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白菜花青苷和黄酮醇苷自然变异及遗传机制研究

摘要第1-8页
Abstract第8-14页
第一章 引言第14-30页
   ·花青苷和黄酮醇苷概述第14-19页
     ·花青苷和黄酮醇苷的结构和种类第14-16页
     ·花青苷和黄酮醇苷的生理功能第16页
     ·花青苷和黄酮醇苷的提取纯化和定性定量分析方法第16-19页
   ·花青苷和黄酮醇苷的生物合成及调控和转运机制第19-23页
     ·花青苷和黄酮醇苷生物合成途径第19-20页
     ·花青苷和黄酮醇苷生物合成调控第20-23页
     ·植物中花青苷的储运机制第23页
   ·芸薹属中花青苷和黄酮醇苷合成基因研究第23-24页
   ·高通量测序技术在基因定位中的应用第24-28页
     ·MutMap:高通量测序定位突变位点的方法第25-27页
     ·QTL-seq:用重测序方法进行数量性状基因座(QTL)定位的方法第27-28页
     ·全基因组关联分析(GWAS)定位候选基因第28页
   ·选题背景与目的意义第28-30页
第二章 白菜类作物花青苷和黄酮醇苷自然变异特点第30-46页
   ·材料与方法第31-35页
     ·实验材料第31-33页
     ·试剂第33页
     ·紫菜薹、紫芜菁和紫色小白菜花青苷的组织定位第33-34页
     ·白菜中花青苷和黄酮醇苷的提取第34页
     ·LC-MS 分析第34-35页
     ·花青苷和黄酮醇苷半定量分析第35页
   ·结果与分析第35-44页
     ·紫菜薹、紫芜菁和紫色小白菜叶片花青苷分布特点第35页
     ·紫菜薹、紫芜菁和紫色小白菜花青苷代谢物谱分析第35-38页
     ·紫菜薹、紫芜菁和紫色小白菜花青苷代谢物谱的特征第38-39页
     ·白菜黄酮醇苷代谢物谱分析第39-41页
     ·不同白菜黄酮醇苷含量分析第41-44页
   ·讨论第44-46页
第三章 白菜花青苷和黄酮醇苷生物合成基因预测及表达分析第46-74页
   ·材料与方法第47页
     ·白菜中花青苷和黄酮醇苷生物合成基因鉴定所需的数据库第47页
     ·白菜花青苷和黄酮醇苷同源基因的鉴定与分析第47页
     ·系统发生分析和遗传进化树的构建第47页
     ·花青苷和黄酮醇苷合成相关基因表达分析第47页
   ·结果与分析第47-71页
     ·利用比较基因组学鉴定白菜中花青苷和黄酮醇苷合成基因第47-53页
     ·白菜中花青苷和黄酮醇苷生物合成结构基因第53-58页
     ·白菜中花青苷和黄酮醇苷生物合成调节和转运基因第58-65页
     ·白菜花青苷和黄酮醇苷合成相关基因表达分析第65-71页
   ·讨论第71-74页
     ·花青苷和黄酮醇苷合成基因在白菜中发生了过保留第71-72页
     ·白菜花青苷和黄酮醇苷合成结构基因通过全基因组和串联重复复制方式扩增第72页
     ·花青苷合成负调节基因在白菜中被更多的保留第72-73页
     ·花青苷和黄酮醇苷合成基因表达分析揭示了白菜中这两类次生代谢产物的变异特点第73-74页
第四章 紫菜薹中控制花青苷积累的 QTL 定位第74-82页
   ·材料与方法第74-76页
     ·实验材料第74-75页
     ·PH 示差法测定花青苷含量第75页
     ·DNA 提取及标记分析第75-76页
     ·遗传图谱构建及 QTL 定位分析第76页
   ·结果与分析第76-80页
     ·紫菜薹紫色性状特性及 F2 群体花青苷含量分析第76-77页
     ·遗传图谱的构建第77-78页
     ·控制紫菜薹花青苷积累的 QTL 定位第78-79页
     ·定位区域候选基因分析第79-80页
   ·讨论第80-82页
     ·紫菜薹紫色性状为数量性状第80页
     ·本研究构建了第一个紫菜薹的遗传连锁图谱第80-81页
     ·本研究主效 QTL 是控制白菜花青苷积累的新位点第81页
     ·BrEGL3.1 和 BrEGL3.2 是紫菜薹中控制花青苷积累的候选基因第81-82页
第五章 紫色小白菜叶片紫色基因定位第82-87页
   ·材料与方法第82-84页
     ·F_2遗传分离群体的构建第82页
     ·亲本、F_1和 F_2部分株系花青苷提取与测定第82页
     ·超级池的构建和 DNA 提取第82-84页
     ·亲本和超级池重测序第84页
     ·超级池重测序分析和候选基因定位第84页
   ·结果与分析第84-86页
     ·紫色小白菜表型和紫色性状遗传规律第84页
     ·超级池重测序法定位紫色基因第84-85页
     ·定位区域基因分析第85-86页
   ·讨论第86-87页
第六章 白菜黄酮醇苷含量表达谱相关性和全基因组关联分析第87-123页
   ·材料与方法第87-88页
     ·实验材料第87页
     ·表达谱测定与分析第87页
     ·全基因组重测序分析第87页
     ·黄酮醇苷含量基因表达谱相关性分析第87页
     ·全基因组关联分析第87-88页
   ·结果与分析第88-122页
     ·黄酮醇苷含量基因表达谱相关性分析第88-107页
     ·黄酮醇苷含量全基因组关联分析第107-122页
   ·讨论第122-123页
第七章 全文结论第123-125页
参考文献第125-142页
致谢第142-143页
作者简历第143页
博士研究生在读期间发表文章第143页

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