| 中文摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-12页 |
| 1.1 蛋白质的结构 | 第10页 |
| 1.2 计算机分子模拟 | 第10-11页 |
| 1.3 研究对象和研究意义 | 第11-12页 |
| 第二章 理论基础与计算方法 | 第12-20页 |
| 2.1 同源建模 | 第12页 |
| 2.2 分子对接 | 第12-13页 |
| 2.3 Born-Oppenheimer近似 | 第13-14页 |
| 2.4 力场 | 第14-15页 |
| 2.4.1 力场的能量表示 | 第14页 |
| 2.4.2 力场的组成 | 第14-15页 |
| 2.4.3 常用力场模型 | 第15页 |
| 2.5 分子力学及结构优化算法 | 第15-16页 |
| 2.6 分子动力学 | 第16-19页 |
| 2.6.1 分子动力学基本原理 | 第16-17页 |
| 2.6.2 积分算法 | 第17-18页 |
| 2.6.3 温度耦合算法 | 第18-19页 |
| 2.7 结合自由能计算 | 第19-20页 |
| 第三章 分子动力学模拟研究 1,4-二氢吡啶衍生物对钙离子通道的抑制机理 | 第20-44页 |
| 3.1 引言 | 第20-21页 |
| 3.2 理论方法 | 第21-25页 |
| 3.2.1 同源建模 | 第21-22页 |
| 3.2.2 对接计算 | 第22-23页 |
| 3.2.3 分子动力学模拟 | 第23-24页 |
| 3.2.4 线性相互作用能方法评估结合自由能 | 第24-25页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第25-42页 |
| 3.3.1 结构稳定性 | 第25-30页 |
| 3.3.2 LIE计算 | 第30-32页 |
| 3.3.3 DHPs位于IIIS6段和IVS6段之间的缝隙中 | 第32-33页 |
| 3.3.4 DHPs和钙离子通道的相互作用 | 第33-39页 |
| 3.3.5 Cav3.1 钙离子通道和DHPs间的结合位点 | 第39-42页 |
| 3.4 结论 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-50页 |
| 个人简介及攻读硕士学位期间发表论文 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
