| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-24页 |
| 1 蓖麻葡萄孢及其危害 | 第13-18页 |
| 1.1 蓖麻葡萄孢分类地位及形态描述 | 第13页 |
| 1.2 侵染循环与寄主范围 | 第13-15页 |
| 1.3 蓖麻葡萄孢的危害 | 第15-16页 |
| 1.4 蓖麻灰霉病的发生与流行 | 第16页 |
| 1.5 蓖麻灰霉病的防治 | 第16-18页 |
| 1.5.1 物理防治 | 第17页 |
| 1.5.2 化学防治 | 第17-18页 |
| 1.5.3 生物防治 | 第18页 |
| 2 分子系统学在真菌分类鉴定中的应用 | 第18-19页 |
| 3 分子标记技术在真菌遗传多样性中的应用 | 第19-20页 |
| 4 交配型基因概述 | 第20-21页 |
| 4.1 交配型类型 | 第20页 |
| 4.2 交配型基因结构 | 第20-21页 |
| 4.3 交配型对真菌多样性的影响 | 第21页 |
| 5 真菌病毒多样性研究 | 第21-23页 |
| 5.1 真菌病毒多样性 | 第21-22页 |
| 5.2 真菌病毒对真菌多样性的影响 | 第22页 |
| 5.3 高通量测序技术在真菌病毒研究中的应用 | 第22-23页 |
| 6 本课题的意义和主要内容 | 第23-24页 |
| 6.1 课题的意义 | 第23页 |
| 6.2 课题的主要内容 | 第23-24页 |
| 第二章 Amphobotrys属菌株分类属性鉴定 | 第24-46页 |
| 1 材料 | 第24-28页 |
| 1.1 所用菌株 | 第24-27页 |
| 1.2 培养基 | 第27页 |
| 1.3 药品及试剂 | 第27-28页 |
| 1.4 仪器设备 | 第28页 |
| 2 试验方法 | 第28-34页 |
| 2.1 Amphobotrys属内分类鉴定 | 第28-34页 |
| 2.1.1 菌株活化 | 第28-29页 |
| 2.1.2 菌株生长速率的测定 | 第29页 |
| 2.1.3 菌落形态观察 | 第29页 |
| 2.1.4 分生孢子大小和菌核大小的测定 | 第29页 |
| 2.1.5 菌丝的培养与收集 | 第29-30页 |
| 2.1.6 基因组DNA的提取 | 第30页 |
| 2.1.7 PCR扩增(ITS、G3PDH、HSP60和RPB2) | 第30-31页 |
| 2.1.8 回收PCR产物并纯化 | 第31-32页 |
| 2.1.9 纯化产物的连接转化及序列测定 | 第32页 |
| 2.1.10 重组质粒的检测 | 第32-33页 |
| 2.1.11 基因的序列分析及系统发育树的构建 | 第33-34页 |
| 2.2 Amphobotrys属分类地位的分子系统学鉴定 | 第34页 |
| 2.2.1 WHA-1菌株的全基因组测序 | 第34页 |
| 2.2.2 WHA-1菌株的基因组分析 | 第34页 |
| 2.2.3 基于全基因组构建系统发育树 | 第34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-44页 |
| 3.1 Amphobotrys属内分类鉴定 | 第34-40页 |
| 3.1.1 菌丝生长速度测定 | 第34-35页 |
| 3.1.2 菌落形态观察 | 第35-36页 |
| 3.1.3 分生孢子大小和菌核大小的测定 | 第36-37页 |
| 3.1.4 ITS、G3PDH、HSP60和RPB2的同源比对及系统进化树构建 | 第37-40页 |
| 3.2 Amphobotrys属分类地位的分子系统学鉴定 | 第40-44页 |
| 3.2.1 DNA检测结果 | 第40-41页 |
| 3.2.2 基因组组装结果 | 第41-42页 |
| 3.2.3 基因组圈图绘制 | 第42页 |
| 3.2.4 系统进化树的构建 | 第42-44页 |
| 4 讨论 | 第44-46页 |
| 第三章 Amphobotrys ricini群体多样性研究 | 第46-58页 |
| 1 材料 | 第46-49页 |
| 1.1 试验菌株 | 第46页 |
| 1.2 主要试剂 | 第46页 |
| 1.3 相关培养基 | 第46-47页 |
| 1.4 引物 | 第47-49页 |
| 2 试验方法 | 第49-50页 |
| 2.1 基于RAPD的蓖麻葡萄孢的遗传多样性分析 | 第49-50页 |
| 2.1.1 基因组DNA的提取和检测 | 第49页 |
| 2.1.2 RAPD引物的筛选 | 第49页 |
| 2.1.3 随机多态性扩增 | 第49页 |
| 2.1.4 数据处理与分析 | 第49-50页 |
| 2.2 蓖麻葡萄孢交配型检测及交配型基因结构分析 | 第50页 |
| 2.2.1 引物 | 第50页 |
| 2.2.2 交配型检测 | 第50页 |
| 2.2.3 蓖麻葡萄孢交配型基因结构分析 | 第50页 |
| 3 结果与分析 | 第50-56页 |
| 3.1 RAPD扩增图谱分析 | 第50-52页 |
| 3.2 A.ricini群体遗传变异分析 | 第52-54页 |
| 3.3 交配型检测结果 | 第54-55页 |
| 3.4 交配型基因结构分析 | 第55-56页 |
| 4 讨论 | 第56-58页 |
| 第四章 Amphobotrys ricini中真菌病毒多样性分析 | 第58-70页 |
| 1 材料 | 第58-59页 |
| 1.1 供试菌株 | 第58页 |
| 1.2 培养基 | 第58页 |
| 1.3 药品与试剂 | 第58-59页 |
| 2 试验方法 | 第59-61页 |
| 2.1 菌丝的培养和收集 | 第59页 |
| 2.2 总RNA的提取与纯化 | 第59页 |
| 2.3 高通量测序 | 第59-60页 |
| 2.4 序列分析 | 第60页 |
| 2.5 RT-PCR | 第60-61页 |
| 2.6 病毒的验证 | 第61页 |
| 2.7 系统发育分析 | 第61页 |
| 3 结果与分析 | 第61-68页 |
| 3.1 菌株总RNA提取及检测 | 第61-62页 |
| 3.2 高通量测序结果分析 | 第62-67页 |
| 3.3 系统进化分析 | 第67页 |
| 3.4 RT-PCR的验证 | 第67-68页 |
| 4 讨论 | 第68-70页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第70-72页 |
| 1 总结 | 第70-71页 |
| 2 展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-81页 |
| 附录 | 第81-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
