摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6-7页 |
第1章 绪论 | 第10-18页 |
1.1 研究背景及意义 | 第10页 |
1.2 阿尔兹海默症 | 第10-13页 |
1.2.1 阿尔兹海默症的发病机制 | 第10-12页 |
1.2.2 阿尔兹海默症的生物标记物 | 第12-13页 |
1.3 影像基因组学 | 第13-14页 |
1.4 国内外研究现状 | 第14-15页 |
1.5 主要内容及章节安排 | 第15-18页 |
第2章 实验数据来源及数据的质量控制 | 第18-26页 |
2.1 数据来源 | 第18-21页 |
2.1.1 ADNI数据库 | 第18页 |
2.1.2 ADNI的不同阶段和数据组成 | 第18-20页 |
2.1.3 ADNI的成果 | 第20-21页 |
2.2 影像学数据及数据质量控制 | 第21-22页 |
2.2.1 MRI影像学数据分析 | 第21-22页 |
2.2.2 影像学数据的质量控制 | 第22页 |
2.3 基因组学数据及数据质量控制 | 第22-23页 |
2.3.1 基因组学数据分析 | 第22页 |
2.3.2 基因组学数据的质量控制标准 | 第22-23页 |
2.4 样本的人口学统计 | 第23页 |
2.5 本章小结 | 第23-26页 |
第3章 全基因组关联分析 | 第26-38页 |
3.1 全基因组关联分析原理 | 第26-28页 |
3.1.1 GWAS简介 | 第26-27页 |
3.1.2 GWAS原理 | 第27-28页 |
3.2 线性回归分析 | 第28-31页 |
3.2.1 一元线性回归原理 | 第28-29页 |
3.2.2 多元线性回归原理 | 第29-31页 |
3.3 统计学的评价指标 | 第31-32页 |
3.3.1 p值 | 第31页 |
3.3.2 Bonferroni校正法 | 第31-32页 |
3.4 基于线性回归的GWAS分析 | 第32-36页 |
3.4.1 SNP层次的GWAS分析 | 第32-34页 |
3.4.2 实验结果及分析 | 第34-36页 |
3.5 本章小结 | 第36-38页 |
第4章 距离相关分析 | 第38-46页 |
4.1 相似性度量 | 第38-39页 |
4.2 层次聚类 | 第39-40页 |
4.3 距离相关分析 | 第40-44页 |
4.3.1 实验数据 | 第41页 |
4.3.2 距离相关分析方法 | 第41-44页 |
4.4 本章小结 | 第44-46页 |
第5章 关联分析结果对比 | 第46-64页 |
5.1 GWAS结果及分析 | 第46-48页 |
5.2 距离相关分析结果及分析 | 第48-50页 |
5.3 分析结果比较 | 第50-62页 |
5.3.1 rs34824368—左杏仁核 | 第50-52页 |
5.3.2 rs11157934—左丘脑 | 第52-54页 |
5.3.3 rs10134832—右伏隔核 | 第54-56页 |
5.3.4 rs7945931—右海马体、右伏隔核 | 第56-59页 |
5.3.5 rs1476679、rs5015756—右杏仁核 | 第59-62页 |
5.4 本章小结 | 第62-64页 |
结论 | 第64-66页 |
参考文献 | 第66-72页 |
攻读硕士学位期间发表的论文和取得的科研成果 | 第72-74页 |
致谢 | 第74页 |