| 中文摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 符号说明 | 第15-16页 |
| 1 绪论 | 第16-24页 |
| ·研究背景 | 第16-17页 |
| ·国内外研究进展 | 第17-22页 |
| ·研究目的意义 | 第22-24页 |
| 2 前列腺癌芯片分析的数据基础 | 第24-28页 |
| ·基因芯片数据 | 第24页 |
| ·蛋白质相互作用数据 | 第24-25页 |
| ·转录调控数据 | 第25-26页 |
| ·生物学通路的数据 | 第26页 |
| ·基因本体论(Gene ontology)的数据 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 3 前列腺癌的芯片分析 | 第28-33页 |
| ·研究内容 | 第28-29页 |
| ·芯片分析原理 | 第28页 |
| ·共表达原理 | 第28-29页 |
| ·芯片分析流程 | 第29-31页 |
| ·芯片预处理 | 第29页 |
| ·计算差异基因 | 第29-31页 |
| ·文本挖掘前列腺癌差异表达基因 | 第31页 |
| ·本章小结 | 第31-33页 |
| 4 前列腺癌调控网络的构建及相关分析 | 第33-42页 |
| ·相关性分析 | 第33页 |
| ·转移性前列腺癌调控网络的构建 | 第33-35页 |
| ·原发性前列腺癌调控网络的构建 | 第35-39页 |
| ·前列腺癌转移性与原发性差异调控网络比较分析 | 第39页 |
| ·差异表达基因调控网络的GO功能富集分析 | 第39-40页 |
| ·差异表达基因调控网络的pathway代谢通路分析 | 第40-41页 |
| ·差异表达基因调控网络的pathway代谢通路的比较分析 | 第41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 5 前列腺癌蛋白质相互作用网络的构建及相关分析 | 第42-47页 |
| ·芯片中蛋白质相互作用基因的共表达系数的计算 | 第42页 |
| ·蛋白质相互作用网络的构建 | 第42-44页 |
| ·蛋白质相互作用网络的功能分析 | 第44-45页 |
| ·本章小结 | 第45-47页 |
| 6 前列腺癌生物学通路分析 | 第47-52页 |
| ·生物学通路的显著性分析 | 第47页 |
| ·生物学通路之间交互作用(crosstalk)网络的构建 | 第47-48页 |
| ·生物学通路之间交互作用(crosstalk)网络的GO功能注释分析 | 第48-50页 |
| ·本章小结 | 第50-52页 |
| 7 结论 | 第52-53页 |
| 附图 | 第53-61页 |
| 附表 | 第61-74页 |
| 参考文献 | 第74-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 外文文章一 | 第90-108页 |
| 外文文章二 | 第108-132页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第132页 |
