| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-26页 |
| ·珠三角地区对虾养殖水体污染及其防治现状 | 第13-14页 |
| ·珠三角地区对虾养殖水体污染现状 | 第13-14页 |
| ·珠三角地区对虾养殖水体污染防治现状 | 第14页 |
| ·氮素循环途径及其微生物研究进展 | 第14-18页 |
| ·微生物介导的氮素循环途径研究进展 | 第14-15页 |
| ·参与氮素循环的主要微生物及其功能基因 | 第15-18页 |
| ·氨氧化微生物及其功能基因 | 第16页 |
| ·硝化细菌及其功能基因 | 第16-17页 |
| ·反硝化菌及其功能基因 | 第17-18页 |
| ·固氮菌与氨化菌 | 第18页 |
| ·微生物分子生态学的研究方法与技术进展 | 第18-21页 |
| ·16S rRNA基因克隆文库 | 第19页 |
| ·PCR-DGGE指纹图谱技术 | 第19-21页 |
| ·PCR-DGGE技术的基本原理 | 第19-21页 |
| ·PCR-DGGE技术在养殖水体研究中的应用 | 第21页 |
| ·稳定性同位素探测技术的原理及应用 | 第21-24页 |
| ·SIP的基本原理 | 第22-23页 |
| ·核酸-SIP | 第23页 |
| ·~(15)-SIP在氮素循环中的应用进展 | 第23-24页 |
| ·本研究的目的和内容 | 第24-26页 |
| ·研究意义和目的 | 第24页 |
| ·研究内容 | 第24-26页 |
| 第二章 ~(15)-SIP技术平台的建立及初步应用 | 第26-46页 |
| ·引言 | 第26页 |
| ·材料与方法 | 第26-34页 |
| ·纯培养菌株的SIP标记 | 第26-27页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第27-28页 |
| ·环境样品采集与预处理 | 第28页 |
| ·微宇宙的建立与~(15)-SIP标记 | 第28-29页 |
| ·总DNA提取 | 第29页 |
| ·总DNA的氯化铯-溴化乙锭密度梯度超高速离心 | 第29-30页 |
| ·三种氮素迁移酶基因的PCR扩增 | 第30-32页 |
| ·三种氮素迁移酶基因随时间变化的DGGE分析 | 第32-34页 |
| ·试剂及配制 | 第32页 |
| ·实验步骤 | 第32-33页 |
| ·显著条带回收测序与图谱分析 | 第33-34页 |
| ·结果与讨论 | 第34-44页 |
| ·SIP实验与氮素迁移特征 | 第34-35页 |
| ·E.coli与水样DNA提取 | 第35页 |
| ·氯化铯-溴化乙锭超高速密度梯度离心 | 第35-37页 |
| ·三种氮素迁移酶基因的PCR扩增结果 | 第37-38页 |
| ·三种典型氮素迁移酶基因的DGGE结果 | 第38-44页 |
| ·氨氧化细菌amoA基因的DGGE图谱分析 | 第38-40页 |
| ·硝化细菌nxrA基因的DGGE图谱分析 | 第40-42页 |
| ·反硝化菌nirS基因的DGGE图谱分析 | 第42-44页 |
| ·本章小结 | 第44-46页 |
| 第三章 基于~~(15)H4+-SIP的微生物群落结构分析 | 第46-58页 |
| ·引言 | 第46页 |
| ·材料与方法 | 第46-52页 |
| ·样品DNA与培养基 | 第46-47页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第47页 |
| ·基于~(15)H_4~+-SIP的细菌和古菌 16S rRNA基因的PCR扩增 | 第47-48页 |
| ·~(15)H_4~+-SIP细菌和古菌克隆文库的构建 | 第48-50页 |
| ·PCR产物的回收纯化 | 第48-49页 |
| ·目的片段的质粒连接 | 第49页 |
| ·E.coli DH5α感受态细胞的制备 | 第49-50页 |
| ·质粒的化学转化与增殖培养 | 第50页 |
| ·限制性长度多态性分析（RFLP） | 第50-51页 |
| ·基因序列进化树分析 | 第51-52页 |
| ·结果与讨论 | 第52-57页 |
| ·基于~(15)H4+-SIP的细菌和古菌 16S rRNA基因的PCR扩增 | 第52页 |
| ·~(15)H_4~+-SIP细菌和古菌克隆文库的构建与RFLP分析 | 第52-54页 |
| ·~(15)H_4~+-SIP克隆文库基因序列的系统发育树分析 | 第54-57页 |
| ·本章小结 | 第57-58页 |
| 第四章 基于~(15)O_2--SIP的微生物群落结构分析 | 第58-70页 |
| ·引言 | 第58页 |
| ·材料与方法 | 第58-59页 |
| ·样品DNA与培养基 | 第58页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第58页 |
| ·基于~(15)O_2--SIP的细菌和古菌 16S rRNA基因的PCR扩增 | 第58-59页 |
| ·~(15)O_2--SIP细菌和古菌克隆文库的构建与阳性克隆的筛选 | 第59页 |
| ·RFLP分析、基因序列测定与进化树分析 | 第59页 |
| ·结果与讨论 | 第59-68页 |
| ·基于~(15)O_2--SIP的细菌和古菌 16S rRNA基因的PCR扩增 | 第59-60页 |
| ·~(15)O_2--SIP克隆文库的构建与RFLP分析 | 第60-62页 |
| ·~(15)O_2--SIP克隆文库基因序列的系统发育树分析 | 第62-65页 |
| ·基于~(15)-SIP克隆文库的氮素循环微生物多样性分析 | 第65-68页 |
| ·珠三角养殖水体中氮素循环微生物多样性分析 | 第65页 |
| ·~(15)-SIP不同标记方法在氮素循环微生物多样性研究中的利弊 | 第65-66页 |
| ·基于~(15)-SIP克隆文库的氮素循环微生物群落结构与功能分析 | 第66-68页 |
| ·本章小结 | 第68-70页 |
| 结论和展望 | 第70-73页 |
| 创新点 | 第70页 |
| 结论 | 第70-71页 |
| 展望 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-81页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 附件 | 第83页 |
