| 中文摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-39页 |
| 1. 褐飞虱的基本情况 | 第14-23页 |
| 1.1 褐飞虱的分类地位与地理分布 | 第14-15页 |
| 1.2 褐飞虱的生物学特性 | 第15-16页 |
| 1.3 褐飞虱的细胞学研究 | 第16页 |
| 1.4 对水稻的危害特点 | 第16-18页 |
| 1.5 褐飞虱的生物型研究 | 第18-23页 |
| 1.5.1 褐飞虱生物型种类及田间发生情况 | 第18-19页 |
| 1.5.2 褐飞虱生物型鉴定方法 | 第19-20页 |
| 1.5.3 褐飞虱生物型分子生物学的研究进展 | 第20-21页 |
| 1.5.4 褐飞虱生物型与内共生菌关系研究 | 第21-23页 |
| 2. 微卫星分子标记概况 | 第23-26页 |
| 2.1 微卫星分子标记 | 第23-24页 |
| 2.2 微卫星分子标记的开发 | 第24-26页 |
| 2.2.1 EST-SSR(genic SSR)标记的开发 | 第25页 |
| 2.2.2 基因组SSR(Genomic SSR)标记的开发 | 第25-26页 |
| 3. 遗传连锁图谱的研究概况 | 第26-34页 |
| 3.1 遗传连锁图谱的理论基础 | 第26-27页 |
| 3.2 构建遗传图谱的基本要素 | 第27-31页 |
| 3.2.1 作图群体 | 第27-29页 |
| 3..2.2 遗传标记 | 第29-31页 |
| 3.3 连锁分析 | 第31页 |
| 3.4 遗传连锁图谱的应用 | 第31-33页 |
| 3.4.1 基因定位和克隆 | 第31-32页 |
| 3.4.2 比较基因组学研究 | 第32-33页 |
| 3.5 昆虫遗传连锁图谱的研究进展 | 第33-34页 |
| 4. 水稻抗褐飞虱基因的定位研究 | 第34-37页 |
| 4.1 水稻抗褐飞虱的表型评价体系 | 第34-35页 |
| 4.2 抗褐飞虱基因研究的进展与现状 | 第35-36页 |
| 4.3 抗褐飞虱基因定位与克隆方法 | 第36-37页 |
| 5. 本研究的口的及意义 | 第37-39页 |
| 第二章 褐飞虱EST-SSR分子标记的开发及其遗传多样性分析 | 第39-56页 |
| 1. 引言 | 第39-40页 |
| 2. 材料与方法 | 第40-43页 |
| 2.1 材料 | 第40页 |
| 2.2 CTAB法提取褐飞虱基因组DNA | 第40-41页 |
| 2.3 EST-SSR标记的开发 | 第41-42页 |
| 2.3.1 序列分析和引物设计 | 第41页 |
| 2.3.2 多态性标记的筛选 | 第41-42页 |
| 2.3.3 EST-SSR标记的通用性检测 | 第42页 |
| 2.3.4 聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测 | 第42页 |
| 2.3.5 微卫星标记的命名 | 第42页 |
| 2.4 数据统计分析 | 第42-43页 |
| 3. 结果与分析 | 第43-51页 |
| 3.1 微卫星在褐飞虱EST数据库中的分布特征 | 第43-45页 |
| 3.2 褐飞虱EST-SSR在不同褐飞虱群体中多态性分析 | 第45-47页 |
| 3.3 褐飞虱EST-SSR的通用性检测 | 第47页 |
| 3.4 利用EST-SSR标记对不同褐飞虱群体进行遗传多样性和遗传关系分析 | 第47-50页 |
| 3.5 褐飞虱群体遗传结构分析 | 第50-51页 |
| 4. 讨论 | 第51-56页 |
| 4.1 褐飞虱EST-SSR的特征分析 | 第51-52页 |
| 4.2 褐飞虱EST-SSR多态性分析 | 第52-53页 |
| 4.3 褐飞虱EST-SSR的通用性检测 | 第53页 |
| 4.4 褐飞虱群体的遗传多样性及群体遗传结构 | 第53-56页 |
| 第三章 褐飞虱基因组SSR分子标记的开发 | 第56-68页 |
| 1. 引言 | 第56页 |
| 2. 材料与方法 | 第56-60页 |
| 2.1 材料 | 第56-57页 |
| 2.2 CTAB法提取褐飞虱基因组DNA | 第57页 |
| 2.3 构建微卫星基因组富集文库与测序 | 第57-59页 |
| 2.3.1 褐飞虱基因组DNA的酶切与连接反应 | 第57页 |
| 2.3.2 预扩增 | 第57页 |
| 2.3.3 生物素探针与靶标片段的杂交 | 第57-58页 |
| 2.3.4 磁珠富集微卫星序列片段 | 第58页 |
| 2.3.5 富集片段的预扩增 | 第58页 |
| 2.3.6 富集片段的克隆与测序 | 第58-59页 |
| 2.4 褐飞虱基因组SSR标记的合成与筛选 | 第59-60页 |
| 2.4.1 序列分析和引物设计 | 第59页 |
| 2.4.2 多态性标记的筛选 | 第59页 |
| 2.4.3 聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测 | 第59-60页 |
| 2.5 数据分析 | 第60页 |
| 3. 结果与分析 | 第60-65页 |
| 3.1 褐飞虱基因组DNA的提取 | 第60-61页 |
| 3.2 酶切,连接和预扩增 | 第61页 |
| 3.3 富集与测序 | 第61-62页 |
| 3.4 褐飞虱基因组SSR序列特征分析 | 第62-63页 |
| 3.5 多态性标记的筛选与通用性分析 | 第63-65页 |
| 4. 讨论 | 第65-68页 |
| 第四章 褐飞虱遗传图谱的构建 | 第68-86页 |
| 1. 引言 | 第68页 |
| 2. 材料与方法 | 第68-72页 |
| 2.1 作图群体 | 第68-69页 |
| 2.2 CTAB法提取褐飞虱基因组DNA | 第69页 |
| 2.3 基因型分析 | 第69-71页 |
| 2.4 连锁分析 | 第71-72页 |
| 2.5 图谱长度预测和图谱覆盖率 | 第72页 |
| 3. 结果与分析 | 第72-80页 |
| 3.1 作图群体的构建 | 第72-73页 |
| 3.2 基因型分析 | 第73-74页 |
| 3.3 遗传图谱的构建 | 第74-79页 |
| 3.4 图谱覆盖率 | 第79-80页 |
| 4. 讨论 | 第80-86页 |
| 4.1 作图群体的选择 | 第80-81页 |
| 4.2 SSR标记在作图群体中的基因型分析 | 第81-82页 |
| 4.3 偏分离标记分析 | 第82-83页 |
| 4.4 褐飞虱的遗传连锁图谱 | 第83-84页 |
| 4.5 图谱密度与应用 | 第84-86页 |
| 第五章 水稻Pokkali抗褐飞虱主效基因Bph9的定位研究 | 第86-96页 |
| 1.引言 | 第86-87页 |
| 2. 材料与方法 | 第87-90页 |
| 2.1 材料 | 第87页 |
| 2.1.1 亲本材料及群体材料 | 第87页 |
| 2.1.2 供试褐飞虱 | 第87页 |
| 2.1.3 SSR分子标记 | 第87页 |
| 2.2 苗期抗虫鉴定 | 第87-88页 |
| 2.3 水稻DNA提取与基因型分析 | 第88-89页 |
| 2.4 用集团分离法筛选与抗性基因连锁标记 | 第89页 |
| 2.5 初步定位染色体部分连锁图构建和QTL扫描 | 第89-90页 |
| 3. 结果与分析 | 第90-93页 |
| 3.1 苗期抗虫鉴定结果 | 第90-91页 |
| 3.2 筛选与抗性基因连锁的分子标记 | 第91页 |
| 3.3 Bph9基因的初步定位结果 | 第91-93页 |
| 4. 讨论 | 第93-96页 |
| 第六章 总讨论 | 第96-99页 |
| 参考文献 | 第99-120页 |
| 附录1. 由日本EST数据库开发的351个EST-SSR标记信息 | 第120-148页 |
| 附录2. 在读期间发表及待发表的文章与科研成果 | 第148-149页 |
| 致谢 | 第149页 |
