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中国epichlo(e|¨)真菌中NRPS基因的检测与分析

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
文献综述 非核糖体肽合成酶(NRPS)与禾本科植物内生真菌次级代谢产物研究概况第11-49页
    1 非核糖体肽合成酶的结构及功能第11-21页
        1.1 腺苷酸化结构域第14-15页
        1.2 肽基载体蛋白第15-17页
        1.3 缩合结构域第17-18页
        1.4 硫酯酶结构域第18-19页
        1.5 修饰结构域第19-21页
    2 禾本科植物内生真菌及其生物碱第21-33页
        2.1 Epichloe内生真菌第21-22页
        2.2 各类生物碱代表化合物的生物活性和作用第22-24页
        2.3 生物碱的合成机制第24-33页
    3 非核糖体肽合成酶的应用策略第33-38页
        3.1 NRPS生物合成的模板及方法第34-35页
        3.2 基因组背景下NRPS基因的探索第35-38页
    4 本研究的主要内容及意义第38-39页
    参考文献第39-49页
第一章 雀麦和鼠茅内生真菌的检测、分离和鉴定第49-76页
    摘要第49-50页
    1 材料与方法第50-55页
        1.1 材料第50-51页
        1.2 方法第51-55页
    2 结果与分析第55-63页
        2.1 样本采集、鉴定和内生真菌的检测第55-56页
        2.2 真菌的分离及形态学特征第56-58页
        2.3 分子系统发育分析第58-63页
        2.4 鼠茅分离菌株的鉴定第63页
    3 雀麦分离菌株的分类学描述第63-65页
    4 讨论第65-73页
    参考文献第73-76页
第二章 我国EPICHLOE真菌NRPS基因分布调查第76-93页
    摘要第76-77页
    1 材料与方法第77-80页
        1.1 材料第77-78页
        1.2 方法第78-80页
    2 结果与分析第80-87页
        2.1 Epchloe真菌NRPS基因分布第80页
        2.2 NRPS基因的序列特征第80-81页
        2.3 NRPS2、NRPS5和NRPS8的系统发育学研究第81-87页
    3 讨论第87-90页
    参考文献第90-93页
第三章 基于PCR的鹅观草内生真菌检测方法第93-102页
    摘要第93-94页
    1 材料和方法第94-96页
        1.1 植物材料第94页
        1.2 方法第94-96页
    2 结果与分析第96-99页
        2.1 真菌及植物基因组的完整性验证第96页
        2.2 真菌中NRPS8基因的检测第96页
        2.3 含菌和无菌植物及组培苗中NRPS8基因的检测第96-97页
        2.4 真菌与植物序列一致性分析第97-99页
    3 讨论第99-100页
    参考文献第100-102页
第四章 E.FESTUCAE E2368基因组中NRPS预测与分析第102-134页
    摘要第102-103页
    1 材料与方法第103-112页
        1.1 材料第103-104页
        1.2 方法第104-112页
    2 结果与分析第112-128页
        2.1 候选序列第112-114页
        2.2 候选序列重叠群中的NRPS结构分析第114-115页
        2.3 基因组预测的NRPS腺苷酸化结构域(Adomain)的系统发育分析第115-128页
    3 讨论第128-131页
        3.1 NRPS基因功能的多样性第128页
        3.2 NRPS基因在基因组上的分布第128-129页
        3.3 NRPS基因的菌株差异性第129页
        3.4 预测的NRPS基因簇的功能预测第129-130页
        3.5 NRPS引物设计的问题第130-131页
    参考文献第131-134页
综合讨论第134-140页
    参考文献第138-140页
全文结论第140-142页
附录第142-154页
攻读硕士期间发表的学术论文第154-155页
致谢第155页

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