miRNA-靶位点配对的序列特征研究
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第12-19页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-17页 |
| 1.2.1 miRNA与基因调控 | 第13-15页 |
| 1.2.2 miRNA研究进展 | 第15页 |
| 1.2.3 miRNA靶标识别进展 | 第15-16页 |
| 1.2.4 基于机器学习的miRNA靶标识别研究 | 第16-17页 |
| 1.3 主要内容与特色 | 第17-18页 |
| 1.4 论文组织结构 | 第18-19页 |
| 第二章 相关工作 | 第19-29页 |
| 2.1 miRNA与靶标结合特征简介 | 第19-24页 |
| 2.1.1 最小自由能 | 第19页 |
| 2.1.2 种子区域匹配 | 第19-20页 |
| 2.1.3 靶位点的可接入性 | 第20-21页 |
| 2.1.4 物种间进化保守性 | 第21-22页 |
| 2.1.5 基于伪二核苷酸的序列特征 | 第22-24页 |
| 2.2 特征工程 | 第24-25页 |
| 2.3 随机森林模型 | 第25-27页 |
| 2.4 模型评判指标介绍 | 第27-28页 |
| 2.5 本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 miRNA靶标识别模型构建 | 第29-39页 |
| 3.1 基于miRNA-靶位点的配对 | 第29-33页 |
| 3.2 miRNA与靶标结合特征计算 | 第33-37页 |
| 3.2.1 最小自由能计算 | 第33-34页 |
| 3.2.2 靶位点可接入性计算 | 第34-35页 |
| 3.2.3 序列保守性计算 | 第35-37页 |
| 3.2.4 其他相关特征 | 第37页 |
| 3.3 使用随机森林模型进行建模 | 第37-38页 |
| 3.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 miRNA靶标识别实验 | 第39-49页 |
| 4.1 数据提取与处理 | 第40-41页 |
| 4.2 特征集合 | 第41-43页 |
| 4.3 特征选择 | 第43-46页 |
| 4.4 参数训练 | 第46页 |
| 4.5 鲁棒性评估 | 第46-47页 |
| 4.6 与其他方法比较 | 第47-48页 |
| 4.7 本章小结 | 第48-49页 |
| 第五章 总结和展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第54-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
