| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-18页 |
| ·单核苷酸多态性标记的原理及特点 | 第12-13页 |
| ·单核苷酸多态性标记的开发 | 第13-14页 |
| ·基于表达序列标签(EST)的 SNP 开发 | 第13页 |
| ·基于扩增子测序的 SNP 开发 | 第13页 |
| ·基于全基因组序列的 SNP 标记开发 | 第13页 |
| ·基于第二代测序技术的 SNP 开发 | 第13-14页 |
| ·单核苷酸多态性检测方法研究进展 | 第14-16页 |
| ·酶切扩增多态性序列法(Cleaved amplified polymorphic sequence, CAPS) | 第14页 |
| ·衍生酶切扩增多态性(derived cleaved amplified polymorphic sequence，dCAPS)技术 | 第14页 |
| ·单链构象多态性(Single-strand conformational polymorphism，SSCP) | 第14-15页 |
| ·等位基因特异性 PCR(Allele-specific PCR, AS-PCR) | 第15页 |
| ·直接测序法检测 SNP | 第15页 |
| ·高分辨溶解曲线分析(High resolution melting, HRM) | 第15页 |
| ·基因芯片(Gene chip)检测 | 第15-16页 |
| ·SNP 技术在木本植物遗传育种中的应用 | 第16页 |
| ·本实验研究的内容、目的和意义 | 第16-18页 |
| 第二章 茶树 EST-SNP 的挖掘与鉴定 | 第18-27页 |
| ·实验材料和方法 | 第18-20页 |
| ·从 ESTs 中发掘候选 SNPs | 第18页 |
| ·植物材料以及基因组 DNA 提取 | 第18-19页 |
| ·引物的设计及扩增 | 第19页 |
| ·测序确证 SNPs | 第19-20页 |
| ·实验结果及分析 | 第20-26页 |
| ·从 ESTs 中发掘候选 SNPs | 第20页 |
| ·基因组 DNA 的提取和检测 | 第20页 |
| ·引物的扩增及重测序验证 SNPs | 第20-26页 |
| ·讨论 | 第26-27页 |
| 第三章 基于茶树 SNP 的 CAPS 标记的转化 | 第27-32页 |
| ·材料与方法 | 第27-28页 |
| ·植物材料和试剂 | 第27页 |
| ·基因组 DNA 的提取及检测 | 第27-28页 |
| ·PCR 扩增及电泳检测 | 第28页 |
| ·PCR 产物直接测序验证 SNPs | 第28页 |
| ·对 SNPs 进行酶切位点分析 | 第28页 |
| ·PCR 产物的酶切及电泳检测 | 第28页 |
| ·结果及分析 | 第28-31页 |
| ·PCR 产物直接测序验证 SNPs | 第28-29页 |
| ·酶切识别位点分析 | 第29页 |
| ·CAPS 标记的转化 | 第29-31页 |
| ·讨论 | 第31-32页 |
| 第四章 基于茶树 SNP 的 dCAPS 标记的转化 | 第32-37页 |
| ·材料与方法 | 第32-33页 |
| ·实验材料和试剂 | 第32页 |
| ·目的片段的扩增 | 第32-33页 |
| ·dCAPS 标记的转化 | 第33页 |
| ·dCAPS 标记在 F1 群体中的分离 | 第33页 |
| ·结果与分析 | 第33-36页 |
| ·dCAPS 标记的转化 | 第33页 |
| ·dCAPS 标记在 F1 群体中的分离 | 第33-36页 |
| ·讨论 | 第36-37页 |
| 第五章 基于 SNP 的茶树种质遗传多样性研究 | 第37-46页 |
| ·材料与方法 | 第37-38页 |
| ·实验材料和试剂 | 第37页 |
| ·目标片段的扩增及检测 | 第37-38页 |
| ·SNP 分型 | 第38页 |
| ·遗传多态性分析 | 第38页 |
| ·结果及分析 | 第38-40页 |
| ·引物的扩增及 SNP 分型 | 第38页 |
| ·遗传多样性分析 | 第38-40页 |
| ·讨论 | 第40-46页 |
| 第六章 CAPS 和 dCAPS 标记在茶树品种遗传多样性研究中的应用 | 第46-51页 |
| ·材料和方法 | 第46-47页 |
| ·植物材料及试剂 | 第46页 |
| ·目标片段的扩增及检测 | 第46-47页 |
| ·酶切检测及多态性分析 | 第47页 |
| ·构建进化树 | 第47页 |
| ·结果及分析 | 第47-49页 |
| ·CAPS 和 dCAPS 标记的多态性检测 | 第48页 |
| ·进化树的构建 | 第48-49页 |
| ·讨论 | 第49-51页 |
| 第七章 结论与展望 | 第51-53页 |
| ·结论 | 第51-52页 |
| ·茶树 EST-SNPs 的挖掘与鉴定 | 第51页 |
| ·基于 SNP 的三个茶树变种的遗传多样性研究 | 第51页 |
| ·SNP 标记转化为基于 PCR 的 CAPS 标记 | 第51页 |
| ·SNP 标记转化为基于 PCR 的 dCAPS 标记 | 第51-52页 |
| ·CAPS 和 dCAPS 标记在茶树品种遗传多样性研究中的应用 | 第52页 |
| ·展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 作者简历 | 第60页 |
