| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 癌症诊断与癌炎鉴别诊断 | 第10页 |
| 1.2 在外周血中寻找癌症诊断标志 | 第10-12页 |
| 1.3 癌炎外周血免疫细胞上的表达异常 | 第12-13页 |
| 1.4 可重复的个体化诊断标志 | 第13页 |
| 1.5 论文研究的目的和意义 | 第13-15页 |
| 1.6 本文的结构安排 | 第15-16页 |
| 第二章 结肠癌、结节病全血相对于正常全血mRNA差异信号的来源 | 第16-26页 |
| 2.1 材料与方法 | 第16-21页 |
| 2.1.1 数据描述 | 第16页 |
| 2.1.2 数据预处理 | 第16-17页 |
| 2.1.3 去卷积算法评估每种纯化血液细胞比例 | 第17-20页 |
| 2.1.4 差异表达基因的筛选 | 第20页 |
| 2.1.5 两组差异表达基因的一致性比较 | 第20-21页 |
| 2.2 结果 | 第21-25页 |
| 2.2.1 结肠癌全血、结节病全血去卷积结果 | 第21页 |
| 2.2.2 结肠癌、结节病全血相对于正常全血的差异基因的来源 | 第21-25页 |
| 2.3 本章小结 | 第25-26页 |
| 第三章 CD4+、CD8+T细胞在癌症与炎症中功能改变模式的差异 | 第26-35页 |
| 3.1 材料与方法 | 第26-28页 |
| 3.1.1 数据描述 | 第26-27页 |
| 3.1.2 数据预处理 | 第27页 |
| 3.1.3 差异表达基因的筛选 | 第27页 |
| 3.1.4 GO功能富集 | 第27页 |
| 3.1.5 ISGs在上下调差异基因出现频率的Fisher精确检验 | 第27-28页 |
| 3.2 结果 | 第28-32页 |
| 3.2.1 癌症外周血中CD4+T细胞、CD8+T细胞的功能改变 | 第28-29页 |
| 3.2.2 炎症患者外周血CD4+、CD8+T细胞的功能改变 | 第29-30页 |
| 3.2.3 ISGs在癌症、炎症外周血CD4+、CD8+T细胞的表达改变 | 第30-32页 |
| 3.3 本章小结 | 第32-35页 |
| 第四章 利用基因相对秩分类癌症与正常以及癌症与炎症 | 第35-42页 |
| 4.1 材料与方法 | 第35-36页 |
| 4.1.1 数据 | 第35页 |
| 4.1.2 数据预处理 | 第35页 |
| 4.1.3 不同平台正常外周血CD4+T细胞稳定基因对的筛选 | 第35-36页 |
| 4.2 结果 | 第36-40页 |
| 4.2.1 稳定的基因相对秩的跨平台分析 | 第36-38页 |
| 4.2.2 癌症中逆转的基因对在正常及炎症中的表现 | 第38-40页 |
| 4.3 本章小结 | 第40-42页 |
| 第五章 总结与讨论 | 第42-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-52页 |
| 附录 | 第52-53页 |
| 读硕期间取得的研究成果 | 第53-54页 |
