| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章 导论 | 第14-36页 |
| §1.1 RNA简介 | 第14-18页 |
| §1.2 RNA分子的结构 | 第18-27页 |
| §1.3 RNA折叠动力学 | 第27-34页 |
| §1.4 本文的主要研究内容 | 第34-36页 |
| 第二章 结合自由能曲面与主方程的折叠动力学计算方法 | 第36-59页 |
| §2.1 引言 | 第36-37页 |
| §2.2 基本结构单元——从碱基堆积(stack)到双螺旋(helix) | 第37-39页 |
| §2.3 helix之间的交叠关系 | 第39-41页 |
| §2.4 二级结构之间的转变速率 | 第41-51页 |
| §2.5 折叠动力学计算 | 第51-56页 |
| §2.6 小结 | 第56-59页 |
| 第三章 转录折叠动力学计算方法 | 第59-82页 |
| §3.1 引言 | 第59-61页 |
| §3.2 转录折叠动力学方法——主方程方法的时序性推广 | 第61-65页 |
| §3.3 计算结果 | 第65-78页 |
| §3.4 小结和讨论 | 第78-82页 |
| 第四章 核糖开关 | 第82-92页 |
| §4.1 核糖开关简介 | 第82-85页 |
| §4.2 addA核糖开关和pbuE核糖开关 | 第85-88页 |
| §4.3 计算结果 | 第88-90页 |
| §4.4 结论 | 第90-92页 |
| 第五章 全文总结 | 第92-95页 |
| 参考文献 | 第95-110页 |
| 攻读博士期间完成的工作 | 第110页 |
