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水稻农艺和品质若干性状的全基因组初步关联分析

致谢第1-5页
摘要第5-6页
Abstract第6-7页
目录第7-10页
第一章 文献综述第10-28页
   ·前言第10页
   ·水稻农艺性状的遗传研究进展第10-14页
   ·稻米营养品质及研究进展第14-15页
   ·稻米淀粉品质及遗传研究进展第15-17页
   ·全基因组关联分析在水稻遗传育种中的应用第17-23页
     ·关联分析第17-18页
     ·水稻全基因组SNP的检测第18-20页
       ·基因芯片技术检测SNP第18-19页
       ·高通量直接重测序检测SNP第19-20页
     ·全基因组关联分析研究程序第20-23页
       ·水稻种质材料的选择第20-21页
       ·水稻群体结构和群体连锁不平衡(LD)的分析第21-22页
       ·水稻目标性状的选择及其表型的鉴定第22页
       ·水稻全基因组关联分析方法第22-23页
   ·水稻全基因组关联分析(GWAS)研究进展及问题展望第23-26页
     ·水稻全基因组关联分析(GWAS)研究进展第23-24页
     ·问题与展望第24-26页
   ·本研究的目的及意义第26-27页
 附图第27-28页
第二章 农艺性状关联分析第28-43页
   ·材料与方法第28-30页
     ·水稻材料第28-29页
     ·农艺性状测定第29页
     ·分子标记SNP选择第29页
     ·群体结构与主成分分析第29-30页
     ·数据统计分析第30页
     ·QTL定位第30页
   ·结果与分析第30-37页
     ·群体结构分析第30-31页
     ·不同品种农艺性状方差分析第31-33页
       ·2011年20个品种农艺性状第33页
       ·2012年20个品种农艺性状第33页
     ·相关性分析第33-36页
     ·关联作图的模型比较第36页
     ·全基因组关联分析定位QTL第36-37页
   ·讨论第37-41页
 附图第41-43页
第三章 稻米营养品质关联分析第43-52页
   ·稻米营养品质测定第43-44页
     ·多酚类物质含量测定第43页
     ·类黄酮类物质含量测定第43页
     ·原花青素含量测定第43页
     ·抗氧化性活性测定第43-44页
       ·ABTS~(·+)法第44页
       ·DPPH法第44页
   ·结果与分析第44-49页
     ·糙米营养性状方差分析及比较第44-45页
     ·相关性分析第45-47页
     ·全基因组关联分析定位QTL第47-49页
   ·讨论第49-51页
 附图第51-52页
第四章 稻米淀粉品质的关联分析第52-63页
   ·稻米淀粉品质检测方法第52-54页
     ·表观直链淀粉含量(AAC)测定第52页
     ·淀粉粘滞性谱(RVA profile)测定第52-54页
   ·结果与分析第54-59页
     ·稻米淀粉品质方差分析第54页
     ·2011稻米淀粉品质比较第54-55页
     ·2012稻米淀粉品质比较第55-56页
     ·相关性分析第56-57页
     ·全基因组关联分析定位QTL第57-59页
   ·讨论第59-61页
 附图第61-63页
参考文献第63-70页
作者简历第70页

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