| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 引言 | 第14-22页 |
| 1.1 日本鲭的地理分布 | 第14-15页 |
| 1.2 日本鲭的生物学特性 | 第15页 |
| 1.2.1 生态习性 | 第15页 |
| 1.2.2 繁殖习性与洄游 | 第15页 |
| 1.3 线粒体DNA和微卫星技术在鱼类种群遗传研究中的应用 | 第15-16页 |
| 1.3.1 mtDNA标记在鲭科鱼类遗传多样性研究中的应用 | 第15-16页 |
| 1.3.2 微卫星标记在鱼类种群遗传多样性研究中的应用 | 第16页 |
| 1.4 日本鲭的遗传多样性研究现状 | 第16-18页 |
| 1.4.1 日本鲭的资源状况 | 第16-17页 |
| 1.4.2 日本鲭群体遗传学研究现状 | 第17-18页 |
| 1.5 太平洋的各海域地理特征和洋流模式 | 第18页 |
| 1.6 本研究的内容与意义 | 第18-22页 |
| 1.6.1 本研究的内容 | 第18-19页 |
| 1.6.2 技术路线 | 第19页 |
| 1.6.3 本研究的目的与意义 | 第19-22页 |
| 第二章 基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)序列分析11个日本鲭群体遗传多样性 | 第22-39页 |
| 2.1 材料与方法 | 第22-26页 |
| 2.1.1 实验试剂与仪器 | 第22-23页 |
| 2.1.2 实验样本 | 第23-24页 |
| 2.1.3 基因组DNA的提取 | 第24页 |
| 2.1.4 线粒体COI基因序列的PCR扩增、纯化与测序 | 第24-25页 |
| 2.1.5 实验数据处理与分析 | 第25-26页 |
| 2.2 结果与分析 | 第26-36页 |
| 2.2.1 mtCOI基因序列特征 | 第26-27页 |
| 2.2.2 单倍型在群体中的分布及遗传关系 | 第27-29页 |
| 2.2.3 日本鲭COI序列的遗传距离及系统进化分析 | 第29-31页 |
| 2.2.4 日本鲭种群遗传结构分析 | 第31-33页 |
| 2.2.5 种群扩张分析 | 第33-36页 |
| 2.3 讨论 | 第36-39页 |
| 2.3.1 日本鲭遗传多样性 | 第36页 |
| 2.3.2 群体遗传结构 | 第36-37页 |
| 2.3.3 群体动态分析 | 第37-39页 |
| 第三章 基于线粒体细胞色素B（Cytb）序列分析11个日本鲭群体遗传多样性 | 第39-54页 |
| 3.1 材料与方法 | 第39-40页 |
| 3.1.1 实验试剂与仪器 | 第39页 |
| 3.1.2 实验样本 | 第39页 |
| 3.1.3 基因组DNA的提取 | 第39页 |
| 3.1.4 线粒体DNA Cytb序列的PCR扩增、纯化与测序 | 第39-40页 |
| 3.1.5 实验数据处理与分析 | 第40页 |
| 3.2 结果与分析 | 第40-51页 |
| 3.2.1 Cytb基因序列特征与群体遗传多样性 | 第40-41页 |
| 3.2.2 单倍型在群体中的分布及遗传关系 | 第41-44页 |
| 3.2.3 日本鲭Cytb序列的遗传距离及系统进化分析 | 第44-46页 |
| 3.2.4 日本鲭种群遗传结构分析 | 第46-48页 |
| 3.2.5 种群扩张分析 | 第48-51页 |
| 3.3 讨论 | 第51-54页 |
| 3.3.1 群体遗传多样性 | 第51页 |
| 3.3.2 群体遗传结构与分化 | 第51-52页 |
| 3.3.3 种群历史动态 | 第52-54页 |
| 第四章 基于线粒体控制区（D-loop）序列分析11个日本鲭群体遗传多样性 | 第54-67页 |
| 4.1 材料与方法 | 第54-55页 |
| 4.1.1 实验试剂与仪器 | 第54页 |
| 4.1.2 实验样本 | 第54页 |
| 4.1.3 基因组DNA的提取 | 第54页 |
| 4.1.4 线粒体DNA Cytb序列的PCR扩增、纯化与测序 | 第54-55页 |
| 4.1.5 实验数据处理与分析 | 第55页 |
| 4.2 结果与分析 | 第55-65页 |
| 4.2.1 线粒体D-loop基因序列特征与群体遗传多样性 | 第55页 |
| 4.2.2 控制区结构分析 | 第55-57页 |
| 4.2.3 单倍型在群体中的分布及遗传关系 | 第57-58页 |
| 4.2.4 日本鲭D-loop序列的遗传距离及系统进化分析 | 第58-61页 |
| 4.2.5 日本鲭种群遗传结构分析 | 第61-62页 |
| 4.2.6 种群扩张分析 | 第62-65页 |
| 4.3 讨论 | 第65-67页 |
| 4.3.1 日本鲭遗传多样性 | 第65页 |
| 4.3.2 群体遗传结构与分化 | 第65-66页 |
| 4.3.3 群体动态分析 | 第66页 |
| 4.3.4 系统地理格局 | 第66-67页 |
| 第五章 日本鲭10对多态微卫星引物的开发及近缘种扩增 | 第67-72页 |
| 5.1 材料与方法 | 第67-69页 |
| 5.1.1 样本采集 | 第67页 |
| 5.1.2 主要实验试剂及仪器 | 第67页 |
| 5.1.3 实验方法 | 第67页 |
| 5.1.4 总DNA提取 | 第67页 |
| 5.1.5 微卫星基因组文库的构建与克隆 | 第67-68页 |
| 5.1.6 微卫星多态性位点的筛选 | 第68页 |
| 5.1.7 数据分析 | 第68-69页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第69-72页 |
| 5.2.1 多态性引物的筛选 | 第69-70页 |
| 5.2.2 微卫星引物多态性分析 | 第70-71页 |
| 5.2.3 日本鲭微卫星引物近缘种扩增分析 | 第71-72页 |
| 第六章 日本鲭的遗传多样性及演化历史研究：微卫星标记 | 第72-81页 |
| 6.1 材料与方法 | 第72-73页 |
| 6.1.1 样本采集 | 第72页 |
| 6.1.2 主要实验试剂及仪器 | 第72页 |
| 6.1.3 总DNA提取 | 第72页 |
| 6.1.4 微卫星扩增和分型 | 第72-73页 |
| 6.1.5 数据分析 | 第73页 |
| 6.2 结果与分析 | 第73-79页 |
| 6.2.1 种群遗传多样性分析 | 第73-76页 |
| 6.2.2 种群结构分析 | 第76-79页 |
| 6.3 讨论 | 第79-81页 |
| 小结 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-93页 |
| 附录 | 第93-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
