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盐胁迫下胡杨表达谱微阵列分析及差异表达基因的功能解析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
目录第11-14页
引言第14-16页
1 文献综述第16-29页
   ·植物抗盐性研究进展第16-17页
     ·盐胁迫对植物的影响第16-17页
   ·植物的耐盐机制第17-23页
     ·离子平衡的调控机制第17-20页
     ·活性氧平衡的调控机制第20页
     ·盐胁迫下的植物信号转导第20-23页
   ·胡杨抗盐性分子机制的研究进展第23-25页
     ·离子平衡调控的分子机制第23-24页
     ·活性氧调控的分子机制第24页
     ·胡杨功能基因组学研究第24-25页
   ·应用生物芯片与生物信息学技术研究植物抗盐性第25-27页
   ·本研究的目的与意义第27-29页
     ·目的意义第27-28页
     ·研究内容第28-29页
2 盐胁迫下胡杨和群众杨叶片离子平衡和活性氧平衡调控第29-36页
   ·材料和方法第29-30页
     ·植物材料与盐处理第29-30页
     ·植物叶片离子含量测定第30页
     ·植物叶片过氧化氢含量测定第30页
   ·实验结果第30-34页
     ·盐处理对胡杨与群众杨叶片离子含量的影响第30-31页
     ·盐处理对胡杨与群众杨叶片H_2O_2水平的影响第31-32页
     ·NaCl和ABA对杨树叶片H_2O_2水平的影响第32-34页
   ·讨论第34-35页
   ·小结第35-36页
3 胡杨RNA的提取与芯片的杂交扫描第36-45页
   ·材料和方法第36-37页
     ·盐处理方法第36-37页
     ·取材方式第37页
   ·改进的热硼砂法提取胡杨与群众杨的叶片总RNA第37-38页
     ·提取步骤第37页
     ·提取结果第37-38页
   ·AFFYMETRIX芯片的标记杂交与扫描第38-43页
     ·Affymetrix表达谱的实验操作流程第38-40页
     ·芯片杂交和扫描结果第40-41页
     ·芯片质量分析第41-43页
   ·讨论第43-44页
   ·小结第44-45页
4 微阵列数据的生物信息学分析第45-59页
   ·谱学分析第45-46页
   ·实验结果第46-56页
     ·表达谱数据分析结果第46-48页
     ·非诱导型差异-非胁迫下胡杨与群众杨的表达谱差异第48-54页
     ·诱导型差异-盐胁迫下胡杨与群众杨的表达谱差异第54-56页
   ·胡杨与群众杨共表达基因分析第56页
   ·讨论第56-59页
5 胡杨重要抗盐基因的表达分析第59-87页
   ·材料和方法第59-64页
     ·芯片数据分析见第四章4.1.1数据处理方法第59页
     ·荧光定量PCR方法及引物第59-64页
   ·离子平衡调控相关基因的表达第64-75页
     ·K~+平衡相关基因第64-67页
     ·钠氢离子逆向转运系统基因第67-75页
   ·调节活性氧平衡相关基因的表达第75-77页
     ·SOD基因第75页
     ·APX、POD和CAT基因第75-76页
     ·PRX,TRX and GRX基因第76页
     ·GST基因第76-77页
   ·光合作用相关基因的表达第77-79页
     ·光合作用相关基因的富集第77-78页
     ·上调基因的功能注释和分析第78-79页
   ·应用荧光定量PCR技术对芯片结果进行验证第79-81页
     ·实验结果第80-81页
   ·讨论第81-86页
     ·K~+平衡调控基因第81-83页
     ·Na~+平衡调控基因第83-84页
     ·ROS平衡调控基因第84页
     ·光合作用调控基因第84-85页
     ·荧光定量PCR验证显示芯片结果真实可靠第85-86页
   ·小结第86-87页
6 不同耐盐性杨树H~+-ATPASE基因启动子克隆与初步的功能分析第87-94页
   ·实验材料与方法第87-90页
     ·实验材料第87-88页
     ·质粒菌株和反应酶第88页
     ·其他试剂等第88页
     ·引物合成第88页
     ·试验方法第88-90页
   ·实验结果第90-91页
     ·胡杨与灰杨的序列比对与分析第90页
     ·胡杨与灰杨启动子功能分析第90-91页
   ·讨论第91-94页
7 结论第94-96页
   ·结论第94-95页
   ·未来研究计划第95-96页
参考文献第96-107页
个人简介第107-108页
博士在读期间成果清单第108-109页
导师简介第109-110页
致谢第110页

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