| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 第1章 引言 | 第9-14页 |
| 1.1 选题背景及意义 | 第9-11页 |
| 1.1.1 细菌基因序列研究 | 第9-11页 |
| 1.1.2 人类蛋白质组序列研究 | 第11页 |
| 1.2 研究现状和趋势 | 第11-13页 |
| 1.3 研究方向和论文结构 | 第13-14页 |
| 第2章 自然向量法 | 第14-31页 |
| 2.1 基本知识介绍 | 第14页 |
| 2.2 自然向量定义 | 第14-17页 |
| 2.3 自然向量的性质 | 第17-18页 |
| 2.4 基因组的自然向量 | 第18-19页 |
| 2.5 自然向量的应用与Hausdorff距离 | 第19-20页 |
| 2.6 几类自然向量公式推导 | 第20-26页 |
| 2.6.1 反向基因序列的自然向量 | 第20-22页 |
| 2.6.2 添加某一碱基所得序列的自然向量 | 第22-24页 |
| 2.6.3 环形结构基因序列的自然向量 | 第24-26页 |
| 2.7 改进的自然向量 | 第26-31页 |
| 第3章 Yau-hausdorff方法 | 第31-66页 |
| 3.1 介绍 | 第31-32页 |
| 3.2 序列的图形表示 | 第32-35页 |
| 3.2.1 基因序列的图形表示 | 第32-33页 |
| 3.2.2 蛋白质序列的图形表示 | 第33-35页 |
| 3.3 最小二维Hausdorff距离 | 第35-36页 |
| 3.4 Yau-Hausdorff距离 | 第36-39页 |
| 3.4.1 基本定义 | 第36-38页 |
| 3.4.2 稳定性、扰动及复杂度分析 | 第38-39页 |
| 3.5 Yau-Hausdorff距离的性质 | 第39-52页 |
| 3.5.1 Yau-Hausdorff度量的证明 | 第39-45页 |
| 3.5.2 Yau-Hausdorff与最小二维Hausdorff距离大小比较 | 第45-48页 |
| 3.5.3 Yau-Hausdorff度量计算实例 | 第48-52页 |
| 3.6 数据结果 | 第52-64页 |
| 3.6.1 基因序列比对 | 第52-56页 |
| 3.6.2 蛋白质序列比对 | 第56-64页 |
| 3.6.3 分析与讨论 | 第64页 |
| 3.7 小结 | 第64-66页 |
| 第4章 总结与展望 | 第66-69页 |
| 4.1 本文结论 | 第66-67页 |
| 4.2 本文创新点 | 第67页 |
| 4.3 后续研究方向 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第75页 |