| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-26页 |
| ·骨骼肌研究进展 | 第14-18页 |
| ·骨骼肌发育 | 第14-16页 |
| ·肌纤维类型 | 第16-18页 |
| ·肌纤维类型与肉质 | 第18页 |
| ·转录组测序研究进展 | 第18-21页 |
| ·RNA-seq原理 | 第19页 |
| ·RNA-seq测序平台 | 第19-20页 |
| ·RNA-seq的生物信息学分析 | 第20-21页 |
| ·RNA-seq在猪育种中的应用 | 第21页 |
| ·miRNA研究进展 | 第21-24页 |
| ·miRNA的生成 | 第22页 |
| ·miRNA作用机制 | 第22-23页 |
| ·miRNA在骨骼肌发育中的作用 | 第23-24页 |
| ·miRNA在肌纤维类型中的作用 | 第24页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 第二章 猪不同肌纤维转录组文库构建和高通量测序 | 第26-34页 |
| ·材料及方法 | 第26-28页 |
| ·实验动物及样品采集 | 第26页 |
| ·仪器和设备 | 第26页 |
| ·试剂 | 第26页 |
| ·实验方法 | 第26-28页 |
| ·结果与分析 | 第28-32页 |
| ·测序质量评估 | 第28-30页 |
| ·参考序列比对 | 第30-32页 |
| ·讨论 | 第32-33页 |
| ·小结 | 第33-34页 |
| 第三章 猪不同肌肉组织文库差异基因筛选及注释 | 第34-41页 |
| ·材料与方法 | 第34-36页 |
| ·基因比对分析 | 第34页 |
| ·差异基因筛选与注释 | 第34-35页 |
| ·基因结构优化 | 第35页 |
| ·新转录本预测和注释 | 第35页 |
| ·可变剪切 | 第35页 |
| ·SNP分析 | 第35-36页 |
| ·结果与分析 | 第36-39页 |
| ·基因比对统计 | 第36页 |
| ·差异基因筛选 | 第36-37页 |
| ·基因结构优化 | 第37页 |
| ·新转录本预测和注释 | 第37页 |
| ·可变剪切分析 | 第37-38页 |
| ·SNP分析 | 第38-39页 |
| ·讨论 | 第39-40页 |
| ·小结 | 第40-41页 |
| 第四章 猪不同肌肉组织转录组数据深度挖掘 | 第41-53页 |
| ·材料与方法 | 第41-42页 |
| ·GO功能显著性富集分析 | 第41-42页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第42页 |
| ·蛋白互作网络构建 | 第42页 |
| ·结果与分析 | 第42-51页 |
| ·猪不同类型肌肉组织的GO功能分析 | 第42-43页 |
| ·不同肌肉组织中的差异基因通路分析 | 第43-44页 |
| ·肌肉相关基因的鉴定和筛选 | 第44-46页 |
| ·蛋白互作网络构建 | 第46-47页 |
| ·猪不同肌肉组织差异基因在肌纤维相关的Pathway分析 | 第47-51页 |
| ·讨论 | 第51页 |
| ·小结 | 第51-53页 |
| 第五章 基因SUFU在成肌细胞增殖分化中的作用 | 第53-59页 |
| ·材料和方法 | 第53-54页 |
| ·实验动物及细胞 | 第53页 |
| ·实验试剂 | 第53页 |
| ·小鼠组织样品采集 | 第53页 |
| ·C2C12成肌细胞培养及转染 | 第53-54页 |
| ·组织或细胞总RNA提取 | 第54页 |
| ·RT-qPCR检测SUFU及相关标志基因表达 | 第54页 |
| ·数据分析 | 第54页 |
| ·结果与分析 | 第54-57页 |
| ·SUFU基因在小鼠中的组织表达谱 | 第54-55页 |
| ·SUFU基因在成肌细胞增殖和分化过程中的时序表达 | 第55页 |
| ·SUFU基因的siRNA干扰效率检测 | 第55-56页 |
| ·干扰SUFU对成肌细胞增殖的作用 | 第56页 |
| ·干扰SUFU对成肌细胞分化的作用 | 第56-57页 |
| ·讨论 | 第57-58页 |
| ·小结 | 第58-59页 |
| 第六章 过表达miR4235P抑制C2C12成肌细胞增殖 | 第59-66页 |
| ·材料与方法 | 第59-61页 |
| ·实验试剂和仪器 | 第59页 |
| ·实验动物及细胞 | 第59页 |
| ·细胞培养及转染 | 第59-60页 |
| ·细胞总RNA提取 | 第60页 |
| ·实时定量PCR检测 | 第60页 |
| ·蛋白免疫印记 | 第60页 |
| ·EdU检测 | 第60页 |
| ·流式细胞分析 | 第60页 |
| ·CCK-8 检测 | 第60-61页 |
| ·数据分析 | 第61页 |
| ·结果与分析 | 第61-64页 |
| ·mi R4235p的组织表达谱 | 第61页 |
| ·mi R4235p在C2C12成肌细胞增殖中的时序表达 | 第61-62页 |
| ·转染miR4235p的Agomir后超表达效率检测 | 第62页 |
| ·过表达miR4235p抑制细胞周期基因的mRNA和蛋白表达水平 | 第62-63页 |
| ·过表达miR4235p抑制细胞增殖 | 第63-64页 |
| ·讨论 | 第64-65页 |
| ·小结 | 第65-66页 |
| 第七章 过表达miR4235P抑制C2C12成肌细胞分化 | 第66-72页 |
| ·材料与方法 | 第66-67页 |
| ·实验试剂和仪器 | 第66页 |
| ·细胞培养及转染 | 第66页 |
| ·实时定量PCR | 第66页 |
| ·蛋白免疫印记 | 第66页 |
| ·免疫荧光检测肌管形成 | 第66-67页 |
| ·数据统计分析 | 第67页 |
| ·结果与分析 | 第67-70页 |
| ·mi R4235p在C2C12成肌细胞分化中的时序表达 | 第67页 |
| ·转染miR4235p后超表达效率检测 | 第67-68页 |
| ·超表达miR4235p抑制成肌分化标志基因的mRNA和蛋白表达 | 第68-69页 |
| ·超表达miR4235p抑制肌管的形成 | 第69-70页 |
| ·讨论 | 第70-71页 |
| ·小结 | 第71-72页 |
| 结论 | 第72-73页 |
| 创新点 | 第73-74页 |
| 进一步研究内容 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 附录 | 第81-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 作者简介 | 第90页 |
