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siRNA化学修饰位点特异性的机理研究

摘要第1-5页
Abstract第5-11页
第一章 前言第11-40页
   ·RNA 干扰(RNA interference, RNAi)简介第11-18页
     ·RNAi 的发现第11-12页
     ·RNAi 的机制第12-16页
     ·RNAi 中的其它成员第16-18页
   ·Argonaute(AGO)蛋白简介第18-25页
     ·Argonaute 蛋白的分类第19-20页
     ·Argonaute 蛋白的结构第20-22页
     ·Argonaute 蛋白与小 RNA 的装载第22-25页
   ·siRNA 的脱靶效应第25-30页
     ·siRNA 非特异性靶向引起的脱靶效应第25-28页
     ·siRNA 激活细胞免疫反应引起的脱靶效应第28-30页
   ·siRNA 的血清稳定性第30-33页
   ·siRNA 化学修饰简介第33-39页
     ·siRNA 的化学修饰类型第33-38页
     ·2’-糖环修饰位点与 siRNA 活性关系的简介第38-39页
   ·实验目的第39-40页
第二章 材料和方法第40-52页
   ·实验材料第40-46页
     ·实验仪器与耗材第40-41页
     ·实验试剂与溶液第41-46页
   ·实验方法第46-51页
     ·寡核苷酸的制备第46-47页
     ·siRNA/miRNA 靶序列载体的构建及提取第47-48页
     ·细胞培养与转染第48页
     ·萤光素酶活性测定第48-49页
     ·RNA-IP第49页
     ·实时荧光定量 PCR第49-50页
     ·蛋白质序列比对第50页
     ·光谱法测定 Tm 值第50-51页
   ·统计学方法第51-52页
第三章 实验结果第52-80页
   ·siRNA 化学修饰位点特异性现象的发现和验证第52-58页
     ·化学修饰位点特异性现象的发现第52-53页
     ·化学修饰位点特异性现象的验证第53-55页
     ·位点特异性现象在 siRNA 多位点共修饰中的应用第55-57页
     ·2’-糖环修饰对于细胞活性的影响第57-58页
   ·14 位点对 2’-糖环修饰容忍性差的机理研究第58-63页
     ·14 位点 2’-糖环修饰对于 siRNA 的 Tm 值的影响第58-59页
     ·14 位点 2’-OMe 修饰对 AGO 2 蛋白装载 siRNA 能力的影响第59-60页
     ·14 位点修饰的 siRNA 活性下降存在其它机制第60-62页
     ·14 位点修饰现象的结构学解释第62-63页
   ·14 位点与 L2 环作用模型在 miRNA 通路中的验证第63-67页
     ·AGO 蛋白家族同源性分析第63-65页
     ·miRNA 活性检测质粒构建第65-66页
     ·14 位点修饰对于 miRNA 基因沉默功能的影响第66-67页
   ·14 位点修饰在抑制正义链脱靶效应中的应用第67-71页
     ·报告基因检测 14 位点修饰对 siRNA 正义链脱靶效应的影响第67-69页
     ·内源系统检测 14 位点修饰对 siRNA 正义链脱靶效应的影响第69-71页
   ·14,16 位点对 2’-修饰容忍性的比较第71-72页
   ·本研究对 2’-修饰文献中的一些现象的解释第72-76页
   ·实验结果总结第76-80页
     ·siRNA 化学修饰位点特异性现象的发现和验证第76页
     ·14 位点对 2’-糖环修饰容忍性差的机理研究第76-77页
     ·14 位点与 L2 环作用模型在 miRNA 通路中的验证第77-78页
     ·14 位点修饰在抑制正义链脱靶效应中的应用第78页
     ·14,16 位点对 2’-修饰容忍性的比较第78-79页
     ·本研究对 2’-修饰文献中一些现象的解释第79-80页
第四章 实验讨论第80-83页
   ·siRNA 化学修饰位点特异性的前期探索第80页
   ·14 位点化学修饰特异性的机制模型第80-81页
   ·siRNA 理性化学修饰策略探讨第81-83页
参考文献第83-94页
缩略语表第94-97页
附录第97-98页
致谢第98页

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