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饲喂肉牛抗菌药对牛源大肠杆菌Ⅰ型整合子相关的耐药性影响的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-12页
插图和附表清单第12-14页
缩略词表第14-15页
1 引言第15-45页
   ·抗菌药概述第15-20页
     ·抗菌药的定义和历史第15页
     ·抗菌药的分类第15-18页
     ·抗菌药的作用机制第18页
     ·世界范围内抗菌药的年消耗量第18-19页
     ·人类医疗健康及农业领域内抗菌药的使用第19页
     ·畜牧业生产中抗菌药的使用与人类源细菌耐药性之间的关系第19-20页
   ·抗菌药在肉牛业生产中的应用第20-25页
     ·治疗性用药第23页
     ·预防性用药第23页
     ·促生长抗菌药的使用第23页
     ·预防性用药对肉牛饲育场疾病的控制第23-24页
     ·为什么使用抗菌药促生长剂第24-25页
     ·抗菌药促生长剂的作用机制第25页
   ·细菌耐药性研究进展第25-32页
     ·细菌耐药性的产生第25-27页
       ·细菌固有耐药性和基因突变导致的耐药性第26页
       ·细菌间基因传递产生的耐药性第26-27页
     ·细菌耐药性现状第27-29页
     ·细菌耐药机制第29-32页
       ·细菌主动外排系统第29-30页
       ·酶对抗菌药的灭活及修饰第30-31页
       ·抗菌药物作用靶位的改变第31页
       ·细菌外膜通透性的改变第31-32页
     ·细菌的交叉和多重耐药机制第32页
   ·细菌耐药基因研究第32-35页
     ·四环素耐药基因研究第32-33页
     ·β-内酰胺类药物耐药基因研究第33页
     ·磺胺耐药基因研究第33-34页
     ·氨基糖苷类药物耐药基因研究第34页
     ·氯霉素耐药基因研究第34页
     ·甲氧苄啶耐药基因研究第34-35页
   ·细菌整合子-基因盒系统研究进展第35-40页
     ·细菌整合子研究第35-36页
     ·细菌基因盒研究第36-39页
     ·整合子-基因盒系统在细菌耐药传播中的作用第39-40页
   ·大肠杆菌概述第40-42页
     ·大肠杆菌生物学特性第40-41页
     ·监测大肠杆菌耐药性的重要性第41-42页
   ·畜牧业生产中抗菌药的使用对人类食品健康安全的威胁第42-43页
     ·食用动物中耐药性的出现和选择第42页
     ·抗药性的发生和保持第42-43页
     ·耐药细菌通过食物链和其它途径传递给人类第43页
   ·本研究目的意义和主要内容第43-45页
2 研究一: 耐四环素大肠杆菌的分离鉴定及耐药性研究第45-59页
   ·试验材料第45-48页
     ·试验动物及对照菌株第45-46页
     ·主要仪器设备第46-47页
     ·主要试剂配制及平板制作第47页
     ·药品、培养基及其它试剂第47-48页
       ·药品第47-48页
       ·培养基第48页
       ·其它试剂第48页
   ·方法第48-51页
     ·大肠杆菌的分离第48-49页
     ·API 20E 生化鉴定第49页
     ·纯培养传代第49页
     ·菌种保存第49页
     ·试验用大肠杆菌的筛选第49-50页
     ·耐四环素大肠杆菌分离株体外抗菌药敏感性测定第50-51页
       ·细菌药敏试验第50页
       ·细菌药敏试验结果判定第50-51页
       ·SAS 统计分析第51页
   ·结果第51-57页
     ·大肠杆菌分离鉴定第51-52页
     ·耐四环素大肠杆菌体外抗菌药敏感性研究第52-57页
   ·讨论第57-59页
3 研究二:耐四环素大肠杆菌Ⅰ型整合子流行性的检测与基因盒结构分析第59-82页
   ·试验材料第59-61页
     ·试验菌株第59页
     ·培养基及主要试剂的配制第59-60页
     ·生化试剂第60-61页
     ·主要仪器与设备第61页
   ·方法第61-69页
     ·菌株体外药敏试验第61-62页
     ·PCR 检测整合子及耐药基因盒第62-69页
       ·引物设计及合成第62页
       ·PCR 模板的制备第62-63页
       ·整合酶基因 PCR 检测第63-64页
         ·整合酶基因 PCR 反应体系第63页
         ·整合酶基因 PCR 反应条件第63-64页
       ·基因盒插入区 PCR 检测第64页
         ·整合酶基因 PCR 反应体系第64页
         ·基因盒插入区 PCR 反应条件第64页
       ·PCR 产物电泳分析第64页
       ·基因盒插入区 PCR 产物酶切图谱分析第64-65页
       ·基因盒插入区 PCR 产物的回收第65-66页
       ·基因盒插入区目的片段的连接第66页
       ·重组质粒的转化第66-67页
       ·目的片段成功克隆的确认第67页
       ·目的片段测序及可变区结构的确定第67页
       ·耐四环素大肠杆菌种系发生分型鉴定第67-69页
       ·SAS 统计分析第69页
   ·结果第69-79页
     ·整合酶基因扩增及序列分析第69-70页
       ·整合酶基因的扩增第69页
       ·整合酶基因的测序结果及同源性分析第69-70页
     ·整合子基因盒插入区 PCR 扩增及序列分析第70-71页
       ·整合子基因盒插入区的扩增第70-71页
       ·整合子基因盒插入区酶切图谱分析第71页
     ·整合子基因盒插入区测序及结构分析第71-77页
     ·不同处理组来源耐四环素大肠杆菌中Ⅰ型整合子流行性比较第77-78页
     ·整合子阳性和阴性菌株耐药表型分析第78页
     ·PCR 扩增鉴定菌株种系发生分型第78-79页
   ·讨论第79-82页
4 研究三:携带Ⅰ型整合子耐四环素大肠杆菌 PFGE 分子分型研究第82-90页
   ·试验材料第82-84页
     ·试验菌株第82页
     ·培养基及主要试剂的配制第82-83页
     ·生化试剂第83页
     ·主要仪器与设备第83-84页
   ·方法第84-86页
     ·菌株培养第84页
     ·菌悬液制备第84页
     ·胶块制作第84页
     ·细胞裂解第84页
     ·胶块清洗第84-85页
     ·限制性内切酶消化第85页
     ·制胶第85页
     ·电泳第85-86页
     ·染色、成像第86页
     ·数据分析第86页
   ·结果第86-89页
     ·酶切分析第86页
     ·不同分离源携带整合子耐四环素大肠杆菌PFGE 分析第86-89页
   ·讨论第89-90页
5 研究四:耐四环素大肠杆菌中与耐药性相关耐药因子的检测分析第90-106页
   ·试验材料第90-91页
     ·试验菌株第90页
     ·生化试剂第90-91页
     ·主要仪器与设备第91页
   ·方法第91-96页
     ·引物设计及合成第91页
     ·PCR 模板的制备第91页
     ·PCR 检测耐药决定因子第91-96页
       ·四环素类耐药基因PCR 检测第93-94页
       ·β-内酰胺类耐药基因 PCR 检测第94页
       ·磺胺类耐药基因 PCR 检测第94-95页
       ·氨基糖苷类耐药基因 PCR 检测第95页
       ·氯霉素类耐药基因 PCR 检测第95页
       ·甲氧苄啶耐药基因 PCR 检测第95-96页
     ·PCR 产物电泳分析第96页
     ·SAS 统计分析第96页
   ·结果第96-104页
     ·tet(A)、tet(B)和tet(C)基因的PCR 扩增第96-97页
     ·blaTEM1、blaPSE1和blaOXA1基因的 PCR 扩增第97页
     ·sul1、sul2 和 sul3 基因的 PCR 扩增第97-98页
     ·strA-strB 和aadA 基因的 PCR 扩增第98-99页
     ·cat 和floR 基因的PCR 扩增第99页
     ·dfrA1、dfrA5、dfrA12 和dfrA17 基因的 PCR 扩增第99-101页
     ·不同处理组来源耐四环素大肠杆菌中各种耐药基因流行性比较第101-103页
     ·不同耐药基因与整合子间的相关性分析第103-104页
   ·讨论第104-106页
6 结论第106-107页
7 创新点第107-108页
致谢第108-109页
参考文献第109-124页
附录第124-138页
作者简介第138页

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