| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 家蚕第2白卵及其相关基因研究方法 | 第13-35页 |
| 1 家蚕卵的生物学特征 | 第13-20页 |
| 1.1 家蚕卵的形态和构造 | 第13-14页 |
| 1.2 家蚕卵色及其形成的生化机制 | 第14-18页 |
| 1.3 家蚕卵色突变体 | 第18-19页 |
| 1.4 家蚕卵色的遗传规律 | 第19-20页 |
| 2 家蚕白卵突变体及其研究现状 | 第20-23页 |
| 2.1 家蚕第1白卵发生的分子机制 | 第21页 |
| 2.2 家蚕第3白卵研究进展 | 第21-22页 |
| 2.3 卵色性状在家蚕分子育种中的应用价值 | 第22-23页 |
| 3 表达谱及差异基因研究手段 | 第23-33页 |
| 3.1 基因芯片技术 | 第23-28页 |
| 3.2 高通量测序技术 | 第28-32页 |
| 3.3 抑制消减杂交技术 | 第32-33页 |
| 3.4 实时荧光定量PCR技术 | 第33页 |
| 4 本章小结 | 第33-35页 |
| 第二章 利用SSH cDNA芯片研究家蚕第2白卵相关基因 | 第35-61页 |
| 1 材料与方法 | 第35-45页 |
| 1.1 家蚕第2白卵近等基因系的建立 | 第35页 |
| 1.2 家蚕总RNA提取 | 第35-36页 |
| 1.3 抑制消减杂交cDNA文库的构建 | 第36-39页 |
| 1.4 cDNA基因芯片制作、杂交及信息分析 | 第39-41页 |
| 1.5 实时荧光定量PCR分析 | 第41-42页 |
| 1.6 利用RACE技术扩增候选基因 | 第42-43页 |
| 1.7 J241与卵色形成相关性RNAi分析用dsRNA合成 | 第43-44页 |
| 1.8 家蚕蚕卵显微注射 | 第44-45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-59页 |
| 2.1 抑制消减杂交文库的构建及分析 | 第45页 |
| 2.2 cDNA芯片试验结果分析 | 第45-48页 |
| 2.3 实时荧光定量RT-PCR结果 | 第48-51页 |
| 2.4 J241文库基因的表达变化与基因克隆 | 第51-57页 |
| 2.5 J241-1基因与卵色形成相关性的RNAi分析 | 第57-59页 |
| 3 本章小结 | 第59-61页 |
| 第三章 应用基因组芯片对家蚕第2白卵相关基因的研究 | 第61-81页 |
| 1 材料与方法 | 第61-65页 |
| 1.1 家蚕黑卵及其第2白卵近等基因系生物材料制备 | 第61-62页 |
| 1.2 家蚕卵总RNA的提取 | 第62页 |
| 1.3 家蚕全基因组芯片制备 | 第62页 |
| 1.4 样品RNA荧光标记 | 第62-64页 |
| 1.5 芯片杂交与扫描 | 第64页 |
| 1.6 芯片图像的采集与数据分析 | 第64页 |
| 1.7 差异基因的实时荧光定量RT-PCR分析 | 第64-65页 |
| 2 结果与分析 | 第65-80页 |
| 2.1 芯片实验设计 | 第65-66页 |
| 2.2 差异基因分析 | 第66-67页 |
| 2.3 不同品系和时间表达基因的Hierarchical聚类分析 | 第67-68页 |
| 2.4 24h取样点差异基因及功能注释 | 第68-72页 |
| 2.5 48h取样点差异基因及功能注释 | 第72-75页 |
| 2.6 24h及48h共同出现的差异表达基因比较 | 第75-77页 |
| 2.7 芯片检测差异表达基因的实时荧光定PCR验证与分析 | 第77-80页 |
| 3 本章小结 | 第80-81页 |
| 第四章 应用表达谱测序技术研究家蚕第2白卵相关基因 | 第81-101页 |
| 1 材料与方法 | 第81-85页 |
| 1.1 家蚕黑卵及其第2白卵近等基因系生物材料制备 | 第81页 |
| 1.2 家蚕卵总RNA的提取 | 第81-82页 |
| 1.3 基因表达标签(Tag)制备及solexa测序 | 第82-83页 |
| 1.4 表达谱测序数据的计算机分析 | 第83-84页 |
| 1.5 表达谱测序结果的实时荧光定量RT-PCR验证 | 第84-85页 |
| 2 结果与分析 | 第85-99页 |
| 2.1 表达标签测序质量评估与饱和度分析 | 第85-87页 |
| 2.2 表达谱测序获得的表达标签的基因匹配(Tag mapping) | 第87-88页 |
| 2.3 家蚕黑白卵样品中差异基因的分析 | 第88-90页 |
| 2.4 差异表达基因的功能注释 | 第90-95页 |
| 2.5 色氨酸代谢通路有关差异基因分析 | 第95-97页 |
| 2.6 表达谱测序差异表达基因的实时荧光定量RT-PCR验证 | 第97-99页 |
| 3 本章小结 | 第99-101页 |
| 第五章 总结与展望 | 第101-103页 |
| 参考文献 | 第103-112页 |
| 附录 | 第112-127页 |
| 致谢 | 第127-128页 |
| 在读期间发表的相关论文 | 第128页 |
