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采用线粒体Cytb基因研究九个马品种的系统发育

摘要第5-6页
Abstract第6页
常用词语縮写第8-11页
1 文献综述第11-25页
    1.1 mtDNA概述第11-16页
        1.1.1 哺乳动物mtDNA的特点第11页
        1.1.2 哺乳动物mtDNA的基本结构第11-12页
        1.1.3 Cytb基因第12-14页
            1.1.3.1 Cytb及基因的结构第12-13页
            1.1.3.2 线粒体Cytb基因与马属动物系统发育研究第13-14页
            1.1.3.3 线粒体Cytb基因与其他动物系统发育研究第14页
        1.1.4 mtDNA多态性研究的分析方法第14-16页
            1.1.4.1 限制性酶切片段长度多态性标记第14-15页
            1.1.4.2 DNA单链构象多态性第15页
            1.1.4.3 DNA序列测定第15-16页
    1.2 家马遗传多样性研究进展第16-20页
        1.2.1 细胞水平(染色体)的遗传多样性研究第16页
        1.2.2 生化水平的遗传多样性研究第16-17页
        1.2.3 基因组DNA上遗传多样性研究第17-18页
        1.2.4 线粒体DNA遗传多样性研究第18-19页
        1.2.5 Y染色体DNA遗传多样性研究第19-20页
    1.3 中国家马的起源及品种资源概况第20-24页
        1.3.1 中国家马的起源与驯化第20-21页
        1.3.2 中国家马的类型与分布第21-24页
    1.4 本研究的目的和意义第24-25页
2 材料与方法第25-35页
    2.1 试验材料第25-30页
        2.1.1 样品采集第25-28页
        2.1.2 常用试剂的配制第28-30页
            2.1.2.1 提取基因组DNA所需试剂的配制第28-29页
            2.1.2.2 琼脂糖电泳有关试剂的配制第29-30页
        2.1.3 主要仪器设备第30页
    2.2 试验方法第30-34页
        2.2.1 马全基因组DNA的提取第30-31页
        2.2.2 血液基因组DNA的检测第31-32页
        2.2.3 引物的设计第32页
        2.2.4 引物的稀释与保存第32页
        2.2.5 PCR扩增反应与产物的检测第32-33页
        2.2.6 mtDNA Cytb基因全序列(1140bp)的测序第33页
        2.2.7 mtDNA Cytb部分序列(610bp)的PCR-RFLP的分析第33-34页
        2.2.8 酶切产物琼脂糖电泳检测与基因型判断第34页
    2.3 数据分析第34-35页
        2.3.1 序列分析第34页
        2.3.2 构建单倍型网络关系图第34页
        2.3.3 等位基因频率和基因型频率计算第34-35页
3 结果与分析第35-46页
    3.1 马mtDNA Cytb基因的多态性分析第35-41页
        3.1.1 马血液样品DNA提取结果第35页
        3.1.2 马mtDNA Cytb基因的PCR扩增结果及序列特征第35-39页
            3.1.2.1 马mtDNA Cytb基因的PCR扩增结果第35-36页
            3.1.2.2 马mtDNA Cytb基因全序列的特征第36页
            3.1.2.3 9个马品种间mtDNACytb基因全序列的遗传距离第36-37页
            3.1.2.4 马mtDNA Cytb基因的单倍型分布特征第37-39页
            3.1.2.5 四个地理单元马Cytb基因的单倍型多样度和核苷酸多样度分析第39页
        3.1.3 不同品种马单倍型间的系统发育分析第39-40页
        3.1.4 中国家马及四个地理单元在7个单倍型分支分布第40-41页
    3.2 马mtDNA Cytb基因部分序列的PCR-RFLP分析第41-46页
        3.2.1 马mtDNA Cytb基因序列的酶切位点分析第41页
        3.2.2 马mtDNA Cytb基因部分序列的PCR扩增结果第41-42页
        3.2.3 马mtDNA Cytb基因部分序列的PCR-RFLP分析第42-46页
            3.2.3.1 BamHⅠ的RFLP分析第42-43页
            3.2.3.2 EcoRⅤ的RFLP分析第43页
            3.2.3.3 BamHⅠ和EcoRⅤ酶切的不同基因型(基因)频率的分布第43-45页
            3.2.3.4 BamHⅠ和EcoRⅤ酶切单倍型组合及频率分布第45-46页
4 讨论第46-50页
    4.1 中国家马的遗传多样性第46-47页
        4.1.1 9个马品种的mtDNA单倍型分布特点第46页
        4.1.2 利用PCR-RFLP研究马mtDNA的多态性第46-47页
    4.2 中国家马的母系起源第47-48页
    4.3 中国家马与世界马种起源与驯化第48-50页
5 结论第50-51页
参考文献第51-58页
致谢第58-59页
附件第59-61页

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