| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-8页 |
| 第一章 背景介绍 | 第8-19页 |
| ·miRNA的发现与命名 | 第8-9页 |
| ·miRNA的功能 | 第9-16页 |
| ·miRNA的成熟机制 | 第9-12页 |
| ·pri-miRNA与Drosha酶的相互作用 | 第12-14页 |
| ·pre-miRNA与Dicer酶相互作用 | 第14-16页 |
| ·解旋酶作用于microRNA双螺旋结构 | 第16页 |
| ·RNA结构预测方法 | 第16-17页 |
| ·miRNA的发现方法 | 第17页 |
| ·本文工作 | 第17-19页 |
| 第二章 相关算法 | 第19-22页 |
| ·microRNA二级结构预测 | 第19-21页 |
| ·结构的定义 | 第19页 |
| ·microRNA二级结构预测 | 第19-21页 |
| ·随机森林算法 | 第21-22页 |
| 第三章 Drosha剪切位点的预测 | 第22-29页 |
| ·数据来源及编程语言 | 第22页 |
| ·Drosha位点预测方法 | 第22-26页 |
| ·"能量面"的定义及能量标注 | 第23-25页 |
| ·Drosha位点预测方法的实现 | 第25-26页 |
| ·预测精度讨论及比较 | 第26-29页 |
| ·预测精度 | 第27页 |
| ·鸭嘴兽(O.anatinus)microRNA预测准确度 | 第27页 |
| ·与"Microprocessor SVM"比较 | 第27-29页 |
| 第四章 Dicer剪切位点的预测 | 第29-32页 |
| ·预测方法的实现 | 第29-31页 |
| ·预测精度 | 第31-32页 |
| 第五章 MiRmat:一种microRNA成熟体预测方法 | 第32-36页 |
| ·MiRmat的实现 | 第32-34页 |
| ·MiRmat预测准确度分析 | 第34-36页 |
| 第六章 MiRmat应用于Solexa结果分析 | 第36-38页 |
| 第七章 总结与讨论 | 第38-40页 |
| 参考文献 | 第40-43页 |
| 读研期间发表的文章 | 第43-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |