| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第1章 文献综述 | 第12-28页 |
| 1.1 亲缘地理学研究进展 | 第12-21页 |
| 1.1.1 亲缘地理学简介 | 第12页 |
| 1.1.2 亲缘地理学相关的理论依据 | 第12-16页 |
| 1.1.3 亲缘地理学研究应用的分子标记 | 第16-19页 |
| 1.1.4 东亚地区亲缘地理学研究进展 | 第19-21页 |
| 1.2 保护遗传学研究进展 | 第21-24页 |
| 1.2.1 保护遗传学简介 | 第21页 |
| 1.2.2 亲缘地理学在保护遗传学中的作用 | 第21-22页 |
| 1.2.3 保护遗传学与濒危植物的保护 | 第22-24页 |
| 1.3 细茎石斛研究概况 | 第24-27页 |
| 1.3.1 细茎石斛资源概况 | 第24页 |
| 1.3.2 细茎石斛的形态和生物学特征 | 第24-25页 |
| 1.3.3 细茎石斛的研究现状 | 第25-26页 |
| 1.3.4 细茎石斛研究中存在的问题 | 第26-27页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第27-28页 |
| 第2章 基于叶绿体序列的细茎石斛亲缘地理学研究 | 第28-45页 |
| 2.1 引言 | 第28页 |
| 2.2 材料和方法 | 第28-32页 |
| 2.2.1 材料采集 | 第28-30页 |
| 2.2.2 基因组DNA的提取 | 第30页 |
| 2.2.3 PCR扩增 | 第30页 |
| 2.2.4 cpDNA的序列比对 | 第30页 |
| 2.2.5 单倍型鉴定和居群遗传学分析 | 第30-31页 |
| 2.2.6 单倍型系统发育和分歧时间估计 | 第31页 |
| 2.2.7 居群失配分布分析 | 第31-32页 |
| 2.3 结果与分析 | 第32-41页 |
| 2.3.1 cpDNA单倍型分布和居群遗传多样性 | 第32-34页 |
| 2.3.2 居群的遗传结构 | 第34-37页 |
| 2.3.3 基于cpDNA单倍型系统发生与亲缘关系 | 第37-39页 |
| 2.3.4 失配分布分析和中性检测 | 第39-41页 |
| 2.3.5 细茎石斛分化时间估计 | 第41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-44页 |
| 2.4.1 遗传多样性与遗传结构 | 第41-42页 |
| 2.4.2 细茎石斛的动态历史 | 第42-43页 |
| 2.4.3 细茎石斛的避难所 | 第43-44页 |
| 2.5 本章结论 | 第44-45页 |
| 第3章 基于线粒体序列的细茎石斛亲缘地理学研究 | 第45-59页 |
| 3.1 引言 | 第45页 |
| 3.2 材料和方法 | 第45-47页 |
| 3.2.1 材料 | 第45页 |
| 3.2.2 DNA提取 | 第45-46页 |
| 3.2.3 PCR扩增 | 第46页 |
| 3.2.4 mtDNA的序列比对 | 第46页 |
| 3.2.5 单倍型鉴定和居群遗传学分析 | 第46-47页 |
| 3.2.6 单倍型系统发育和分歧时间估计 | 第47页 |
| 3.2.7 居群失配分布分析 | 第47页 |
| 3.3 结果与分析 | 第47-56页 |
| 3.3.1 mtDNA单倍型分布和居群遗传多样性 | 第47-49页 |
| 3.3.2 居群的遗传结构 | 第49-53页 |
| 3.3.3 基于mtDNA单倍型系统发生与亲缘关系 | 第53-54页 |
| 3.3.4 失配分布分析和中性检测 | 第54-56页 |
| 3.3.5 细茎石斛分化时间估计 | 第56页 |
| 3.4 讨论 | 第56-58页 |
| 3.4.1 mtDNA与cpDNA反映细茎石斛遗传多样性和遗传结构的分析比较 | 第56-57页 |
| 3.4.2 mtDNA与cpDNA反映细茎石斛动态历史的分析比较 | 第57页 |
| 3.4.3 mtDNA与cpDNA反映细茎石斛避难所的分析比较 | 第57-58页 |
| 3.5 本章结论 | 第58-59页 |
| 第4章 基于AFLP标记野生资源细茎石斛保护遗传学研究 | 第59-76页 |
| 4.1 引言 | 第59-60页 |
| 4.2 材料与方法 | 第60-64页 |
| 4.2.1 材料的收集 | 第60-61页 |
| 4.2.2 基因组DNA的提取 | 第61页 |
| 4.2.3 AFLP方法 | 第61-63页 |
| 4.2.4 居群遗传多样性分析 | 第63页 |
| 4.2.5 居群遗传结构分析 | 第63-64页 |
| 4.2.6 居群地理隔离检验 | 第64页 |
| 4.3 结果与分析 | 第64-73页 |
| 4.3.1 荧光标记法与银染法分析比较 | 第64-65页 |
| 4.3.2 居群的遗传多样性 | 第65-66页 |
| 4.3.3 居群聚类分析 | 第66-68页 |
| 4.3.4 居群遗传结构分析 | 第68-69页 |
| 4.3.5 居群地理隔离(IBD)检测 | 第69-73页 |
| 4.4 讨论 | 第73-75页 |
| 4.4.1 AFLP检测法优缺点比较 | 第73页 |
| 4.4.2 居群的遗传多样性 | 第73-74页 |
| 4.4.3 居群的遗传结构 | 第74-75页 |
| 4.5 本章结论 | 第75-76页 |
| 第5章 基于AFLP标记人工栽培细茎石斛遗传多样性研究 | 第76-84页 |
| 5.1 引言 | 第76页 |
| 5.2 材料和方法 | 第76-77页 |
| 5.2.1 材料收集和DNA提取 | 第76-77页 |
| 5.2.2 AFLP方法及扩增 | 第77页 |
| 5.2.3 居群的遗传多样性分析 | 第77页 |
| 5.2.4 居群的遗传结构分析 | 第77页 |
| 5.3 结果与分析 | 第77-82页 |
| 5.3.1 居群的遗传多样性 | 第77-78页 |
| 5.3.2 居群聚类分析 | 第78-79页 |
| 5.3.3 居群的遗传结构分析 | 第79-82页 |
| 5.4 讨论 | 第82-83页 |
| 5.4.1 野生居群与栽培居群的遗传多样性比较 | 第82-83页 |
| 5.4.2 野生居群和栽培居群的遗传结构比较 | 第83页 |
| 5.5 本章结论 | 第83-84页 |
| 第6章 细茎石斛的保护策略 | 第84-87页 |
| 6.1 引言 | 第84页 |
| 6.2 进化显著单元的确定 | 第84页 |
| 6.3 就地保护策略 | 第84-86页 |
| 6.4 迁地保护策略 | 第86-87页 |
| 第7章 结论与展望 | 第87-88页 |
| 7.1 结论 | 第87页 |
| 7.2 展望 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-106页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第106-107页 |
| 致谢 | 第107页 |
