| 符号说明 | 第4-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第12-18页 |
| 1.1 核桃黑斑病和褐色顶端坏死病研究进展 | 第12-13页 |
| 1.1.1 核桃黑斑病 | 第12页 |
| 1.1.2 核桃褐色顶端坏死病 | 第12-13页 |
| 1.2 植物病原细菌的鉴定 | 第13-14页 |
| 1.2.1 16S rDNA基因序列分析 | 第13-14页 |
| 1.2.2 多位点序列分析 | 第14页 |
| 1.3 细菌遗传多样性研究方法 | 第14-17页 |
| 1.3.1 重复片段PCR基因指纹分析 | 第14-16页 |
| 1.3.1.1 ERIC-PCR | 第15页 |
| 1.3.1.2 BOX-PCR | 第15-16页 |
| 1.3.2 限制性片段长度多态性 | 第16页 |
| 1.3.3 随机扩增多态性DNA | 第16页 |
| 1.3.4 扩增片段长度多态性 | 第16-17页 |
| 1.4 成团泛菌研究进展 | 第17-18页 |
| 1.5 本研究的目的意义 | 第18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-28页 |
| 2.1 材料 | 第18-21页 |
| 2.2 方法 | 第21-28页 |
| 2.2.1 菌株分离纯化 | 第21页 |
| 2.2.2 菌株形态鉴定 | 第21-22页 |
| 2.2.2.1 菌落形态观察 | 第21-22页 |
| 2.2.2.2 透射电镜观察 | 第22页 |
| 2.2.3 菌株生化特性 | 第22-23页 |
| 2.2.3.2 糖酵解实验 | 第22页 |
| 2.2.3.3 淀粉水解实验 | 第22-23页 |
| 2.2.3.4 明胶液化实验 | 第23页 |
| 2.2.4 致病性测定 | 第23页 |
| 2.2.4.1 接种菌液制备 | 第23页 |
| 2.2.4.2 接种方法 | 第23页 |
| 2.2.5 16s rDNA和MLSA分析 | 第23-27页 |
| 2.2.5.1 供试菌株总DNA的提取 | 第23-24页 |
| 2.2.5.2 PCR扩增和测序 | 第24-26页 |
| 2.2.5.3 序列分析 | 第26-27页 |
| 2.2.6 基于ERIC-PCR和BOX-PCR的供试菌株遗传多样性分析 | 第27-28页 |
| 2.2.6.1 ERIC-PCR和BOX-PCR扩增 | 第27页 |
| 2.2.6.2 电泳图谱分析 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-47页 |
| 3.1 菌体形态观察 | 第28-29页 |
| 3.2 菌株生化特性 | 第29-30页 |
| 3.3 致病性测定 | 第30-31页 |
| 3.4 16S rDNA序列分析 | 第31-34页 |
| 3.5 MLSA分析 | 第34-41页 |
| 3.5.1 单基因序列系统发育分析 | 第34-38页 |
| 3.5.2 多基因序列串联MLSA分析 | 第38-41页 |
| 3.6 基于ERIC-PCR和BOX-PCR的成团泛菌遗传多样性分析 | 第41-47页 |
| 3.6.1 ERIC-PCR和BOX-PCR指纹图谱 | 第41-42页 |
| 3.6.2 成团泛菌的聚类分析 | 第42-44页 |
| 3.6.3 成团泛菌的主坐标分析 | 第44-45页 |
| 3.6.4 成团泛菌居群的遗传多样性 | 第45-47页 |
| 4 讨论 | 第47-52页 |
| 4.1 关于成团泛菌的形态特征和生化特性 | 第47页 |
| 4.2 成团泛菌的系统发育研究 | 第47-49页 |
| 4.3 成团泛菌的遗传多样性 | 第49-52页 |
| 4.3.1 成团泛菌的聚类分析 | 第49-50页 |
| 4.3.2 成团泛菌居群遗传多样性 | 第50-51页 |
| 4.3.3 成团泛菌的遗传多样性与地理来源的关系 | 第51-52页 |
| 5 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
