受体的相互作用第24-26页
     ·SRP组分也与其他蛋白相互作用第26-27页
     ·SRP与靶向信号的相互作用第27页
     ·SRP与核糖体以及核糖体新生肽链结合第27-28页
     ·GTP在SRP途径中的作用第28-30页
   ·链霉菌SRP途径的研究进展第30-31页
   ·小结与展望第31-34页
第二章 材料和方法第34-43页
   ·材料第34-36页
     ·生物信息学资源第34页
     ·实验材料第34-36页
       ·质粒和菌株第34页
       ·主要试剂第34页
       ·主要仪器第34-35页
       ·培养基和缓冲液第35-36页
   ·方法第36-43页
     ·生物信息学预测和分析方法第36页
     ·常规实验方法第36-43页
       ·天蓝色链霉菌基因组DNA的提取第36-37页
       ·感受态细胞制备第37页
       ·细胞转化第37页
       ·FtsY和Ffh及其功能域的克隆和测序第37-39页
       ·pET15b-NG,pET15b-G,pGEX-4T-2-ftsY表达载体的构建和诱导表达第39页
       ·ftsY和ffh基因及其功能域在E.coli中的表达和鉴定第39页
       ·亲和纯化表达蛋白第39-40页
       ·蛋白含量测定第40-41页
       ·GTP水解活性测定第41页
       ·GTPase的K_m和V_(max)测定第41页
       ·GTP光亲和交联第41页
       ·pH对FtsY,Ffh及其功能域GTPase酶活性的影响第41页
       ·Mg~(2+)对FtsY,Ffh及其功能域GTPase酶活性的影响第41-42页
       ·温度对FtsY,Ffh及其功能域GTPase酶活性的影响第42-43页
第三章 结果和讨论第43-80页
   ·FtsY蛋白的生物信息学分析第43-50页
     ·FtsY的理化性质和一级结构分析第43-45页
     ·FtsY亲疏水性分析第45页
     ·FtsY二级结构分析第45-46页
     ·FtsY三级空间结构分析第46-47页
     ·FtsY的亚细胞定位第47-48页
     ·FtsY蛋白的同源性分析第48-49页
     ·FtsY蛋白同源进化树构建第49-50页
   ·Ffh蛋白的生物信息学分析第50-57页
     ·Ffh的理化性质和一级结构分析第50-51页
     ·Ffh亲疏水性分析第51-52页
     ·Ffh二级结构分析第52-53页
     ·Ffh三级空间结构分析第53-54页
     ·Ffh的亚细胞定位第54页
     ·Ffh蛋白的同源性分析第54-57页
     ·Ffh蛋白同源进化树构建第57页
   ·S.coelicolor FtsY和Ffh及其功能域GTPase酶活性的实验研究第57-76页
     ·FtsY/Ffh蛋白及其功能域克隆、表达和亲和纯化第58-66页
       ·FtsY/Ffh蛋白及其功能域克隆第58-62页
       ·FtsY/Ffh蛋白及其功能域表达和亲和纯化第62-66页
     ·纯化蛋白含量的测定第66-67页
     ·FtsY/Ffh蛋白及其功能域的GTPase酶活性第67-69页
     ·FtsY蛋白及其功能域的GTPase酶的K_m和V_(max)第69-71页
     ·Ffh功能域的GTPase酶的K_m和V_(max)第71-72页
     ·FtsY蛋白及其功能域GTPase稳定性第72-74页
       ·温度对FtsY蛋白及其功能域GTPase酶活性影响第72-73页
       ·pH对FtsY蛋白及其功能域GTPase酶活性影响第73页
       ·Mg~(2+)对FtsY蛋白及其功能域GTPase酶活性影响第73-74页
     ·Ffh-NG和Ffh-G蛋白功能域GTPase稳定性第74-75页
       ·温度对Ffh-NG和Ffh-G GTPase酶活性影响第74-75页
       ·pH对Ffh蛋白功能域GTPase酶活性影响第75页
       ·Mg~(2+)对Ffh功能域GTPase酶活性的影响第75页
     ·FtsY/Ffh蛋白及其功能域结合GTP的能力第75-76页
   ·讨论第76-80页
论文独创性声明第80-81页
参考文献第81-89页
发表论文情况第89-90页
附录 测序报告第90-94页
致谢第94页

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