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基于组学的果梅雌蕊败育分子机理

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-14页
缩略词表第14-16页
第一章 文献综述第16-36页
 1 植物花发育机制第16-21页
   ·引言第16页
   ·花的发端第16-17页
   ·花发育及器官特异性:经典ABC(E)模型第17-19页
   ·花分生组织的调控及雌蕊发育第19-21页
 2 小RNAs分类及miRNAs研究概况第21-28页
   ·小RNAs的定义和分类第21-22页
   ·miRNA分子的发现及体内代谢第22-23页
   ·miRNA的作用机制第23-24页
   ·miRNA在花发育中的生物学功能第24-28页
     ·miR156是植物生长周期转变的主要调控因素第25-26页
     ·miR172在植物开花发育中的功能与调控作用第26-27页
     ·miR159/miR319的功能与调控作用第27-28页
     ·其他与花发育相关的miRNA第28页
 3 高通量测序技术的发展第28-31页
   ·高通量测序原理第29页
   ·高通量测序技术的应用第29-31页
     ·小RNA高通量测序第30-31页
     ·数字基因表达谱第31页
 4 蛋白质组学技术的发展第31-33页
   ·蛋白质组学的研究内容第31-32页
   ·蛋白质组学的研究技术第32-33页
 5 果梅花发育及雌蕊败育的研究现状第33-34页
 6 本文的研究内容第34-36页
   ·目的和意义第34页
   ·研究内容第34-36页
第二章 果梅品种开花生物学特性和花粉萌发率比较第36-44页
 摘要第36页
 ABSTRACT第36-37页
 1 材料与方法第37-38页
   ·植物材料第37页
   ·试验方法第37-38页
     ·完全花与不完全花比例调查第37页
     ·花粉量及花粉萌发率测定第37-38页
 2 结果与分析第38-41页
   ·果梅品种间不完全花比例比较第38-39页
   ·果梅品种间花粉量比较第39-40页
   ·果梅品种间花粉萌发率比较第40-41页
 3 讨论第41-44页
第三章 果梅雌蕊分化进程研究及相关生理指标测定第44-56页
 摘要第44页
 ABSTRACT第44-46页
 1 材料和方法第46-48页
   ·供试材料第46页
   ·化学试剂及仪器耗材第46页
   ·方法第46-48页
     ·花器官质量调查第46页
     ·雌蕊分化进程研究第46-47页
     ·相关生理指标测定第47页
     ·数据处理第47-48页
 2 结果和分析第48-53页
   ·花器官发育状况分析第48页
   ·雌蕊分化进程分析第48-52页
   ·生理指标分析第52-53页
     ·可溶性糖含量分析第52-53页
     ·可溶性蛋白质含量分析第53页
     ·淀粉含量分析第53页
 3 讨论和结论第53-56页
第四章 果梅小分子RNA高通量测序及雌蕊发育相关microRNA的差异表达分析第56-80页
 摘要第56页
 ABSTRACT第56-59页
 1 材料和方法第59-62页
   ·植物材料第59页
   ·化学试剂和仪器设备第59页
   ·小RNA文库的构建及高通量测序第59页
   ·小RNA高通量测序的生物信息学分析第59-60页
   ·雌蕊发育相关的miRNA的差异表达分析第60页
   ·果梅miRNAs的预测第60-61页
   ·荧光定量PCR验证miRNA第61-62页
 2 结果和分析第62-77页
   ·果梅花芽小RNA的高通量测序第62-64页
   ·已知miRNA及进化保守性的鉴定第64-69页
   ·果梅中新的miRNAs及碱基偏向性的鉴定第69-74页
   ·完全花和不完全花中差异表达的miRNAs第74-75页
   ·差异表达的miRNAs靶基因预测第75-77页
 3 讨论第77-80页
   ·果梅小RNAs的高通量测序第77-78页
   ·与开花及花发育相关的miRNAs第78页
   ·潜在的涉及果梅雌蕊败育的miRNAs第78-80页
第五章 利用数字基因表达谱鉴定与果梅雌蕊败育相关的基因第80-100页
 摘要第80页
 ABSTRACT第80-82页
 1 材料与方法第82-88页
   ·植物材料第82-83页
   ·试剂与设备第83页
   ·cDNA文库构建及高通量测序第83-84页
   ·数字基因表达谱的生物信息学分析第84页
   ·基因表达注释及表达量的标准化第84页
   ·反义链转录分析第84-85页
   ·差异表达基因的筛选第85页
   ·Gene Ontology功能及Pathway显著性富集分析第85-86页
   ·荧光定量PCR验证差异表达的基因第86-88页
 2 结果第88-97页
   ·果梅完全花与不完全花中数字基因表达谱第88-90页
   ·果梅完全花和不完全花数字基因表达谱中序列的注释分析第90-91页
   ·果梅完全花和不完全花中差异基因表达注释和通路富集分析第91-93页
   ·果梅完全花和不完全花中基因表达谱的比较第93-96页
   ·荧光定量PCR验证差异表达基因第96-97页
 3 讨论第97-100页
   ·逆境胁迫相关基因第97-98页
   ·参与RNA代谢的相关基因第98页
   ·细胞壁构成:果胶及脂肪酸代谢第98-100页
第六章 果梅雌蕊败育的蛋白质组学比较分析第100-118页
 摘要第100页
 ABSTRACT第100-101页
 1 材料与方法第101-105页
   ·植物材料第101页
   ·蛋白提取第101-102页
   ·双向凝胶电泳第102-105页
     ·等电聚焦(IPG-IEF)第102-103页
     ·胶条平衡第103页
     ·第二向SDS-PAGE胶电泳第103页
     ·考马斯亮蓝染色第103页
     ·图谱获取及数据分析第103-104页
     ·差异表达蛋白点的胶内酶解和质谱分析第104页
     ·数据库搜索和生物信息学分析第104-105页
 2 结果第105-114页
   ·果梅完全花和不完全花蛋白质组比较第105页
   ·果梅完全花和不完全花差异表达蛋白质的比较分析第105-110页
   ·蛋白鉴定及功能分类第110-114页
 3 讨论第114-118页
   ·与脂肪酸和甾醇生物合成相关的蛋白质第114页
   ·与木质素合成相关的蛋白质第114-115页
   ·与多胺合成相关的蛋白质第115页
   ·与细胞壁构成相关的蛋白质第115页
   ·与活性氧代谢相关的蛋白质第115-118页
参考文献第118-140页
全文结论第140-142页
主要创新点第142-144页
攻读博士期间发表的学术论文第144-146页
附录第146-164页
致谢第164页

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