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目标区域捕获高通量测序结合单体型分析技术用于胚胎植入前PKD2基因突变检测

摘要第5-6页
Abstract第6页
第一章 绪论第12-31页
    1.1 疾病与基因第12-13页
    1.2 目标区域富集方法回顾第13-22页
        1.2.1 基于杂交的目标区域富集方法第14-17页
        1.2.2 基于转座子介导片段化的目标区域富集方法第17-18页
        1.2.3 基于分子反向探针的目标区域富集方法第18页
        1.2.4 基于PCR的目标区域富集方法第18-22页
    1.3 单体型回顾第22-25页
        1.3.1 单体型起源第22-23页
        1.3.2 HapMap计划第23-25页
    1.4 植入前遗传学检测研究进展第25-29页
    1.5 本研究的意义第29-31页
第二章 材料与方法第31-46页
    2.1 实验仪器、试剂及耗材第31-32页
        2.1.1 主要实验仪器第31页
        2.1.2 主要实验试剂第31-32页
        2.1.3 主要实验耗材第32页
    2.2 技术路线第32-33页
    2.3 研究对象、知情同意及样本采集第33-35页
        2.3.1 研究对象第33-34页
        2.3.2 知情同意第34页
        2.3.3 样本采集第34-35页
    2.4 外周血DNA提取及单细胞全基因组扩增第35-36页
        2.4.1 外周血DNA提取第35-36页
        2.4.2 单细胞全基因组扩增第36页
    2.5 目标区域捕获高通量测序第36-40页
        2.5.1 目标区域捕获芯片设计第37-38页
        2.5.2 文库制备及目标区域捕获芯片杂交第38页
        2.5.3 文库质控及上机测序第38-40页
    2.6 捕获测序下机数据信息分析第40-43页
        2.6.1 基本数据分析第40-42页
        2.6.2 单体型分析第42-43页
    2.7 Sanger测序验证第43-46页
        2.7.1 引物设计第43-44页
        2.7.2 PCR反应体系第44页
        2.7.3 PCR反应程序第44页
        2.7.4 电泳鉴定第44-45页
        2.7.5 PCR产物纯化第45页
        2.7.6 上机测序第45页
        2.7.7 Sanger测序数据分析第45-46页
第三章 结果与分析第46-54页
    3.1 目标区域捕获高通量测序数据统计第46页
    3.2 单体型分析结果第46-49页
        3.2.1 单体型分析结果 1第46-48页
        3.2.2 单体型分析结果 2第48页
        3.2.3 单体型分析结果 3第48-49页
    3.3 Sanger测序结果第49-51页
    3.4 PKD2突变位点直接测序结果比较第51-53页
    3.5 目标区域捕获测序性别数据结果第53页
    3.6 部分ADO率统计第53-54页
第四章 总结与讨论第54-57页
参考文献第57-63页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第63-64页
致谢第64-65页
附件第65页

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