| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-18页 |
| ·课题背景 | 第12-14页 |
| ·研究内容 | 第14-16页 |
| ·研究意义 | 第16页 |
| ·本文组织结构 | 第16-18页 |
| 第二章 GPCR 结构预测相关技术 | 第18-30页 |
| ·GPCR 结构简介 | 第18-20页 |
| ·蛋白质结构及其面向计算的描述 | 第20-23页 |
| ·蛋白质结构 | 第20-22页 |
| ·面向计算的蛋白质表示方法 | 第22-23页 |
| ·当前主流的 GPCR 结构预测方法 | 第23-29页 |
| ·同源建模方法 | 第23-24页 |
| ·穿线法 | 第24-26页 |
| ·Rosetta 从头预测方法 | 第26-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 GPCR 骨架预测并行化的方法 | 第30-42页 |
| ·引言 | 第30页 |
| ·材料与方法 | 第30-37页 |
| ·能量函数 | 第30-33页 |
| ·同源建模 GPCR 跨膜螺旋区域 | 第33-35页 |
| ·并行从头预测 GPCR loop 区域 | 第35-37页 |
| ·结果分析与讨论 | 第37-41页 |
| ·本文小结 | 第41-42页 |
| 第四章 GPCR 侧链预测实践 | 第42-54页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·基于四层推理模型的 GPCR 旋转异构体库构造方法 | 第42-48页 |
| ·模型概述 | 第42-44页 |
| ·模型训练 | 第44页 |
| ·采样 | 第44-46页 |
| ·结果分析与讨论 | 第46-48页 |
| ·并行 ACO 侧链预测 | 第48-53页 |
| ·问题描述 | 第48-49页 |
| ·基于 SHOP 的并行蚁群 GPCR 侧链预测 | 第49-51页 |
| ·结果分析与讨论 | 第51-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 第五章 总结与展望 | 第54-56页 |
| ·工作总结 | 第54-55页 |
| ·研究展望 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 发表文章目录及科研项目 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |