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水稻种子内生细菌群落多样性研究及一株新菌种的鉴定

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
第1章 绪论第12-19页
    1.1 植物内生菌及种子内生菌的概述第12页
    1.2 种子内生菌多样性研究主要方法第12-14页
        1.2.1 传统培养方法第12-13页
        1.2.2 非培养方法第13-14页
    1.3 种子微生态系统中的细菌类群第14-16页
    1.4 影响种子内生细菌群落的相关因素第16-17页
        1.4.1 种子的基因型与种子内生细菌群落的相关性第16页
        1.4.2 种子的营养成分与种子内生细菌群落的相关性第16-17页
        1.4.3 种子的内部组织部位与种子内生细菌群落的相关性第17页
        1.4.4 种子的形态结构与种子内生菌群落的相关性第17页
    1.5 水稻种子内生细菌的研究进展第17页
    1.6 研究的目的及意义第17-19页
第2章 三个优异杂交水稻亲本种子不同发育时期内生细菌多样性的研究第19-40页
    2.1 材料第19-20页
        2.1.1 种子样品第19页
        2.1.2 仪器和设备第19-20页
        2.1.3 培养基第20页
        2.1.4 主要试剂第20页
    2.2 方法第20-23页
        2.2.1 种子表面灭菌第20页
        2.2.2 内生细菌的分离、纯化及保藏第20-21页
        2.2.3 内生细菌菌株的初步表型特征描述第21页
        2.2.4 内生细菌16SrRNA基因片段的扩增第21-22页
        2.2.5 PCR扩增产物的检测及纯化第22页
        2.2.6 细菌16SrRNA基因片段序列测定及其系统发育分析第22-23页
        2.2.7 核酸序列收录号第23页
    2.3 结果与分析第23-39页
        2.3.1 可培养内生细菌的分离第23页
        2.3.2 内生细菌16SrRNA基因片段的扩增第23-24页
        2.3.3 种子不同发育时期内生细菌系统发育分析第24-37页
        2.3.4 三个品种种子不同发育时期内生细菌群落比较第37-39页
    2.4 小结第39-40页
第3章 超级杂交水稻“深两优5814”种子内生细菌多样性的非培养方法研究第40-48页
    3.1 材料第40-41页
        3.1.1 种子样品第40页
        3.1.2 仪器和设备第40页
        3.1.3 培养基第40-41页
        3.1.4 主要试剂第41页
    3.2 方法第41-44页
        3.2.1 种子表面灭菌第41页
        3.2.2 种子总DNA的提取第41-42页
        3.2.3 种子中内生细菌16SrRNA基因片段的扩增第42-43页
        3.2.4 PCR扩增产物的检测及回收第43页
        3.2.5 种子内生细菌16SrRNA基因克隆文库的构建第43页
        3.2.6 种子内生细菌16SrRNA基因测序及系统发育分析第43-44页
        3.2.7 核酸序列收录号第44页
        3.2.8 克隆文库的评价第44页
    3.3 实验结果与分析第44-46页
        3.3.1 种子基因组DNA的提取和PCR扩增与回收第44-45页
        3.3.2 种子内生细菌16SrRNA基因克隆文库构建及检测第45页
        3.3.3 克隆文库评价第45-46页
        3.3.4 种子内生细菌群落结构分析第46页
    3.4 小结第46-48页
第4章 超级杂交水稻“深两优5814”种子内生细菌多样性的可培养方法研究第48-56页
    4.1 材料第48-49页
        4.1.1 种子样品第48页
        4.1.2 仪器和设备第48页
        4.1.3 培养基第48-49页
        4.1.4 主要试剂第49页
    4.2 方法第49-51页
        4.2.1 种子表面灭菌第49页
        4.2.2 内生细菌的分离、纯化及保藏第49-50页
        4.2.3 内生细菌菌株的初步表型特征描述第50页
        4.2.4 内生细菌 16SrRNA基因片段的扩增第50页
        4.2.5 PCR扩增产物的检测及纯化第50页
        4.2.6 细菌16SrRNA基因片段序列测定及其系统发育分析第50页
        4.2.7 核酸序列收录号第50-51页
    4.3 实验结果与分析第51-55页
        4.3.1 可培养内生细菌的分离第51页
        4.3.2 内生细菌16SrRNA基因的PCR扩增结果第51页
        4.3.3 内生细菌16SrRNA基因序列与Blast比对结果第51-55页
    4.4 小结第55-56页
第5章 一株水稻种子内生酵母菌新种的鉴定第56-67页
    5.1 材料第56-58页
        5.1.1 菌株第56页
        5.1.2 仪器和设备第56-57页
        5.1.3 主要培养基第57页
        5.1.4 主要试剂第57-58页
    5.2 方法第58-63页
        5.2.1 内生酵母菌的分离、纯化及保藏第58页
        5.2.2 表型特征鉴定第58-59页
        5.2.3 生理生化特征第59-60页
        5.2.4 基于遗传学的分类学鉴定第60-62页
        5.2.5 基于化学类特征分析第62-63页
    5.3 结果第63-66页
        5.3.1 表型特征第63页
        5.3.2 生理生化特征第63-64页
        5.3.3 遗传分类学鉴定第64页
        5.3.4 化学类特征第64-66页
    5.4 小结第66-67页
总结第67-68页
参考文献第68-75页
攻读学位期间的研究成果第75-76页
收获与致谢第76页

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