| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| ·研究背景 | 第10-11页 |
| ·研究现状 | 第11-13页 |
| ·论文的主要研究内容 | 第13-15页 |
| 第二章 RNA 二级结构的预测算法基础 | 第15-29页 |
| ·基本概念 | 第15-18页 |
| ·RNA 二级结构预测算法分析 | 第18-28页 |
| ·基于最小自由能方法 | 第19-22页 |
| ·比较序列分析方法 | 第22-23页 |
| ·启发式算法 | 第23-28页 |
| ·小结 | 第28-29页 |
| 第三章 基于改进后的堆积协变信息和最小自由能预测 RNA 二级结构 | 第29-38页 |
| ·协变信息计算模型 | 第29-32页 |
| ·协变信息计算模型 | 第29-30页 |
| ·堆积协变信息计算模型的改进 | 第30-31页 |
| ·堆积协变信息和最小自由能的组合模型 | 第31-32页 |
| ·CEfold 算法 | 第32页 |
| ·数值试验 | 第32-37页 |
| ·改进前后预测结果比较 | 第33-36页 |
| ·预测结果评估 | 第36页 |
| ·时间复杂度分析 | 第36-37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第四章 基于堆积能量和堆积协变信息的含伪结 RNA 二级结构预测迭代化算法 | 第38-47页 |
| ·堆积能量和协变信息计算模型 | 第38-40页 |
| ·堆积能量 | 第38-39页 |
| ·堆积能量和协变信息的组合模型 | 第39-40页 |
| ·MSCF 算法流程 | 第40-41页 |
| ·数值实验 | 第41-46页 |
| ·预测结构与真实结构比较 | 第41-44页 |
| ·与参考算法的预测精度对比分析 | 第44-45页 |
| ·时间复杂度分析 | 第45-46页 |
| ·小结 | 第46-47页 |
| 第五章 总结与展望 | 第47-50页 |
| ·总结 | 第47-48页 |
| ·存在的问题和今后的工作 | 第48-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 作者在学期间取得的学术成果 | 第55页 |