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基于相关分析的影像基因组学数据挖掘

摘要第5-6页
abstract第6-7页
第1章 绪论第10-18页
    1.1 研究背景及意义第10页
    1.2 阿尔兹海默症第10-13页
        1.2.1 阿尔兹海默症的发病机制第10-12页
        1.2.2 阿尔兹海默症的生物标记物第12-13页
    1.3 影像基因组学第13-14页
    1.4 国内外研究现状第14-15页
    1.5 主要内容及章节安排第15-18页
第2章 实验数据来源及数据的质量控制第18-26页
    2.1 数据来源第18-21页
        2.1.1 ADNI数据库第18页
        2.1.2 ADNI的不同阶段和数据组成第18-20页
        2.1.3 ADNI的成果第20-21页
    2.2 影像学数据及数据质量控制第21-22页
        2.2.1 MRI影像学数据分析第21-22页
        2.2.2 影像学数据的质量控制第22页
    2.3 基因组学数据及数据质量控制第22-23页
        2.3.1 基因组学数据分析第22页
        2.3.2 基因组学数据的质量控制标准第22-23页
    2.4 样本的人口学统计第23页
    2.5 本章小结第23-26页
第3章 全基因组关联分析第26-38页
    3.1 全基因组关联分析原理第26-28页
        3.1.1 GWAS简介第26-27页
        3.1.2 GWAS原理第27-28页
    3.2 线性回归分析第28-31页
        3.2.1 一元线性回归原理第28-29页
        3.2.2 多元线性回归原理第29-31页
    3.3 统计学的评价指标第31-32页
        3.3.1 p值第31页
        3.3.2 Bonferroni校正法第31-32页
    3.4 基于线性回归的GWAS分析第32-36页
        3.4.1 SNP层次的GWAS分析第32-34页
        3.4.2 实验结果及分析第34-36页
    3.5 本章小结第36-38页
第4章 距离相关分析第38-46页
    4.1 相似性度量第38-39页
    4.2 层次聚类第39-40页
    4.3 距离相关分析第40-44页
        4.3.1 实验数据第41页
        4.3.2 距离相关分析方法第41-44页
    4.4 本章小结第44-46页
第5章 关联分析结果对比第46-64页
    5.1 GWAS结果及分析第46-48页
    5.2 距离相关分析结果及分析第48-50页
    5.3 分析结果比较第50-62页
        5.3.1 rs34824368—左杏仁核第50-52页
        5.3.2 rs11157934—左丘脑第52-54页
        5.3.3 rs10134832—右伏隔核第54-56页
        5.3.4 rs7945931—右海马体、右伏隔核第56-59页
        5.3.5 rs1476679、rs5015756—右杏仁核第59-62页
    5.4 本章小结第62-64页
结论第64-66页
参考文献第66-72页
攻读硕士学位期间发表的论文和取得的科研成果第72-74页
致谢第74页

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