基因测序工作流的任务建模及其调度研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 研究背景 | 第11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-15页 |
| 1.2.1 建模相关研究 | 第11-13页 |
| 1.2.2 调度相关研究 | 第13-15页 |
| 1.3 论文的研究工作 | 第15页 |
| 1.4 论文结构 | 第15-17页 |
| 第二章 相关理论与技术 | 第17-27页 |
| 2.1 基因测序流程 | 第17-21页 |
| 2.2 任务调度 | 第21-26页 |
| 2.2.1 任务调度基本概念 | 第21-22页 |
| 2.2.2 典型调度管理策略 | 第22-23页 |
| 2.2.3 回填调度策略 | 第23-25页 |
| 2.2.4 任务调度模拟器Gridsim | 第25-26页 |
| 2.3 本章小结 | 第26-27页 |
| 第三章 计算日志的分析和任务建模 | 第27-55页 |
| 3.1 系统特性分析 | 第27-30页 |
| 3.1.1 集群资源使用分析 | 第28-29页 |
| 3.1.2 集群负载情况 | 第29-30页 |
| 3.2 任务特性分析 | 第30-33页 |
| 3.2.1 任务资源消耗 | 第30-31页 |
| 3.2.2 任务运行规律 | 第31-33页 |
| 3.3 测序工作流分析与建模 | 第33-46页 |
| 3.3.1 测序流程分析 | 第33-43页 |
| 3.3.2 任务聚类 | 第43-45页 |
| 3.3.3 基于Grid Sim的任务建模 | 第45-46页 |
| 3.4 任务模型的评价 | 第46-54页 |
| 3.4.1 评价指标 | 第46页 |
| 3.4.2 数据概率密度对比 | 第46-51页 |
| 3.4.3 数据累计密度对比 | 第51-54页 |
| 3.5 本章小结 | 第54-55页 |
| 第四章 面向测序工作流的调度算法改进 | 第55-71页 |
| 4.1 现有调度问题及改进思路 | 第55-56页 |
| 4.2 工作流FCFS | 第56-57页 |
| 4.2.1 工作流FCFS算法原理 | 第56页 |
| 4.2.2 工作流FCFS算法流程 | 第56-57页 |
| 4.3 改进回填算法 | 第57-65页 |
| 4.3.1 改进回填算法原理 | 第57-61页 |
| 4.3.2 改进回填算法流程 | 第61-65页 |
| 4.4 基于Gridsim的算法实现 | 第65-70页 |
| 4.4.1 FCFS算法实现 | 第65-67页 |
| 4.4.2 回填算法实现 | 第67-70页 |
| 4.5 本章小结 | 第70-71页 |
| 第五章 实验与结果分析 | 第71-81页 |
| 5.1 实验设计 | 第71-74页 |
| 5.1.1 实验平台和步骤 | 第71-72页 |
| 5.1.2 数据集 | 第72-73页 |
| 5.1.3 评价指标 | 第73-74页 |
| 5.2 算法分析对比 | 第74-80页 |
| 5.2.1 FCFS与工作流FCFS | 第74-76页 |
| 5.2.2 简单回填与改进回填 | 第76-77页 |
| 5.2.3 不同队列负载对算法的影响 | 第77-78页 |
| 5.2.4 不同a 因子对算法的影响 | 第78-80页 |
| 5.3 本章小结 | 第80-81页 |
| 第六章 总结与展望 | 第81-83页 |
| 6.1 论文总结 | 第81页 |
| 6.2 今后工作展望 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-86页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 附件 | 第88页 |
