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农业废物好氧堆肥中反硝化细菌的多样性研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
插图索引第11-12页
附表索引第12-13页
第1章 绪论第13-38页
    1.1 农业废物概述第13-14页
    1.2 堆肥化第14-22页
        1.1.1 堆肥的基本原理第14-16页
        1.2.2 堆肥化的基本工序第16-18页
        1.2.3 影响堆肥的因素第18-21页
        1.2.4 堆肥化处理农业废物存在的问题第21-22页
    1.3 反硝化过程的研究进展第22-26页
        1.3.1 反硝化过程与氮素循环第22-23页
        1.3.2 反硝化细菌种类及其还原性酶基因第23-24页
        1.3.3 影响反硝化过程的环境因子第24-26页
    1.4 PCR-DGGE 技术在堆肥微生物研究中的应用第26-32页
        1.4.1 PCR 技术第27-30页
        1.4.2 DGGE 技术第30-32页
        1.4.3 PCR-DGGE 技术在环境微生物中的应用第32页
    1.5 克隆文库的建立第32-33页
    1.6 多元分析方法第33-36页
        1.6.1 排序分析第33-34页
        1.6.2 冗余分析第34-35页
        1.6.3 典范对应分析第35-36页
    1.7 本研究课题意义及内容第36-38页
第2章 农业废物好氧堆肥过程的模拟第38-44页
    2.1 实验材料第38-40页
        2.1.1 堆肥材料与处理第38-39页
        2.1.2 实验仪器及设备第39-40页
        2.1.3 实验器皿及试剂第40页
    2.2 实验方法第40-42页
        2.2.1 取样方法第40页
        2.2.2 理化参数测定方法第40-42页
    2.3 结果与讨论第42-43页
        2.3.1 堆体温度与 pH第42页
        2.3.2 NH4+-N 与 NO3--N第42-43页
    2.4 小结第43-44页
第3章 农业废物好氧堆肥过程中反硝化还原酶基因的研究第44-58页
    3.1 仪器设备第44-45页
    3.2 主要试剂及其配比第45-46页
    3.3 实验方法第46-51页
        3.3.1 堆肥样品的预处理第46页
        3.3.2 堆肥样品 DNA 提取第46-47页
        3.3.3 DNA 的纯化第47-48页
        3.3.4 琼脂糖凝胶电泳检验第48-49页
        3.3.5 PCR-DGGE第49-50页
        3.3.6 克隆测序及系统发育分析第50-51页
        3.3.7 核苷酸序列登录号第51页
    3.4 数据处理第51页
    3.5 结果与讨论第51-56页
        3.5.1 堆肥总 DNA 提取结果第51-52页
        3.5.2 PCR第52-53页
        3.5.3 DGGE 指纹图谱分析第53-55页
        3.5.4 反硝化细菌 nirK 和 nirS 基因克隆测序第55-56页
    3.6 小结第56-58页
第4章 环境因子与反硝化细菌 nirK 和 nirS 基因群落相关性分析第58-66页
    4.1 数据分析软件第58页
    4.2 数据处理方法第58-59页
    4.3 冗余分析第59-63页
        4.3.1 基于环境因子的 RDA 分析第59-60页
        4.3.2 基于手动选择的 RDA 和方差分离分析第60-63页
    4.4 讨论第63-64页
    4.5 小结第64-66页
结论第66-68页
参考文献第68-76页
附录 A 攻读硕士学位期间所发表的学术论文第76-77页
致谢第77页

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