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草酸脱羧酵的表达、纯化、菌影包裹及降解草酸的初步研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
主要符号表第13-14页
第一部分 绪论第14-31页
    1.1 尿路结石病简介第14页
    1.2 草酸及草酸降解微生物对机体的影响第14-16页
    1.3 枯草芽孢杆菌草酸脱羧酶性质与结构第16页
    1.4 菌影第16-17页
    1.5 草酸的产生和功能第17-18页
    1.6 高草酸尿症的定义第18页
    1.7 病理生理学和病原学第18-21页
        1.7.1 原发性高草酸尿症第18-19页
        1.7.2 肠源性高草酸尿症第19-20页
        1.7.3 食源性高草酸尿症第20-21页
        1.7.4 特发性高草酸尿症第21页
    1.8 流行病学第21页
    1.9 国际数据统计第21-22页
    1.10 高草酸尿症的年龄分布第22页
    1.11 高草酸尿症性别分布第22-23页
    1.12 高草酸尿症种族的患病率第23页
    1.13 预后诊断第23-24页
    1.14 高草酸尿症的临床研究与分析第24-26页
        1.14.1 临床表现第24-25页
        1.14.2 饮食问卷调查第25页
        1.14.3 常规治疗原则第25-26页
        1.14.4 治疗的原发性高草酸尿症第26页
        1.14.5 大剂量吡哆醇(维生素b6)治疗第26页
    1.15 实验治疗高草酸尿症第26-28页
        1.15.1 产甲酸草酸杆菌的控制第26-27页
        1.15.2. 植物茎-根疗法第27页
        1.15.3. 其他实验治疗第27-28页
    1.16 手术治疗第28页
        1.16.1 碎石术第28页
        1.16.2 肝-肾移植第28页
    1.17 患者的饮食措施第28-29页
    1.18 本研究的目的及意义第29-31页
        1.18.1 研究目的第29页
        1.18.2 研究意义第29-31页
第二部分 实验部分第31-47页
    2.1 实验材料、试剂与仪器第31-37页
        2.1.1 实验菌株、载体和引物第31页
        2.1.2 主要试剂第31-32页
        2.1.3 培养基第32-33页
        2.1.4 实验所用溶剂第33-36页
            2.1.4.1 细菌总DNA抽提的试剂第33页
            2.1.4.2 质粒DNA抽提试剂第33-34页
            2.1.4.3 DNA电泳相关试剂第34页
            2.1.4.4 诱导表达所用试剂第34页
            2.1.4.5 制备超级感受态相关的试剂第34页
            2.1.4.6 SDS-PAGE所用溶剂第34-36页
            2.1.4.7 Bradford法测蛋白质浓度所用试剂第36页
            2.1.4.8 蛋白纯化所用的试剂第36页
        2.1.5 主要仪器与设备第36-37页
    2.2 实验方法第37-47页
        2.2.1 Bacillus subtilis 168中oxdc基因的克隆第37-39页
            2.2.1.1 Bacillus subtilis 168基因组的制备第37-38页
            2.2.1.2 oxdc基因克隆第38-39页
        2.2.2 PCR产物连T载、转化、阳性克隆的筛选第39-40页
            2.2.2.2 PCR产物与T载连接、转化大肠杆菌第39页
            2.2.2.3 感受态细胞DH5α的制备第39-40页
            2.2.2.4 阳性克隆子的筛选第40页
        2.2.3 重组表达载体与诱导表达第40-41页
            2.2.3.1 重组oxdc-pGEX-6p-1表达载体第40-41页
            2.2.3.2 oxdc基因的诱导表达第41页
        2.2.4 GST-OxdC蛋白纯化第41-42页
        2.2.5 GST-OxdC蛋白柱上切除GST标签第42-43页
        2.2.6 考马斯亮蓝法测蛋白浓度第43-44页
        2.2.7 草酸浓度标准曲线的制作第44-45页
        2.2.8 菌影的制备第45-46页
        2.2.9 扫描电子显微镜样品制作第46页
        2.2.10 透射电子显微镜样品制作第46页
        2.2.11 草酸脱羧酶OxdC装载菌影第46-47页
第三部分 实验结果与分析第47-66页
    3.1 oxdc基因的克隆及其生物信息学分析第47-52页
        3.1.1 提取枯草芽孢杆菌168菌株基因组第47页
        3.1.2 OxdC基因的克隆第47-49页
        3.1.3 oxdc基因的生物信息学分析第49-52页
            3.1.3.1 理化性质分析第49-50页
            3.1.3.2 疏水性分析第50-51页
            3.1.3.3 亚细胞定位预测第51-52页
    3.2 原核表达载体的构建第52页
    3.3 蛋白的表达第52-53页
    3.4 GST-OxdC蛋白的纯化第53-54页
    3.5 凝血酶柱上切除GST标签获得OxdC纯酶第54页
    3.6 草酸脱羧酶酶学性质测定第54-56页
        3.6.1 测定最适酶促反应pH第54-55页
        3.6.2 测定最适酶促反应温度第55-56页
    3.7 金属离子对酶促反应的影响第56-57页
    3.8 草酸脱羧酶OxdC酶的稳定性第57-59页
        3.8.1 草酸脱羧酶的pH稳定性第57-58页
        3.8.2 酶的温度稳定性第58-59页
    3.9 菌影的制备第59-64页
        3.9.1 穿孔蛋白E基因信息第59-60页
        3.9.2 重组载体的构建第60页
        3.9.3 菌影的制备结果第60-61页
        3.9.4 扫描电镜与透射电镜观察第61-64页
    3.10 菌影包裹结果第64页
    3.11 菌影包裹草酸脱羧酶蛋白降解草酸的初步实验第64-66页
第四部分 结论与展望第66-68页
参考文献第68-73页
致谢第73页

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