| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4页 |
| 前言 | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-19页 |
| 1.1 紫杉醇侧链的生物合成 | 第9-11页 |
| 1.1.1 侧链的基本合成途径 | 第9-10页 |
| 1.1.2 氨基变位酶 | 第10-11页 |
| 1.1.3 苯基丙酸-CoA转移酶 | 第11页 |
| 1.1.4 3-N-苯甲酰基转移酶 | 第11页 |
| 1.1.5 2’-羟化酶 | 第11页 |
| 1.2 染色体步移技术 | 第11-14页 |
| 1.2.1 反向PCR技术 | 第12页 |
| 1.2.2 连接PCR技术 | 第12页 |
| 1.2.3 特殊引物PCR技术 | 第12-14页 |
| 1.3 基于染色体的基因结构生物信息学分析 | 第14-17页 |
| 1.3.1 启动子分析 | 第15页 |
| 1.3.2 内含子分析 | 第15-16页 |
| 1.3.3 终止子分析 | 第16页 |
| 1.3.4 蛋白质理化性质分析 | 第16页 |
| 1.3.5 进化树分析 | 第16页 |
| 1.3.6 偏爱密码子分析 | 第16-17页 |
| 1.4 本文的研究意义和主要研究内容 | 第17-19页 |
| 1.4.1 研究意义 | 第17页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第17-19页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第19-28页 |
| 2.1 材料 | 第19-22页 |
| 2.1.1 红豆杉细胞、菌种、载体和引物 | 第19-20页 |
| 2.1.2 主要仪器和试剂 | 第20-22页 |
| 2.2 基本基因操作方法 | 第22-25页 |
| 2.2.1 东北红豆杉基因组提取 | 第22页 |
| 2.2.2 大肠杆菌感受态制备 | 第22-23页 |
| 2.2.3 基因克隆的PCR反应 | 第23页 |
| 2.2.4 琼脂糖凝胶电泳 | 第23页 |
| 2.2.5 PCR产物纯化回收 | 第23-24页 |
| 2.2.6 连接与转化 | 第24页 |
| 2.2.7 菌落PCR验证 | 第24-25页 |
| 2.2.8 质粒提取 | 第25页 |
| 2.2.9 质粒酶切验证 | 第25页 |
| 2.3 TAIL-PCR染色体步移技术 | 第25-28页 |
| 第三章 紫杉醇侧链合成3 个基因及其侧翼序列的克隆 | 第28-43页 |
| 3.1 PAM基因及其侧翼序列的克隆 | 第28-32页 |
| 3.1.1 实验方法 | 第28-29页 |
| 3.1.2 PAM基因及其侧翼序列扩增结果与分析 | 第29-32页 |
| 3.2 BAPT基因及其侧翼序列的克隆 | 第32-38页 |
| 3.2.1 实验方法 | 第32-33页 |
| 3.2.2 BAPT基因及其侧翼序列扩增结果与分析 | 第33-38页 |
| 3.3 DBTNBT基因及其侧翼序列的克隆 | 第38-42页 |
| 3.3.1 实验方法 | 第38-39页 |
| 3.3.2 DBTNBT基因及其侧翼序列扩增结果与分析 | 第39-42页 |
| 3.4 本章小结 | 第42-43页 |
| 第四章 紫杉醇生物合成基因序列分析 | 第43-56页 |
| 4.1 材料与方法 | 第43-44页 |
| 4.1.1 紫杉醇合成基因来源 | 第43页 |
| 4.1.2 软件与数据库资源 | 第43-44页 |
| 4.1.3 序列分析方法 | 第44页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第44-55页 |
| 4.2.1 PAM基因分析 | 第44-46页 |
| 4.2.2 BAPT基因结构分析 | 第46-49页 |
| 4.2.3 DBTNBT基因结构分析 | 第49-51页 |
| 4.2.4 紫杉醇生物合成基因偏爱密码子分析 | 第51-55页 |
| 4.3 本章小结 | 第55-56页 |
| 第五章 结论与展望 | 第56-58页 |
| 5.1 结论 | 第56页 |
| 5.2 展望 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 附录 | 第62-76页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77页 |
