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利用RNA-seq技术挖掘胡萝卜抽薹开花相关基因

摘要第1-7页
Abstract第7-11页
第一章 文献综述第11-23页
   ·我国胡萝卜生产及育种现状第11-13页
     ·我国胡萝卜生产现状第11-12页
     ·胡萝卜育种目标和相关研究进展第12-13页
   ·植物抽薹开花研究进展第13-17页
     ·抽薹开花发生的条件第13-14页
     ·抽薹开花性状的遗传规律第14页
     ·抽薹开花的调控途径第14-16页
     ·FLC 基因在其他作物中的研究进展第16-17页
   ·转录组测序技术(RNA-seq)及其在植物差异表达中的应用第17-21页
     ·差异基因表达研究方法比较第17-18页
     ·RNA-Seq 原理和分析方法第18-19页
     ·RNA-Seq 在植物差异表达基因研究中的应用第19-21页
   ·研究目的与意义第21-22页
   ·技术路线第22-23页
第二章 胡萝卜先期抽薹遗传及环境调控研究第23-31页
   ·材料和方法第23-25页
     ·材料第23-24页
     ·胡萝卜先期抽薹遗传规律研究第24页
     ·生长环境对先期抽薹发生研究第24页
     ·光周期对先期抽薹发生影响第24页
     ·春化时间对种根抽薹发生影响第24-25页
     ·春化温度对先期抽薹发生影响第25页
   ·结果分析第25-29页
     ·胡萝卜先期抽薹遗传分析第25-26页
     ·生长环境对先期抽薹发生的影响第26-27页
     ·光周期对先期抽薹发生的影响第27-28页
     ·春化时间对种根抽薹发生的影响第28-29页
     ·春化温度对先期抽薹发生的影响第29页
   ·讨论第29-31页
第三章 胡萝卜抽薹开花相关基因的挖掘第31-46页
   ·材料和方法第31-34页
     ·植物材料培养和处理第31-32页
     ·样品准备和 RNA 提取第32页
     ·RNA 测序及测序数据组装第32-33页
     ·基因功能注释和抽薹开花基因的挖掘第33页
     ·候选基因的 RT-PCR 验证第33-34页
   ·结果与分析第34-44页
     ·转录组测序及组装结果第34-35页
     ·功能注释结果第35-37页
     ·抽薹开花相关基因的挖掘第37-42页
     ·候选基因的 RT-PCR 验证第42-44页
   ·讨论第44-46页
第四章 胡萝卜 FLC 同源基因的表达分析第46-57页
   ·材料和方法第46-49页
     ·DcFLCs 基因的生物信息学分析第46页
     ·DcFLCs 表达多样性分析第46-47页
     ·DcFLCs 在种根春化中的表达分析第47页
     ·DcFLCs 在植株春化中的表达分析第47-48页
     ·DcFLCs 在不同光周期下的表达分析第48页
     ·qPCR 内参基因的筛选第48-49页
   ·结果与分析第49-55页
     ·DcFLCs 基因的生物信息学分析第49-50页
     ·DcFLCs 基因表达多样性分析第50-51页
     ·qPCR 内参基因的选择第51-52页
     ·目的基因扩增效率检测和标准曲线第52页
     ·DcFLCs 在种根春化过程中的表达变化第52-53页
     ·DcFLCs 在植株春化过程中的表达变化第53-54页
     ·DcFLCs 在不同光周期下的表达变化第54-55页
   ·讨论第55-57页
第五章 全文结论第57-58页
参考文献第58-69页
致谢第69-70页
作者简历第70页

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