| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 1 绪论 | 第12-27页 |
| 1.1 海洋环境概况 | 第12-13页 |
| 1.2 海洋微生物多样性的分类 | 第13-14页 |
| 1.3 海洋微生物多样性的重要价值 | 第14-18页 |
| 1.4 细菌多相分类学研究方法 | 第18-26页 |
| 1.4.1 基因型研究方法(Genetic methods) | 第19-21页 |
| 1.4.1.1 16S rRNA基因序列比对及系统发育树的构建 | 第19-20页 |
| 1.4.1.2 DDH | 第20-21页 |
| 1.4.1.3 基因组G+C含量 | 第21页 |
| 1.4.2 化学分类研究方法(Chemotaxonomy methods) | 第21-24页 |
| 1.4.2.1 细胞壁分析 | 第22页 |
| 1.4.2.2 极性脂分析 | 第22-23页 |
| 1.4.2.3 脂肪酸分析 | 第23页 |
| 1.4.2.4 呼吸醌分析 | 第23-24页 |
| 1.4.3 表型研究方法(Phenotypic methods) | 第24-25页 |
| 1.4.3.1 形态学特征 | 第24-25页 |
| 1.4.3.2 生理生化特征 | 第25页 |
| 1.4.4 细菌多相分类学的未来 | 第25-26页 |
| 1.5 本研究的意义 | 第26-27页 |
| 2 南海北部海域细菌多样性及群落结构的研究 | 第27-43页 |
| 2.1 材料和方法 | 第27-30页 |
| 2.1.1 样品来源 | 第27页 |
| 2.1.2 主要培养基 | 第27页 |
| 2.1.3 菌株的分离纯化和富集 | 第27-28页 |
| 2.1.3.1 菌株的分离纯化 | 第28页 |
| 2.1.3.2 菌株的富集培养 | 第28页 |
| 2.1.4 菌株的保藏 | 第28页 |
| 2.1.4.1 甘油保藏 | 第28页 |
| 2.1.4.2 冷冻干燥保藏 | 第28页 |
| 2.1.5 细菌基因组少量抽提、PCR扩增、序列比对16S rRNA基因及系统发育树构建 | 第28-30页 |
| 2.1.5.1 细菌DNA的少量抽提 | 第29页 |
| 2.1.5.2 PCR扩增 | 第29-30页 |
| 2.1.5.3 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第30页 |
| 2.1.5.4 测序及序列比对 | 第30页 |
| 2.1.5.5 构建系统发育树 | 第30页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第30-40页 |
| 2.2.1 可培养细菌分离结果与多样性分析 | 第30-35页 |
| 2.2.2 可培养细菌群落结构分析 | 第35-38页 |
| 2.2.3 多样性及群落结构讨论 | 第38-39页 |
| 2.2.4 疑似新种分离结果 | 第39-40页 |
| 2.3 本章小结 | 第40-43页 |
| 2.3.1 结果总结 | 第40-41页 |
| 2.3.2 问题分析及改良方法 | 第41-43页 |
| 3 南海北部海域深海区两株细菌的多相分类学鉴定 | 第43-73页 |
| 3.1 材料和方法 | 第43-56页 |
| 3.1.1 菌株来源 | 第43页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第43-44页 |
| 3.1.3 主要培养基 | 第44页 |
| 3.1.4 菌株活化与保藏 | 第44-45页 |
| 3.1.5 基因型特征 | 第45-46页 |
| 3.1.5.1 16S rRNA基因的全序列获得及系统发育树的构建 | 第45-46页 |
| 3.1.5.2 序列比对与系统发育树的构建 | 第46页 |
| 3.1.5.3 G+C含量测定 | 第46页 |
| 3.1.6 化学分类实验 | 第46-49页 |
| 3.1.6.1 呼吸醌实验 | 第47-48页 |
| 3.1.6.2 极性脂实验 | 第48-49页 |
| 3.1.6.3 脂肪酸实验 | 第49页 |
| 3.1.7 表型特征 | 第49-56页 |
| 3.1.7.1 形态特征 | 第49-50页 |
| 3.1.7.2 生理生化特征 | 第50-56页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第56-72页 |
| 3.2.1 菌株HSF7~T的多相分类学研究结果 | 第56-64页 |
| 3.2.1.1 基因型特征 | 第56-57页 |
| 3.2.1.2 化学分类特征 | 第57-60页 |
| 3.2.1.3 表型特征 | 第60-62页 |
| 3.2.1.4 小结及新种描述 | 第62-64页 |
| 3.2.2 菌株HSF11~T的多相分类学研究结果 | 第64-72页 |
| 3.2.2.1 基因型特征 | 第64-65页 |
| 3.2.2.2 化学分类特征 | 第65-68页 |
| 3.2.2.3 表型特征 | 第68-70页 |
| 3.2.2.4 小结及新种描述 | 第70-72页 |
| 3.3 本章小结 | 第72-73页 |
| 4 结论与展望 | 第73-76页 |
| 4.1 结论与创新 | 第73-74页 |
| 4.1.1 主要结论 | 第73-74页 |
| 4.1.2 主要创新点 | 第74页 |
| 4.2 展望 | 第74-76页 |
| 附录 | 第76-79页 |
| 参考文献 | 第79-87页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第87-89页 |
| 致谢 | 第89页 |
