| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 缩略词表 | 第7-8页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-28页 |
| ·微生物分类鉴定标识 | 第12-16页 |
| ·形态特征 | 第12页 |
| ·生理生化特征 | 第12-13页 |
| ·免疫学标识 | 第13页 |
| ·细胞化学组分特征 | 第13-14页 |
| ·遗传标识 | 第14-16页 |
| ·其它 | 第16页 |
| ·微生物分类鉴定方法 | 第16-23页 |
| ·形态分类鉴定方法 | 第16-17页 |
| ·生理生化分类鉴定方法 | 第17页 |
| ·免疫学分类鉴定方法 | 第17-18页 |
| ·化学分类鉴定方法 | 第18页 |
| ·遗传分类鉴定方法 | 第18-23页 |
| ·微生物商用鉴定系统 | 第23页 |
| ·微生物资源规模化分类鉴定中的共性技术问题 | 第23-26页 |
| ·微生物分类鉴定标识的选择 | 第23-24页 |
| ·微生物基因组 DNA 制备方法 | 第24-25页 |
| ·参照数据库 | 第25-26页 |
| ·本课题立题依据和研究内容 | 第26-28页 |
| 第二章 快捷高通量制备微生物分子鉴定标识的方法学研究 | 第28-48页 |
| ·材料与方法 | 第28-33页 |
| ·化学试剂与工具酶 | 第28-29页 |
| ·微生物菌种 | 第29-30页 |
| ·寡核苷酸引物 | 第30-31页 |
| ·实验仪器 | 第31页 |
| ·培养基与培养条件 | 第31-32页 |
| ·微生物菌体的制备 | 第32页 |
| ·DNA 含量的测定 | 第32页 |
| ·基因扩增 | 第32-33页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第33页 |
| ·核苷酸序列测定方法 | 第33页 |
| ·序列分析 | 第33页 |
| ·结果 | 第33-45页 |
| ·最适提取温度 | 第34-35页 |
| ·最适反应时间 | 第35-36页 |
| ·最适起始菌体量 | 第36-37页 |
| ·培养条件对基因组 DNA 制备的影响 | 第37-38页 |
| ·微生物细胞裂解过程镜检分析 | 第38-39页 |
| ·基因组 DNA 制备物的凝胶电泳表征 | 第39-40页 |
| ·基因组 DNA 制备物的质量分析 | 第40-42页 |
| ·基因组 DNA 制备物稳定性分析 | 第42页 |
| ·基因组 DNA 快速制备方法适用性 | 第42-44页 |
| ·PCR 产物的质量满足核苷酸序列测定要求 | 第44-45页 |
| ·讨论 | 第45-48页 |
| 第三章 16S rDNA 分子标识在大批量细菌分离物鉴定中的应用 | 第48-63页 |
| ·材料与方法 | 第48-49页 |
| ·微生物菌株 | 第48页 |
| ·细菌基因组 DNA 的快速制备 | 第48页 |
| ·16S rDNA 序列的扩增及核苷酸序列测定 | 第48-49页 |
| ·核苷酸序列分析与细菌分类鉴定标准 | 第49页 |
| ·系统发育树的构建 | 第49页 |
| ·GenBank 中细菌 16S rDNA 序列的收集与分析 | 第49页 |
| ·结果与讨论 | 第49-63页 |
| ·细菌 16S rDNA 的制备效率 | 第49-50页 |
| ·16S rDNA 序列同源性分析可以满足细菌第一轮分类鉴定要求 | 第50-56页 |
| ·16S rDNA 分子标识难以区分的细菌种属 | 第56-57页 |
| ·芽孢杆菌属内菌株 16S rDNA 系统发育分析 | 第57-59页 |
| ·土芽孢杆菌属内菌株 16S rDNA 序列系统发育分析 | 第59-60页 |
| ·GenBank 中 16S rDNA 序列存在不准确性 | 第60-63页 |
| 第四章 运用 ITS 分子标识快速鉴定丝状真菌分离物 | 第63-75页 |
| ·材料与方法 | 第63-64页 |
| ·菌株及培养条件 | 第63页 |
| ·丝状真菌基因组 DNA 的快速制备 | 第63页 |
| ·丝状真菌 ITS 序列的扩增及核苷酸序列测定 | 第63-64页 |
| ·核苷酸序列分析与分类鉴定标准 | 第64页 |
| ·丝状真菌 ITS 序列系统发育树构建 | 第64页 |
| ·核酸序列数据库中丝状真菌 ITS 序列分析 | 第64页 |
| ·结果与讨论 | 第64-75页 |
| ·丝状真菌基因组 DNA 和 ITS 序列的制备效率 | 第64-65页 |
| ·丝状真菌首轮分类鉴定可从其 ITS 序列同源性分析开始 | 第65-68页 |
| ·曲霉属内菌株 ITS 序列系统发育分析 | 第68-70页 |
| ·青霉属内菌株 ITS 序列系统发育分析 | 第70-71页 |
| ·ITS 分子标识无法鉴定的丝状真菌分离物 | 第71-72页 |
| ·GenBank 中丝状真菌 ITS 序列准确性分析 | 第72-75页 |
| 第五章 rDNA 序列特征在酵母分离物鉴定中的适用性 | 第75-85页 |
| ·材料与方法 | 第75-77页 |
| ·菌株与培养条件 | 第75页 |
| ·仪器设备 | 第75-76页 |
| ·酵母基因组 DNA 的快速制备 | 第76页 |
| ·分子标识的扩增及核苷酸序列测定 | 第76页 |
| ·核苷酸序列分析与分类鉴定标准 | 第76页 |
| ·酵母 ITS 序列系统发育树绘制 | 第76-77页 |
| ·酵母菌株形态观察 | 第77页 |
| ·酵母菌株 Biolog 生理生化鉴定 | 第77页 |
| ·结果与讨论 | 第77-85页 |
| ·酵母 ITS 序列同源性分析满足酵母第一轮分类鉴定要求 | 第77-79页 |
| ·ITS 分子标识尚不能有效鉴定的酵母分离物 | 第79-83页 |
| ·两种分子标识对酵母分离物鉴定结果的比较 | 第83-85页 |
| 主要结论 | 第85-86页 |
| 展望 | 第86-87页 |
| 论文创新点 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-101页 |
| 附录 | 第101页 |
